TruSight Tumorシーケンスパネルは、肺、結腸、黒色腫、胃、卵巣などの固形腫瘍のバリエーションをより深く捉えます。このキットは、26の遺伝子にわたる低頻度の変異を同定し、体細胞変異をより包括的に把握することを可能にします。FFPEサンプルの検出の下限は、サンプルごとに2つのライブラリーを作成することで得られます。1つは順鎖用、もう1つは逆鎖用です。イルミナは、MiSeq v2ランごとに4サンプル(8ライブラリー)をランし、アンプリコンあたり1000xの最小カバレッジを得ることを推奨します。
TruSight腫瘍遺伝子リスト
AKT1 ALK詳細についてはデバイスを回転させてください

| * ライブラリー調製はすべてのイルミナ装置に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。 † アンプリコンあたり>1,000xに基づく。 |
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| プロジェクトの推奨事項 | |||||||
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| 種の 互換性 | ヒト | ||||||
| 推奨イルミナ装置* | MiniSeq | MiSeqシステム | |||||
| ランごとの推奨サンプル† | 2 | 6 | 4(v2ケミストリー) | ||||
| ランモード | 中出力 | 高出力 | - | ||||
| 最大推奨リード長 | 最大2x121 bp | 最大2x121 bp | 最大2x121 bp | ||||
| 推奨される二次解析 |
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| 推奨されるダウンストリーム解析 | VariantStudio | ||||||