2017年9月12日
Advanced Analytical Technologies, Inc. （AATI）とイルミナは先日、イルミナの次世代シーケンス（NGS）ワークフローにおける核酸の品質管理（QC）解析のためのAATIのFragment AnalyzerとAutomated CEシステムが関与するコラボレーションと共同マーケティング活動をサポートする契約を締結しました。Fragment Analyzerは、DNAとRNAの同時クオリフィケーションと定量化によりNGSライブラリー調製を加速します。AATIのシステムは、ゲノムDNA、RNA、セルフリー液体生検、シングルセル分離株、シーケンス前の調製済みライブラリーなど、イルミナのNGSライブラリー調製ワークフローにおける幅広い種類のサンプルを正確に解析するためにイルミナがテストしたスケーラブルなメソッドを提供します。
NGSアプリケーションの成功には核酸の品質評価が不可欠です。分解、断片化、または低純度によりシーケンス性能が低下する最適ではないライブラリーを生成する可能性のあるDNAおよびRNAサンプルの同定は、ライブラリー調製前にサンプルの完全性を検証することで達成できます。同様に、調製されたDNAライブラリーの正確な品質と量解析は、シーケンス中のクラスター生成を最適化するために使用でき、シーケンスデータの品質と出力の両方を最大化しながら、コストと時間の節約につながります。
Fragment Analyzerシステムは、核酸分離株と調製済みライブラリーの解析を合理化する新しいオプションをお客様に提供しています。特にNGSサンプル数が増加し、マルチプレックス技術が当社の大容量NGSプラットフォームによって強化される中で、AATIと協力して堅牢なQCソリューションを提供することを楽しみにしています。
シングルセルゲノミクスのダイナミックフィールドは、NGSサンプル数の拡大を促進する1つの力です。 Steve Quake博士は、スタンフォード大学のバイオエンジニアリングおよび応用物理学の教授であり、Chan Zuckerberg（CZ）Biohubの共同社長であり、AATIのFragment Analyzerテクノロジーの早期採用者です。 Quakeのチームは、逆転写された単一細胞トランスクリプトームのハイスループット解析と、シーケンス前のプールされたイルミナNextera®ライブラリーのロースループット解析にFragment Analyzerを使用しています。 Norma Neff博士は、スタンフォード大学のQuake博士とともにAATIシステムを実装し、その後、CZ Biohubにゲノムディレクターとして入社しました。“The Fragment Analyzers is essential tools for our single-cell RNA-Seq pipeline”とNeff博士は述べています。 高感度の定性的解析と正確な定量データにより、Nexteraライブラリー構築前の細胞インプットの正確なノーマライゼーションが可能になります。 完成したライブラリーのFragment Analyzer QCにより、すべてのイルミナシーケンスプラットフォームが最適なデータを高い効率で生成できます。
イルミナは、全ゲノム、エクソーム、RNA発現、メチル化、アンプリコン、ターゲットパネルなど、イルミナのさまざまなNGSライブラリー調製ワークフローのためのFragment Analyzer QCソリューションの概要を示すApplication Noteを発行しました。 Fragment Analyzerソリューションには、がん研究者が一般的に調査するFFPE RNAおよびFFPE DNAサンプルの新しい品質評価メトリクスが含まれています。
“イルミナの革新的なNGSテクノロジーが、個別化医療とゲノム発見の現代を形作る中で、イルミナと提携できることを嬉しく思います。”とAATIのビジネス開発担当バイスプレジデント、Jonathan Hagopian, Ph.D.は述べています。 イルミナとのコラボレーションにより、ワークフローを加速し、NGSデータ生成を最適化し、重要なサンプルの完全性ベンチマークを提供する革新的なQCソリューションを提供しています。
Fragment Analyzerは、自動ゲルプライミング、改善された低分子量感度、正確な高分子量サイジング、最大12、48、または96のサンプルのスケーラブルな並列解析によるロースループットとハイスループットのシーケンス操作の両方をサポートする能力、および最大288のサンプルのハンズフリー自動化により、代替QCシステムと差別化します。 Fragment Analyzer INFINITY® システムは、ロボットアームと統合して連続動作し、ユーザーの介入なしに1日あたり2,400を超えるサンプルを実行できます。
Advanced Analytical TechnologiesとFragment Analyzerの詳細については、 https://www.aati-us.com/instruments/fragment-analyzer/。
イルミナアプリケーションのFragment Analyzer QCの詳細については、https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/appnotes/library-qc-fragment-analyzer-application-note-770-2017-002.pdf。
