アグリゲノム

海のシーケンス

Michael Bunce教授が環境DNAの逸脱について語ります

海のシーケンス
2019年12月13日

環境DNA(eDNA)シーケンスは、生物多様性を研究し、生態系の変化を監視するための急速に普及しつつあるメソッドです。微生物がDNAを周囲の環境に排出すると、eDNA解析はこれらの遺伝子のパンくずを拾い、微生物(細菌)からメガファウナ(サメなど)まで、サンプルに存在するすべての種に関する手がかりを提供します。 

Bunce教授は、いくつかの大学で古代および環境DNAの分野で研究を行ってきました。最近では カーティン大学 (西オーストラリア州パース)でTrace and Environmental DNA( TrEnD)研究所を共同設立しました。 彼の主な 研究分野は、次世代シーケンサー(NGS)を使用した生態系の生物多様性の研究で、化石骨を調べて絶滅*とeDNA海水を調べ、海洋公園**で魚を調査しました。サンゴ礁から数リットルの海水に残されたDNAから80種以上の魚を検出できるという事実は、私が驚くべき発見だと、ブンス教授は述べています。

Bunce教授は、海洋におけるeDNAの多くの側面について研究しています。私たちの海の最も深い深部にあるものを知る ことができるメタバーコーディングの利点も含まれます。生態系ベースの管理が、すべてのものがいかに相互につながっているかを理解する上でどのように役立つかを説明しています。  さらに、コミュニティサイエンスプログラムであるSequencing of the Seas(SoS)では、学生が直接体験し、地元のビーチに人々をつなぐことができます。

\\"eDNAは、十分な情報に基づいた保全上の意思決定を可能にする重要なデータソースになると考えています。そして、海洋、河川、陸地で直面する課題を考えると、今こそ優れた意思決定が本当に重要な時です。\\"とBunce教授は述べています。

“eDNAを通じてその生態系に生息する魚、サンゴ、サメを見つけるため、生態系の探索者になるが、さらなる利点がある”とMichael Bunce教授は述べています。ゲノム、祖先、微生物叢、遺伝子修飾に関する重要な決定を求められる時期、遺伝子やゲノミクスに対する人々の認識が高まります。  私は少し偏見があるかもしれませんが、DNAとは何か、DNAがどのように機能するのか、そして周囲の世界を探索するためにどのようにそれを捉えることができるかについて教育する機会を得ます。

eDNAのパワーを活用する革新的なアプローチは急速に拡大しており、以下が含まれます。ポートモニタリング、生物多様性調査、バラスト水質検査、土壌検査、水産養殖、花粉の同定と修復など。

 

 

*ニュージーランド全土の古代DNA調査で明らかになった、実在の慣行、過去の生物多様性、人類発生の影響
FV Seersholm、TL Cole、A Grealy、NJ Rawlence、K Greig、M Knapp、M Stat、...
米国科学アカデミーの手続き115(30)、7771-7776

**eDNAによるエコシステムのバイオモニタリング:熱帯海洋環境における生命の木全体のメタバーコーディング
M Stat、MJ Huggett、R Bernasconi、JD DiBattista、TE Berry、SJ Newman、...
科学レポート7(1)、12240