イルミナは、TruSight HLA v2シーケンスパネルおよびTruSight HLA Assignソフトウェアの販売とサポートに関してCareDxとパートナーシップを結んでいます。TruSight HLAのご注文およびテクニカルサポートについては、CareDx TruSight HLAウェブページをご覧ください。
TruSight HLA v2シーケンスパネルは、臨床研究において1回のアッセイでHLA領域を簡単かつ迅速に評価できるカバレッジの広い超高解像度ヒト白血球抗原(HLA)タイピングソリューションです。特長:
TruSight HLA v2は、一般的にタイピングされるすべてのHLA遺伝子座に加え、新たに関連性が確認された遺伝子座もカバーしています。このパネルでは、クラスIのHLA-A、B、およびC、クラスIIのHLA-DRB1/3/4/5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DPA1、およびHLA-DPB1のシーケンスが可能です。遺伝子の完全長カバレッジにより従来の遺伝子座以外までカバレッジが拡張するため、新たなプライマーのデザインは不要で新しいアリルを検出することができます。
この包括的なソリューションには、HAL解析用に最適化された試薬およびソフトウェアが入っています。簡略化されたワークフローによりターンアラウンド時間は48時間未満となり、4.5時間未満の操作時間で効率が高まります。内蔵ソフトウェアがシーケンスデータを解析します。TruSight HLA Assignソフトウェアでは、解析後の結果レポート作成に柔軟なオプションが得られます。
TruSight HLA v2の拡大したカバレッジにより高解像度が達成されるため、確実なタイピング結果を得るための追加検査は不要になります。全HLA遺伝子座はこちら.
TruSight HLA v2は、ロングレンジPCRでHLA遺伝子座を増幅します。増幅後、NexteraタグメンテーションによりDNAが断片化され、シーケンスタグが残されます。次に、追加PCRによりシーケンスアダプターとインデックスプライマーが付加されて、シーケンス用のDNAライブラリーが作成されます。調製したライブラリーは次にMiniSeq、MiSeq、またはNextSeqシステムに直接ロードしてシーケンスします。
Assign 2.0 TruSight HLA解析ソフトウェアは、ヒト白血球抗原(HLA)タイプの決定をサポートします。このソフトウェアは、イルミナTruSight HLAシーケンスパネルを用いて調製された後、イルミナシーケンサーでシーケンスされたライブラリーからのデータを解析するためのものです。Assign 2.0を使って、シーケンスデータのインポート、ベースコーリング、シーケンスの編集、およびサンプルのコンセンサス配列とIMGT/HLAアリルデータベースとの比較を実施することができます。
Loci | Target Sequence |
---|---|
HLA-A | 4.1 kb (entire gene) |
HLA-B | 2.8 kb (exon 1 - intron 6) |
HLA-C | 4.2 kb (entire gene) |
HLA-DRB1/3/4/5 | 4.6 - 5.1 kb (exon 2 - intron 4) |
HLA-DQB1 | 6.9 kb (entire gene) |
HLA-DPB1 | 9.7 kb (exon 2-3' UTR) |
HLA-DQA1 | 7.3 kb (entire gene) |
HLA-DPA1 | 10.3 kb (entire gene) |
HLA Sequencing of IHWG Reference Samples with TruSight® HLA v2 Sequencing Panel
White Paper | PDF < 1 MB
HLA Sequencing of IHWG Reference Samples – Supplementary Tables
White Paper | EXCEL < 1 MB
Sequencing TruSight HLA v2 Libraries on a MiniSeq System Quick Reference Guide Documentation
TruSight HLA v2 Sequencing Panel Reference Guide Documentation
TruSight HLA v2 Sequencing Panel Checklist Documentation
Using a PhiX Control for TruSight HLA v2 Sequencing Runs Quick Reference Guide Documentation
カスタムプロトコルセレクタ
Generates customized, end-to-end instructions
精度と効率を向上し、コストを削減するために最適化されたTruSight HLA v2シーケンスパネルの発売に伴い、TruSight HLA v1シーケンスパネルの販売は終了いたしました。イルミナは、この製品の移行期間中もお客様に高品質のサポートとサービスをご提供するために尽力し続けます。