微生物ゲノム

NGSは微生物学に有望

新しいAmerican Academy of Microbiology論文では、この分野の重要な検討事項を取り上げています

NGSは微生物学に有望
2016年2月19日

次世代シーケンサー(NGS)は、細菌、ウイルス、真菌、寄生虫など、どのような種類の生物が侵入しているかにかかわらず、微生物学ラボに侵入した微生物の原因を同定する能力を提供する可能性があります。本日ワシントンDCで開催された米国微生物学会(American Society for Microbiologyのリーダーシップグループ)のイベントで発表された新しいレポートでは、NGSベースの検査の実施を迅速化するために、臨床検査室が克服すべき運用上、技術上、規制上、戦略的課題について説明しています。

NGSは数年間、感染症病原体の同定を支援するために研究環境で使用されてきましたが、科学界の多くのメンバーは、その広範な臨床使用への移行が遅いと考えています。

この技術は、患者にとって貴重な時間を無駄にし、生死の違いとなりうる診断的推測のゲームを覆すものである、"とカリフォルニア大学サンフランシスコ校ラボ医学部の准教授であるCharles Chiu, MD氏は述べました。“微生物の同定が遅れると、効果のない治療や感染拡大のリスクが高まります”と、博士は付け加えました。

このレポートでは、新しい基準と検証方法、教育とトレーニングの機会、規制と払い戻しポリシーの変更、キュレーションされた安全なデータベースの作成とメンテナンスなど、臨床微生物学の分野を前進させるために必要なことを検証します。

このレポートは、米国微生物学会が主催する2日間のコロキアムに基づいており、米国内外の専門家が集まり、臨床および公衆衛生の微生物学ラボにおけるNGSテクノロジーの使用について話し合います。

“NGSは反復検査を制限し、病原体のより迅速な同定を支援することで医療を改善する可能性があります”と、イルミナの微生物および感染症の商業開発マネージャーであり、コロキアムに参加しているKelly Hoon氏は述べました。この報告書は、微生物学研究室におけるNGSの広範な実施の障壁に対処するために、コミュニティが一堂に会することを願っています。最終的には、NGSは健康転帰の改善に役立つと考えています。  

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