TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero疫学
TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero疫学
疫学サンプルからトランスクリプトームライブラリーを調製するには、Ribo-Zero rRNA Removal Epidemiology KitsをTruSeq鎖mRNAキットと組み合わせて使用することが推奨されます。このキットは、ヒト/マウス/ラット、グラム陽性およびグラム陰性細菌RNAから構成されるサンプルから細胞質およびミトコンドリアrRNAを除去します。
出発物質：1～5ugのトータルRNAでRiboZeroを開始し、10～100ngのRiboZero産物をTruSeqプロトコールに取り込みます（ユーザーガイドの"PurifyおよびFragment mRNA"セクションの2番目の注記を参照）。
LT HT
詳細についてはデバイスを回転させてください
| * ライブラリー調製はすべてのイルミナ装置に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。 † RNAプロファイリングではサンプルあたり20Mリード、トランスクリプトーム解析ではサンプルあたり50Mリードに基づきます。FFPEサンプルまたは分解サンプルには2倍のリード数を使用します。 |
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| プロジェクトの推奨事項 | ||||
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| 種の 互換性 | ヒト、マウス、バクテリアを有するラット MatchMaker のツールで他の種との互換性をテスト |
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| 推奨イルミナ装置* | NextSeq 500 | HiSeq 2500（デュアルフローセル） | ||
| ランごとの推奨サンプル† | RNAプロファイリング：6～20歳 トランスクリプトーム解析：2～8 |
RNAプロファイリング：30～200 トランスクリプトーム解析：12～80歳 |
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| ランモード | 中出力 | 高出力 | ラピッドラン | 高出力 |
| 最大推奨リード長 | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp |
| 推奨される二次解析 |
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| 推奨されるダウンストリーム解析 |
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