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NextSeq 550 システムの仕様

高精度シーケンスとアレイスキャン

リード長と複数出力構成を調整可能

NextSeq550

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプットa

リード長 NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システム高出力キット
1 × 75 bp 該当なし 25～30 Gb
2 × 75 bp 16.25～19.5 Gb 50～60 Gb
2 x 150 bp 32.5～39 Gb 100～120 Gb

a. イルミナPhiXコントロールライブラリーを使い、サポート範囲内でのクラスター密度（120-165 k/mm2 パスフィルタークラスター）を基にしています。実際の性能パラメーターは、サンプルの種類、サンプル品質、パスフィルタークラスターにより異なる場合があります。すべてのNextSeq 550 System Kitはペアエンドに対応しています。

主要アプリケーションの予想サンプルスループット

NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システム高出力キット
3エクソーム 1ヒト全ゲノム
12の濃縮パネル 12エクソーム
96アンプリコンパネル 10トランスクリプトーム

フローセル当たりのパスフィルターリード

  NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システム高出力キット
シングルリード ≤ 130M ≤ 400M
ペアエンドリード ≤ 260 M ≤ 800 M

クオリティスコアa

リード長 NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システム高出力キット
1 × 75 bp 該当なし Q30以上の塩基が80%超
2 × 75 bp 2 × 75 bpの場合、Q30以上の塩基が80%超 Q30以上の塩基が80%超
2 x 150 bp 2 × 150 bpの場合、Q30以上の塩基が75%超 Q30以上の塩基が75%超

a. クオリティスコアは、ベースコーリングにおけるエラー確率の予測です。Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。

ランタイム

リード長 NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システム高出力キット
1 × 75 bp 該当なし 11時間
2 × 75 bp 15時間 18時間
2 x 150 bp 26時間 29時間

アレイスキャンパラメーター

アレイ アレイあたりのスキャン時間 サンプルあたりのスキャン時間
Infinium MethylationEPIC BeadChip 40分 5分
Infinium CytoSNP-850K BeadChip 40分 5分

装置の仕様

NextSeq 550 System specifications
  • 発光ダイオード（LED）
    波長

    （レーザーダイオード780 nm、クラスIIIb）
    緑色 510～525 nm、赤色 645～655 nm
  • 寸法
    W × D × H
    53.3 cm × 63.5 cm × 58.4 cm
    (21.0インチ × 25.0インチ × 23.0インチ)
  • 重量
    83 kg（183ポンド）
  • 梱包重量
    151.5 kg（334ポンド）
詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー

NextSeq 550システムでは、イルミナの実績ある1塩基合成反応（SBS）テクノロジーを採用しているため、さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度なデータが得られます。SBS法では、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。

2-Channel SBS

NextSeq 550システムは、2チャネルのSequence by Synthesis（SBS）を利用して、オリジナルのイルミナの4チャネルSBSテクノロジーよりも高速なデータ生成と高いデータ精度を実現します。