Illumina SomaSeq Discoveryソリューションにより、重要なリファレンスデータセットを研究で作成
サンディエゴ、2025年1月13日 /PRNewswire/ – DNAシーケンスおよびアレイベースのテクノロジーで世界をリードするIllumina, Inc.（NASDAQ: ILMN）は本日、UK Biobankの5万件のサンプルを解析するためのパイロット版プロテオミクスプログラムの実施を発表しました。このプログラムは、deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、GSK、Johnson & Johnson、Novartisと協力して実施されます。パイロットプログラムは、イルミナの今後のプロテオミクスアッセイであるSomaSeq Discoveryに基づいており、プロテオミクスの洞察へのアクセス拡大に役立つ次世代シーケンサー（NGS）ベースのソリューションであるSOMAmer®テクノロジーを搭載しています。
プロテオミクスは、直接的な細胞機能の観察を可能にし、健康や疾患におけるタンパク質 の役割の理解を向上させ、がんや心血管疾患などの疾患のバイオマーカー発見を促進します。研究者は、遺伝的バリエーションとタンパク質発現データ、疾患やその他の表現型を結びつけることで、創薬における重要なプロテオゲノミクスツールとして台頭している「タンパク質定量的形質座位（pQTL）」を活用しています。SomaSeq Discoveryなどのハイスループットプロテオミクス手法の登場により、新しいpQTLの発見がより利用しやすくなりました。
Illumina Protein Prepは、Illumina SomaSeq Discoveryになりました。
詳細については、Illumina SOMAmer Proteomicsのページをご覧ください。
このパイロット研究では、UK Biobankのデータがオミクスコミュニティのリファレンスデータセットとして標準を設定しており、Illumina SomaSeq Discoveryの立ち上げの準備をする際に、医療業界全体で協力できることを嬉しく思います、と、イルミナの最高技術責任者であるSteve Barnard PhDは述べました。このパイロットプログラムは、生物学的洞察を前進させるために、研究コミュニティや製薬パートナー向けに高品質のNGSベースのプロテオミクスデータの新しいコレクションを生成すると考えています。
UK Biobankは、UK Biobank Pharma Proteomics Projectに含まれる同じ研究参加者から50,000サンプルを提供します。これは、UK Biobankと14のバイオ医薬品企業との間の別個の研究協力関係です。deCODE Geneticsは、SomaSeq DiscoveryソリューションとNovaSeq Gecko X Plusシステムを使用してサンプルを処理し、DRAGEN Protein Quantificationパイプラインを使用して解析を実行します。最初の3万件のサンプルは、イルミナ、deCODE Genetics、Standard BioTools, Inc.の共同出資により資金提供され、自動化パートナーであるTecanの支援を受けて実施されます。これらの 最初の30,000サンプルから生成されたデータは、完了し、その結果得られたデータが品質管理された時点で、UK Biobankによって科学研究コミュニティ にすぐに利用可能になります。これは2025年 後半に予定されています。
さらに2万件のサンプルから生成されたデータについては、UK Biobankの標準的な運用方針に従い、業界コンソーシアムのメンバーが一定期間、独占的にアクセスできる権利を保有することになります。業界参加者には、deCODE Geneticsおよび製薬企業のGSK、Johnson & Johnson、Novartisが含まれています。その期間の後、 データはUK Biobankによってより広範な科学研究コミュニティで利用できるようになります。イルミナは、さらに多くの企業がこのコンソーシアムに参加することを期待しています。
UK Biobankの研究主任兼最高経営責任者であるRory Collins教授は次のように述べています。
このプロジェクトは、UK Biobank Pharma Proteomics Projectの業務を補完し、UK Biobankボランティアの50,000の血液サンプルについて追加のプロテオミクスアッセイデータを提供します。私は、世界中の科学界がこれらの異なるデータソースをどのように利用して、幅広い疾患の予防と治療のための新しい方法の開発に飛躍をもたらすか、楽しみにしています。
プロテオミクスは変革の時代に突入し、人類の健康への影響はレガシーテクノロジーの限界に制約されています、とS Standard BioTools Inc.の最高経営責任者であるMichael EgholmPhDは述べました。今日、DNAベースのSOMAmerの比類なきマルチプレックス能力を主要なNGSプラットフォームとシームレスに統合し、UK Biobankの力を解き放ち、人間の健康を加速させるため、重要なマイルストーンとなっています。
SomaSeq Discoveryアッセイは、11,000のSOMAmer（Slow-Off-rate Modified Aptamers）試薬で9,000のヒト固有タンパク質を検出し、サンプルから解析までのプロテオミクス発見研究を可能にします。本ソリューションは初期アクセス限定版として顧客に提供されており、6,000種類のヒトタンパク質を検出可能です。また、NovaSeq X、NovaSeq X Plus、NovaSeq 6000システムと互換性があり、単一のプラットフォーム上でのマルチオミクス解析が実現します。このソリューションは2025年前半に発売 されます。
将来の見通し
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イルミナについて
イルミナは、ゲノムの持つ力を解き放つことによってヒトの健康向上に努めています。イノベーションにおけるイルミナの取り組みは、DNAシーケンスとアレイベーステクノロジーの世界でイルミナをグローバルなリーダーに押し上げ、研究、臨床、応用市場で顧客にサービスを提供しています。イルミナの製品は、ライフサイエンス、腫瘍学、生殖医学、農業、その他の新興分野のアプリケーションで利用されています。詳細については、illumina.comをご覧ください。また、X、Facebook、LinkedIn、Instagram、TikTok、YouTubeでも当社の情報をお届けしています。
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