複雑な疾患ゲノム

Massimoのミッションについて

全ゲノムシーケンスでハイヤースタックの針を見つける

Massimoのミッションについて
2015年2月26日

これはロレンツォのオイルパート2のようなものであると言う人もいます。同じ呼吸で比較すると、それは私の意図ではなかったため、信じられないほど謙虚です。息子を診断したかっただけです。6年前、Stephen Damianiの赤ちゃんの息子Massimoは謎の病気に苦しみ始めました。スティーブンは、妻のサリーと息子のゲノムを一致させることで、マッシモ病の原因となるユニークな遺伝的変異を見つけることができるという揺るぎない信念を持っていました。

Massimoは初年度に、健康な赤ちゃんの典型的なマイルストーンをすべて達成しました。彼は転がり始め、予定された時間に這い始めました。彼は繁栄し、幸福でしたが、2009年7月の1歳の誕生日の前日に、何かがおかしいという不安な兆候を示しました。彼は立ち上がるのに苦労し、床に座っているとバランスを失いました。

一連の診断検査により、脳の神経線維周囲のミエリンの形成に影響を及ぼす生命を脅かす疾患群である白質ジストロフィーと呼ばれる神経疾患と一致する脳と脊椎の異常が特定されました。この疾患には約40の既知のバリアントがありますが、残念なことに、白質ジストロフィーの50%は遺伝的に未分類のままであり、治療の希望はほとんどなく、将来は不明で、悲劇的な結果はほとんどありません。472日間にわたる包括的で侵襲的な検査の後、Massimoはこの恐ろしいカテゴリーに分類されました。

スティーブンと妻のサリーは、Massimoのゲノムシーケンスを行い、最終的には比較のために自分のゲノムシーケンスを行うというオプションを追求しました。当時、これは小さな偉業ではなく、臨床診断のためにシーケンスされた最初の家族性ゲノムトリオでした。しかし、シーケンスは最大の課題ではありませんでした。膨大な量のデータを解析し、理解する意欲のある人を見つけたのです。クイーンズランド大学の遺伝子サイエンティストであるRyan Taft博士と出会う機会は、この新しいフロンティアの科学にアクセスする上で重要なリンクであることが証明されました。

2011年の秋に数か月にわたる解析の結果、RyanはDARS遺伝子のバリエーションを発見しました。DARS遺伝子はこれまでヒトの疾患と関連付けられていなかったが、RyanはMassimo病の原因であると考えていた。調査結果は当初、沈黙で満たされ、不便な真実を提起しました。

n = 1

サンプルには子供が1人しかいませんでした。Massimo病の原因遺伝子が最終的に見つかったことを証明するために、彼らは1つ以上の他の研究で裏付けとなる結果を示す必要がありました。  彼らは別のMassimoを見つける必要がありました。

2009年、MassimoはワシントンDCのChildren’s National Medical CenterでAdeline Vanderver博士が設立した研究プロジェクトであるMyelin Disorders Bioregistry Projectに登録されました。オランダの同僚とともに、彼女はバイオレジストリーを検索し、Massimoに似た、この発見を検証できる可能性のある他の子供を探しました。

DNA検体はシーケンスと解析のためにRyanに送られました。2012年9月初旬、6名中2名の患者がDARS遺伝子に変異があることが確認され、初期所見を検証しました。新たな疾患が発見され、脳幹と脊髄の障害と下肢痙縮(HBSL)を伴う低髄質症と命名されました。

1つの答えが、誰よりも多くの人に期待されています

Massimoと彼の家族のシーケンスから2年以内に、Ryanと医学と遺伝学の専門家のグローバルチームは、Massimoだけでなく、他の子供たちにも人生を変える変化をもたらすことに成功しました。

かなり短い順序で、チームは以前に診断されていないいくつかの疾患と診断し、その一部は全く新しい疾患でした。Ryanによると、病気の子供を一人救うことから多くの子供を救うことへと進み、新たに疾患が発見されました。これまで誰も特定できなかったその他の疾患、つまり新しい疾患遺伝子。本当にうまくいっているようで、これらの家族の多くにとって初めて答えを見つけようとしています。

チームは、すでに診断検査を受けていた子供たちという最も困難な課題に取り組みました。ウェブインターフェースを構築し、計算アルゴリズムのパイプラインを構築することで、データを簡単に見ることができ、世界中の臨床医とリアルタイムで情報を共有することができました。

Ryanは、コミュニティ全体を必要としたと言います。他にも、メルボルンのRoyal Children’s Hospitalの臨床医、アムステルダムのVU University Medical Centerの臨床医、グラスゴー大学がん科学研究所の医学ゲノミクス委員長のSean Grimmond氏などが関与しました。最終的には、Baylor College of MedicineおよびThe Hospital for Sick Children, Montrealと他の関係が築かれました。

Ryanは、Massimoが大規模なチームの取り組みを行った後に起こるすべてのことを知っています。彼について話しているのは私かもしれませんが、仕事を可能にしてくれた人が50~70人います。

真実の瞬間(複数可)

StephenとRyanは、2012年にMassimoの診断を検証した2人の少女たちと出会い、ロサンゼルス小児病院で話して、どのように診断を達成したかについて話しました。すぐに明らかになったのは、この疾患の幅広いスペクトルでした。

プレゼンテーションの最後に、StephenはオーストラリアにSkypeコールを行い、Massimoの神経内科医を紹介しました。Rick Leventer博士は当初、Stephenに質問をし、Stephenは次のように答えました。カメラを揺らして挨拶をした女の子の一人に変えました。“Massimoと比較した場合の開発の違いに驚いたと言ってもいいでしょう”とStephen氏は述べています。

乳児期には、2人の女児は当初、急性播種性脳脊髄炎(ADEM)と呼ばれる疾患と誤診され、毎月、高用量の静脈内コルチコステロイドのパルスプロトコールを受けていました。医師らは、女児がステロイド治療を受けた後、安定化するだけでなく、常に改善の時期が来たと説明しました。

おそらく、このステロイドの早期介入により、女児は神経系形成の重要な段階でより多くのミエリンを発症することができたため、Massimoに対するプレゼンテーションが大きく異なっていた可能性もあるとStephen氏は示唆しています。

Massimoは、この実験パルスプロトコールの12か月の試験を開始しました。Massimoの医療チームは、治療の過程で、行動と身体に有意かつ持続的な改善が見られました。彼ははるかにイライラしにくく、より熱心で、受容的コミュニケーションと表現的コミュニケーションの両方を試みました。彼の微細運動能力は改善し、下肢の痙縮は劇的に減少しました。ふくらはぎとハムストリングスをリラックスさせる注射の間隔は、2カ月から6カ月に延びました。しかし、観察結果は主観的なままでした。

2014年10月、MassimoはフォローアップMRIスキャンを受けました。疾患の進行が止まっただけでなく、脳の2つの領域が改善を示しました。さらに、彼は立ち上がっています。そして、この秋、彼は最初の言葉、つまり"母と言いました。"

次のステップ

マッシモ病患者22名を発見し、5つの新しい疾患を特定した後、ライアンとチームにとって次にすべきことは何ですか? この取り組みの途中で、ライアンは学界を離れ、イルミナと当社のクリニカルサービスチームに加わりました。

私が学界から業界へと飛躍した理由は、テクノロジーを全世界で活用するには大きな課題があるからです。このテクノロジーをできるだけ迅速に臨床に導入するには、道徳的な義務があると考えています。シーケンスしているゲノムの品質が可能な限り正確であることを保証するために、できる限りのことをしなければなりません。いわゆるバリアントから、患者や臨床医がデータを見るためのデリバリーメカニズム、そしてコスト削減までです。

Ryan氏は、全ゲノムシーケンスが第一選択スクリーニング検査であった場合、これらの子供の多くが誤診されなかった可能性があると指摘しています。

“私たちは、医療全ゲノムシーケンスに関してイルミナが確実にクラス最高の存在となり、世界が望むことのパラダイムとして働くことができるよう、真剣に努力しています。”