イルミナのMiSeq®システムがHistoGenetics社における次世代シーケンサープラットフォームの第一選択肢に

MiSeq Will Supplement HistoGenetics' Existing Human Leukocyte Antigen Sequence-Based Typing

2013年7月22日サンディエゴおよびニューヨーク（BUSINESS WIRE）－－イルミナ・インク（NASDAQコード：ILMN）は本日、高分解能シーケンスベースのヒト白血球型抗原（HLA）検査サービスの先駆者であるHistoGenetics社が、自社のCLIA認証ラボで用いるシーケンサーとしてMiSeqシーケンスシステムを選択したと発表しました。HistoGenetics社は、HLA遺伝子を高性能かつ高スピードでシーケンスするために、現在すでに使用しているサンガーシーケンスのワークフローを補完する目的で複数のMiSeqシステムを導入する予定です。HLA遺伝子の変異は、生体移植前の組織の適合性検査に利用されるだけではなく、自己免疫疾患や感染症、がんなどさまざまな疾患との関連が知られています。

HLA遺伝子はその重要性にもかかわらず、HLA遺伝子のルーチンでのタイピングはこれまで実施されてきませんでした。これは、互いに高度に関連する遺伝子を多くの対立遺伝子から正確に識別することが技術的に困難であったためです。HLAタイピングを提供する世界最大の研究所の1つであるHistoGenetics社は、高分解能でのHLAタイピングにサンガーシーケンスのみを用いてきました。MiSeqシステムの導入に伴い、HistoGenetics社は従来のサンガーシーケンスから次世代シーケンサーを用いたHLAタイピングへ移行する予定です。

HistoGenetics社の最高経営責任者で共同創設者でもあるNezih Cereb博士は、次のように述べています。「MiSeqプラットフォームの導入によって、この分野でリーダーとしての地位を打ち立て、成功を確かなものにできると期待しています。これまで他の技術を用いてきた経験を踏まえても、MiSeqの出力データの質の高さやシンプルなワークフロー、さらにイルミナの共同研究に対する姿勢は素晴らしく、お客様に対して迅速かつ高品質のサービスを提供するうえで理想的なソリューションだと言えるでしょう」

現在、HistoGenetics社はHLAシーケンスをベースとした検査を、ハイレベルまたはレジストリレベルの2段階の分解能で提供しています。より包括的なハイレベルの分解能では、抗原認識部位内に見られるアンビギュイティをすべて解析できるため、他の手法では見逃されてきた新規の対立遺伝子やまれな対立遺伝子を見つけることができます。幹細胞移植の際には、このレベルでの検査が米国組織適合性・免疫遺伝学学会および全米骨髄バンクにより義務付けられています。一方、Be The Match Registry™などの非血縁ドナーレジストリや臍帯血バンクなどで用いられるレジストリレベルの検査では、大半のアンビギュイティを解析できます。

「MiSeqシステムを導入することで、移植前の精密検査やドナー登録がこれまでにない高分解能で実施され、またサンプル処理がより迅速に行われるようになるでしょう」とCereb博士は付け加えています。

現在、HistoGenetics社がタイピングサービスに要する時間は、緊急サンプルの場合で3日間です。これまでHistoGenetics社は、300万を超えるサンプルをタイピングし、さらに1,300万ものシーケンスベースでのタイピングを実施しており、その中の1万6,000以上のサンプルからHLA対立遺伝子の新たなバリアントを検出しています。

「次世代シーケンサーはHLAジェノタイピングを一変する可能性を秘めており、イルミナの技術がこの変貌に大いに貢献すると信じています。MiSeqシステムは、その精密さとスピードにより、生産規模でのHLAタイピングにおいて本領を発揮することでしょう。HistoGenetics社との提携が成功することを期待しています」と、イルミナのトランスレーショナル＆コンシューマー・ゲノミクス部門のMatt Posard上級副社長兼統括マネージャーは述べています。