ゲノムカバレッジと多様性の最大化

メイトペアシーケンスにより、de novoアセンブリ、ゲノム仕上げ、その他のアプリケーションを強化

メイトペアシーケンス

メイトペアシーケンスでは、以下のような多くのシーケンスアプリケーションに有用なロングインサートペアエンドDNAライブラリーを生成します。

  • De novoシーケンス
  • ゲノム仕上げ
  • 構造バリアント検出
  • 複雑なゲノム再構成の同定

メイトペアライブラリーシーケンスから生成されたデータとショートインサートペアエンドリードから生成されたデータを組み合わせることで、ゲノム全体のシーケンスカバレッジを最大化するためのリード長の強力な組み合わせが得られます。

メイトペアシーケンス

DNA断片化の後、DNA断片は標識dNTPで最終修復されます。DNA断片は環状化され、非環状化DNAは消化によって除去されます。円形DNAは断片化され、標識された断片(結合した元のDNAの末端に対応)はアフィニティー精製されます。精製された断片は末端修復され、イルミナのペアエンドシーケンスアダプターにライゲーションされます。

フローセルオリゴヌクレオチドに相補的な追加の配列が、テールPCRプライマーを用いてアダプター配列に追加されます。最終的に調製されたライブラリーは、元々数キロベースで分離されていた2つのDNAセグメントで構成される短い断片で構成されています。これらのライブラリーは、ペアエンドクラスター形成、続いてイルミナ次世代シーケンス(NGS)システムを使用したシーケンスの準備が整いました。

NovaSeq 6000システムの詳細

ほぼすべてのゲノム、シーケンス手法、およびプロジェクト規模に対応した拡張性のあるスループットと柔軟性。

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NovaSeqシステム
高いゲノム多様性

効率的なプロトコールにより、あらゆる次世代プラットフォームの中で最高のゲノム多様性を実現します。

ユーザーフレンドリーなワークフロー

ハンズオンタイムが限定され、複数の停止ポイントがあるシンプルなワークフロー。

低DNAインプット要件

わずか1 μgの出発物質が必要です。

Kiwiゲノムアセンブリのメイトペアシーケンス

研究者が、キウイ鳥ゲノムのde novoアセンブリにメイトペアシーケンスをどのように使用したかをご覧ください。

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