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アグリゲノム

食料安全保障の向上に向けた、サツマイモのシーケンスの取り組み

G.Craig Yencho氏とBode Olukolu氏が2017 Agricultural Greater Good Initiative Grantを受賞

食料安全保障の向上に向けた、サツマイモのシーケンスの取り組み
2017/01/18

(当特集記事は、Illumina Inc., が2017年1月18日付けで発表した英文特集記事を日本語に翻訳したものです。
特集記事の正式言語は英語であり、その内容・解釈については英語が優先します)

2011年よりAgricultural Greater Good Initiativeでは、発展途上国における飢餓、栄養不良、貧困などの軽減を目的とし、ゲノム研究を中心とした多様なプロジェクトにおいて、Illuminaの技術を使い挑戦する研究者達に対してイルミナの製品を寄贈してきました。サポートを受けたプロジェクトは世界中に広がり、広範な科学的発見は、食料不安にある人々が一般的に消費する農業的に重要な作物および家畜に関する研究を向上させてきました。

今週、イルミナはサンディエゴでのPlant and Animal Genome(PAG) Conferenceで、高品質なde novo全ゲノムアセンブリーの構築および6倍体サツマイモ(Ipomoea batatas)のSNPアレイを提案したノースカロライナ州立大学の研究者らに対し、2017年の賞を授与しました。Horticulture学部の教授のG. Craig Yencho博士および研究助教授のBode Olukolu博士は、サツマイモの世界的な多様性を明らかにするSNPアレイに用いるSNPの発見およびバリデーションに助成金を充てます。

「世界各地における栄養不足と飢餓に対処できる大きな可能性を持つ研究を前進させる手立てとして、この賞を引き続き提供できることを誇りに思います。」と述べたのはイルミナのアグリゲノム分野のアソシエイトディレクターを務めるRyan Rapp博士です。「Agricultural Greater Good Initiative賞に何百もの応募があったことは、世界的な食料ニーズに対処する上でゲノム研究が重要であることを証明しています。」

サツマイモは異なる気候に適応できることから、世界で7番目に重要な食用作物です[1]。しかし、高ヘテロ接合体を持つ6倍体のサツマイモゲノムの特性と、96本の染色体は、世代から世代への形質の遺伝を複雑にし、分子育種技術を用いたより栄養豊富なサツマイモや地域ニーズに合わせた作物の育成への取り組みを難しくしています。

「サツマイモは、発展途上国における栄養不足と飢餓の軽減に貢献できる素晴らしい可能性を持っています」とYencho氏は言います。「オレンジ色サツマイモはその好例です。これはプロビタミンAを多く含んでおり、サハラ砂漠以南のアフリカと東南アジアにおけるビタミンA不足を解決するうえでの、栄養強化主食作物としての有効性を示しています。」

「The Greater Good Initiativeは、サツマイモの遺伝的複雑性をさらに紐解き、世界中のサツマイモ栽培家のための新栽培ツール開発に向けた取り組みの助けになるでしょう」とOlukolu氏は付け加えました。

授与される20Tbのデータ生成に必要な量のシーケンス試薬は、de novoアセンブルプロジェクト完了のため、および世界中のサツマイモ栽培プログラムで用いるSNPアレイを構築するためのSNPコーリング促進のために利用されます。さらにチームは、サハラ砂漠以南のアフリカ、アジア、および南アメリカにいる研究者達との既存のコラボレーションを強化し、栄養が不足している地域における食料安全保障の向上のため、彼らの知識を利用することを計画しています。

 

[1] Rodriguez-Bonilla L, Cuevas HE, Montero-Rojas M, Bird-Pico F, Luciano-Rosario D, Siritunga D (2014) Assessment of genetic diversity of sweet potato in Puerto Rico. PLoS One. 9(12):e116184.

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