TruSight腫瘍 26

TruSight腫瘍 26

TruSight Tumorシーケンスパネルは、肺、結腸、黒色腫、胃、卵巣などの固形腫瘍のバリエーションをより深く捉えます。このキットは、26の遺伝子にわたる低頻度の変異を同定し、体細胞変異をより包括的に把握することを可能にします。FFPEサンプルの検出の下限は、サンプルごとに2つのライブラリーを作成することで得られます。1つは順鎖用、もう1つは逆鎖用です。イルミナは、MiSeq v2ランごとに4サンプル(8ライブラリー)をランし、アンプリコンあたり1000xの最小カバレッジを得ることを推奨します。

TruSight腫瘍遺伝子リスト

AKT1 ALK
FGFR2
APC
FOXL2
BRAF
GNAQ
CDH1 CTNNB1 EGFR ERBB2 FBXW7 GNASキット
PTEN
クラス
SMAD4
MAP2K1
SRC
MET MSH6 NRAS PDGFRA PIK3CA STK11 TP53

詳細についてはデバイスを回転させてください

* ライブラリー調製はすべてのイルミナ装置に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。
アンプリコンあたり>1,000xに基づく。
プロジェクトの推奨事項
種の 互換性 ヒト
推奨イルミナ装置* MiniSeq MiSeqシステム
ランごとの推奨サンプル 2 6 4(v2ケミストリー)
ランモード 中出力 高出力 -
最大推奨リード長 最大2x121 bp 最大2x121 bp 最大2x121 bp
推奨される二次解析
  • Local Run ManagerアンプリコンDS
  • BaseSpaceアンプリコンDS
  • MiSeq Reporter AmpliconDSワークフロー
推奨されるダウンストリーム解析 VariantStudio