イルミナがEdico GenomeとそのDRAGENテクノロジーを買収してから2年が経ちました。DRAGENのおかげで、シーケンスデータの取得と解析をプッシュボタン方式の合理化されたプロセスに減らすという当社のビジョンが、現在も起こっているのを見るのはとても嬉しいことです。先週の金曜日、私たちは第2回エディコ・バーサリーを祝いました。そこで、当社の成長について振り返り、研究者が新しい質問をして、ポートフォリオを拡大してより貴重なデータを収集できるようにする方法を共有したいと思います。
現時点で、DRAGENはイルミナのシーケンサー、ライブラリー調製キット、および包括的なソフトウェアスイートと完全に統合されているため、研究者はワークフローの実装と拡張を簡単に行うことができます。ブロード社とのコラボレーションにより、ショートリードバリアントコール用の統合DRAGEN-GATKパイプラインを開発し、コミュニティがこれにアクセスできるようにします。また、DRAGENは集団規模の需要を満たすことができ、最大50X速度改善で超高速集団スケールコホート解析をリリースしました。重要なのは、DRAGENはイルミナの製品開発のコアコンポーネントとなり、イルミナのアップストリームソフトウェアとライブラリー調製キットとの組み合わせに最適化された新しい機能やパイプラインに転換することです。また、BaseSpace Sequence HubにDRAGEN Pipelinesのフルスイートを統合し、研究者はDRAGENを介してプッシュボタン解析用のデータをクラウドに低コストでシームレスにストリームできます。DRAGENをアクセシブルにすることで、このプラットフォームは急速に導入され、今年これまでに100,000を超える全ゲノム当量が処理されています。
過去2年間で最もエキサイティングな進歩の1つは、新しいNextSeq 2000システムへのDRAGENの統合であり、効率的で正確な解析を可能にし、現在はシーケンスと一体になっています。しかし、これは私たちが立ち止まっていたり、速度を落としているという意味ではありません。イノベーターとして、私たちの仕事は続きます。当社の開発チームは、24時間体制で(そして最近では主に自宅から)作業を続け、お客様にさらに合理化され統合されたサンプルから回答までの体験を提供しています。
最後に、コロナウイルスのパンデミックが世界を席巻したとき、ウイルスと戦うために、どのように現場に最善を尽くすことができるか、厳しく、迅速に検討しました。簡単に言えば、次世代シーケンス(NGS)を使用してウイルスを扱う人々のためのデータ解析ツールとワークフロー機能の新しいセットであるイルミナSARS-CoV-2データツールキットを開発し、リリースすることができ、世界中の研究コミュニティに無料で提供できるようになりました。重要なのは、このツールキットはDRAGENのスピードと精度を活用して、感染症サーベイランスと感染拡大への対応を加速させています。これには、新しいDRAGEN RNA病原体検出パイプラインや感染拡大サーベイランスのためのDRAGENメタゲノムパイプラインが含まれます。
DRAGENの成長と発展に貢献したチーム全体、お客様、パートナー、協力者に感謝したいと思います。イルミナのDRAGENに入社して2年ぶりの素晴らしい年となりました。しかし、私たちが成し遂げたすべてのことを振り返るのが好きなのと同じくらい、未来の姿も気に入っています。DRAGENの進捗状況とパイプラインの詳細については、ニュースセンターをご覧ください。