TruSight RNA汎がんパネル
TruSight RNA汎がんパネル
TruSight RNA Pan-Cancer Panelは、がんサンプルにおける遺伝子融合、バリアント、遺伝子発現の変化を包括的に検出し、研究者が機能的に重要な変化を的確に把握できるようにします。このパネルはFFPE組織と互換性があり、わずか10 ngの新鮮凍結トータルRNAインプットまたは20 ngのFFPE RNAインプットに対応しています。TruSight RNA腫瘍横断型パネルは、がんにおける発現ダイナミックスと機能メカニズムの研究において高感度で再現可能かつ経済的なソリューションを提供します。
出発物質：
プロトコールは、10～100 ngのヒトトータルRNA用に最適化されています。
- 量が少ないと、収率が低くなり、感度が低下する可能性があります。
- このプロトコールは、10 ngの高品質ユニバーサルヒトリファレンストータルRNAをインプットとして用いて試験されています。
- 他の組織からのRNAまたは質の低いRNAを使用する場合、インプット量を決定するためにさらなる最適化が必要になる場合があります。
| 品質 | DV200 | 反応ごとの入力要件 |
|---|---|---|
| 高い | > 70% | 20 ng |
| 中程度 | 50～70% | 20～50 ng |
| 低い | 30～50% | 50～100 ng |
| 劣化しすぎている | < 30% | 推奨されない |
詳細についてはデバイスを回転させてください
| 種の互換性 | ヒト | |||
|---|---|---|---|---|
| 推奨イルミナ装置* | MiniSeq | MiSeqシステム | ||
| ランごとの推奨サンプル† | 2～3 | 8 | 8（v3ケミストリー） | |
| 最大推奨リード長 | 2×75 bp | 2×75 bp | 2×75 bp | |
| 推奨される二次解析 | RNA-seq（FASTQ） | RNA-seq（FASTQ） | ||
| 推奨されるダウンストリーム解析 | BaseSpace RNA-Seq Alignmentアプリ | BaseSpace RNA-Seq Alignmentアプリ | ||
*ライブラリー調製は、すべてのイルミナ機器に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。
† サンプルあたりの3Mリードに基づく。
製品および注文情報
- TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A（48サンプル）：RS-303-1002
- TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B（48サンプル）：RS-303-1003