本研究により、Illumina Protein Prepソリューションを用いて重要なリファレンスデータセットを生成
サンディエゴ、2025年1月13日 /PRNewswire/ – DNAシーケンスおよびアレイベースのテクノロジーで世界をリードするIllumina, Inc.（NASDAQ: ILMN）は本日、UK Biobankの5万件のサンプルを解析するためのパイロット版プロテオミクスプログラムの実施を発表しました。このプログラムは、deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、GSK、Johnson & Johnson、Novartisと協力して実施されます。本パイロットプログラムは、イルミナが今後展開する予定のプロテオミクスアッセイ「Illumina Protein Prep™」を基盤としています。このアッセイは次世代シーケンサー（NGS）に対応したSOMAmer®テクノロジーを採用したソリューションです。このソリューションにより、プロテオミクスに関する洞察へのアクセスが拡大することが期待されています。
プロテオミクスは、細胞機能を直接観察することで、健康および疾患におけるタンパク質の役割に対する理解を深めるだけでなく、がんや心血管疾患などの状態に関するバイオマーカーの探索を促進します。研究者は、遺伝的バリエーションとタンパク質発現データ、疾患やその他の表現型を結びつけることで、創薬における重要なプロテオゲノミクスツールとして台頭している「タンパク質定量的形質座位（pQTL）」を活用しています。Illumina Protein Prepなどのハイスループットプロテオミクス手法の登場により、新たなpQTLの探索がこれまで以上に容易になりました。
イルミナの最高技術責任者（CTO）を務めるSteve Barnard, PhDは次のように述べています。「UK Biobankのデータは、オミクスコミュニティーにおけるリファレンスデータセットの標準を確立しており、Illumina Protein Prepの発売準備に向けて、医療業界全体と連携しながら本パイロット研究を進められることを大変嬉しく思います。本パイロットプログラムは、研究コミュニティーや製薬パートナーに向けて、生物学的洞察を深めるための新たな高品質NGSベースのプロテオミクスデータを生み出すことになると確信しています。」
UK Biobankは、同社と14のバイオ医薬品企業が共同で進めている別の研究プロジェクト「UK Biobank Pharma Proteomics Project」に参加している同じ被験者から提供された5万件のサンプルを提供します。deCODE Geneticsは、Illumina Protein PrepソリューションおよびNovaSeq™ X Plusシステムを用いてこれらのサンプルを処理し、DRAGEN Protein Quantificationパイプラインを使って解析を実施します。最初の3万件のサンプルは、イルミナ、deCODE Genetics、Standard BioTools, Inc.の共同出資により資金提供され、自動化パートナーであるTecanの支援を受けて実施されます。これら最初の3万件のサンプルから生成されたデータは、品質管理が完了した時点で、UK Biobankから2025年後半に科学研究コミュニティーへ速やかに提供される予定です。
さらに2万件のサンプルから生成されたデータについては、UK Biobankの標準的な運用方針に従い、業界コンソーシアムのメンバーが一定期間、独占的にアクセスできる権利を保有することになります。業界参加者には、deCODE Geneticsおよび製薬企業のGSK、Johnson & Johnson、Novartisが含まれています。当該独占期間の終了後、UK Biobankはこれらのデータをより広範な科学研究コミュニティーに提供する予定です。イルミナは、さらに多くの企業がこのコンソーシアムに参加することを期待しています。
UK Biobankの主任研究員兼最高責任者であるProfessor Sir Rory Collinsは次のように述べています。「この豊富なプロテオミクスデータの追加により、個人の遺伝、環境、ライフスタイルがどのように相互作用し、さまざまな疾患の発症に影響を与えるのかを、研究者がよりダイナミックに解明できるようになります。
このプロジェクトは、UK Biobank Pharma Proteomics Projectの研究を補完するものであり、UK Biobankのボランティア5万人分の血液サンプルに対する追加のプロテオミクスアッセイデータを生成します。世界中の科学者たちが、これらの多様なデータソースを活用し、さまざまな疾患の予防や治療の新たな方法を飛躍的に進展させることを期待しています。」
Standard BioTools Inc.の最高経営責任者（CEO）を務めるMichael Egholm, PhDは次のように述べています。「プロテオミクスは、旧来のテクノロジーの制約によりヒトの健康への影響力が十分に発揮されてこなかったという経緯がありました。しかし、まさに変革の時代を迎えています。本日は、DNAベースのSOMAmerが持つ比類なきマルチプレックス能力と、業界をリードするNGSプラットフォームをシームレスに統合し、UK Biobankの持つ潜在力を活用してより多くの人々に健康の恩恵をもたらすための重要なマイルストーンとなる日なのです。」
Illumina Protein Prepアッセイは、11,000種類のSOMAmer（Slow Off-rate Modified Aptamers）試薬を活用し、9,000種類のヒトタンパク質を検出します。このアッセイにより、サンプルから解析までのプロテオミクスの探索研究が実現します。本ソリューションは初期アクセス限定版として顧客に提供されており、6,000種類のヒトタンパク質を検出可能です。また、NovaSeq X、NovaSeq X Plus、NovaSeq 6000システムと互換性があり、単一のプラットフォーム上でのマルチオミクス解析が実現します。本ソリューションは2025年前半に発売される予定です。
将来の見通し
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イルミナについて
イルミナは、ゲノムの持つ力を解き放つことによってヒトの健康向上に務めています。イノベーションにおけるイルミナの取り組みは、DNAシーケンスとアレイベーステクノロジーの世界でイルミナをグローバルなリーダーに押し上げ、研究市場、臨床市場、応用市場で顧客にサービスを提供しています。イルミナの製品は、ライフサイエンス、腫瘍学、生殖医学、農業、その他新たに台頭しつつある分野のアプリケーションで利用されています。詳細については、illumina.comを参照してください。また、X、Facebook、LinkedIn、Instagram、TikTok、YouTubeでも当社の情報をお届けしています。
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