2021年7月15日
この春後半、ブラジル南東部の町セラーナで生活が叫び始めました。友人や近所の人たちは孤立してから集まってきました。ヘアサロンやレストランは、ますます多くの観光客を目にしています。
セラナのこの常識の具体化は、ブラジルの公衆衛生システムに医薬品やワクチンを供給するサンパウロの研究センターであるButantan Instituteの多くの取り組みの1つによるものです。現在、セラナの成人の95%以上がCOVID-19のワクチン接種を受けています。多くの点で、セラナはブラジルでは異常ですが明るいスポットです。ブラジルの他の地域では症例が増加し続けており、ブラジルの人口の約4分の1しかワクチン接種を完了していません。
2020年3月以来、同研究会はCOVID-19に取り組むためのさまざまな活動を企画しました。まず、彼らは感染症と診断し、サンパウロ州と協力して、検査用の検体のバックログを調べました。科学開発センターのバイスプレジデントであるMaria Carolina Quartim Barbarosa Elias Sabbaga氏によると、Butantan Instituteは毎日約20,000のサンプルのテストを行っています。
2021年初頭、Butantan Instituteの研究者は、Serranaの成人集団にワクチンを接種するために、Project Sと呼ばれる野心的なイニシアチブを実施しました。2020年7月、同研究所はCoronaVacワクチンの試験承認を受けました。これは当初、香港のバイオテクノロジー企業であるSinovacが設計したものです。それ以来、Butantan InstituteはブラジルでCoronaVacワクチンを生産し配布するための技術移転を受けました。CoronaVacは重症COVID-19の感染予防に約50%しか効果がありませんが、Serranaの集団ワクチン接種はCOVID-19による死亡を約95%減少させました。
ブラジルとセラナではP.1バリアントがウイルスの優勢な形態であることを考えると、これは驚くべきことです。
ブタンタン研究所のサイエンティストは、イルミナのゲノム技術によって可能になった努力であるシーケンスによってウイルスの拡散も追跡しています。
パンデミックを理解したい場合は、シーケンスする必要があります。ウイルスのゲノムと、ある地域、州、国においてある瞬間に循環するバリアントを理解することはシーケンスによるものです。シーケンスしないと、何が起こっているかわかりません。
ワクチン接種後、Butantan Instituteの研究者は、セラナのブレークスルー症例の調査に関心を示しました。科学者はまた、サンパウロ州のどのバリアントかを理解するためにサーベイランスに関心があり、ブラジル全土のCOVID-19の調査に役立つようにこのバリアントをスケールアップする可能性さえあると、Sabaga氏は述べています。
Butantan Instituteは、新しいバリアントの拡散を追跡するために、異なる都市でサンプルを収集するネットワークを構築しました。3月、Butantan Instituteとそのパートナーは、NextSeq 2000からMiSeqまで、イルミナのテクノロジーを導入しました。また、イルミナのCOVIDSeq Testを使用してウイルスバリアントを追跡しています。
“イルミナはゴールドスタンダードであるため使用することにしました”とSabaga氏は述べています。これまでのところ、彼女と彼女のチームメンバーはイルミナのシステムの精度に満足しています。
セラナのワクチン接種を受けた個人からのサンプルのシーケンスを続けることから、同研究所のSabaga氏らは、これまでワクチン接種後に新たなバリアントが出現していないことを示しました。彼女は、彼女と研究所が自由に使えるツールがウイルスをよりよく理解できるようにしてくれたことに感謝しており、これらのツールがCOVIDだけでなく将来の感染症の追跡にも役立つことを見ています。
NovaSeq 6000およびNextSeqシリーズシステムのCOVIDSeqの詳細については、ここをクリックしてください。
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