TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero H/M/R
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero H/M/R
これらのキットオプションにはRibo-Zero H/M/Rがあり、細胞質リボソームRNAのサンプルを枯渇させ、転写産物の孤立性を維持します。鎖情報は、アンチセンス転写の検出、転写アノテーション、およびアライメント効率の向上に役立ちます。このキットは、ヒト、マウス、およびラットのサンプルで明示的にテストされています。その他の種については、 RNA MatchMakerツールを使用してRibo-Zeroとの互換性 をin silicoでテストします。
LT HT
詳細についてはデバイスを回転させてください
| 種の互換性 | ヒト、マウス、ラット MatchMakerの他の種との互換性をテストする |
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| 推奨イルミナ装置 | NextSeq 500 | HiSeq 2500（デュアルフローセル） | NovaSeq 6000（デュアルフローセル）† | ||||
| ランごとの推奨サンプル（RNAプロファイリング/トランスクリプトーム解析）‡ | 6～20 / 2～8 | 30～200 / 12～80 | 160 / 64 | 320 / 128 | 768 / 400 | ||
| ランモード | 中出力 | 高出力 | ラピッドラン | 高出力 | S1§ | S2 | S4 |
| 最大推奨リード長 | 2×75 bp | 2×75 bp | 2×75 bp | 2×75 bp | ≤ 2×100 bp | ||
| 推奨される二次解析 |
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| 推奨されるダウンストリーム解析 |
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* ライブラリー調製は、すべてのイルミナ装置に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。
† インデックスの組み合わせ（HT）によって制限されます。20M/50Mリードに基づく。
‡ RNAプロファイリングではサンプルあたり20Mリード、トランスクリプトーム解析ではサンプルあたり50Mリードに基づきます。FFPEサンプルまたは分解サンプルには2倍のリード数を使用します。
§ NovaSeq S1 Reagent Kitは現在利用できません。