2015年6月10日
イルミナのYouTubeチャンネルに関する最近のSciMonビデオでは、University College LondonのGemma L. Kay氏らによる論文がハイライトされています。この論文では、Nature Communicationsに最近登場した“18世紀のゲノムは、ヨーロッパで結核がピークに達した時点で混合感染が一般的であったことを示しています”と題されています。
結核（TB）は、何世紀にもわたって人類を苦しめてきた一般的な感染症の1つです。かつてはヨーロッパで主要なキラーであったが、いつ結核がヨーロッパでピークの有病率に達したか、また現在の結核とどのように異なるかは不明である。
Kayらは、ハンガリーのドミニカ教会から採掘された18世紀のミイラ化ヒトの遺体から得られたTBシーケンスを研究しました。8人中5人が複数のTB株と感染症を共有していたことがわかりました。驚くべきことに、これらの個人は14の異なる結核株を保有していました。さらに、異なるTB株が身体の異なる部位に見られ、空間的な不均一性を示しました。これは、体内の各種のさまざまな濃度の不均一な分布を示しています。
これらの結核株は系統4に似た特性を示しており、現在ヨーロッパと南北アメリカで年間100万件を超える症例を占めています。4系統の最も一般的な最近の祖先は、鉄期とローマ時代の範囲に及びます。
従来の方法と比較して、ディープシーケンスでは、古代の結核感染の同定だけでなく、現在の結核感染の複数菌株の検出も可能です。シーケンスは、将来の感染拡大時の検出と制御に役立つ可能性があります。
