リード長 | NextSeq 550システム中出力キット | NextSeq 550システム高出力キット |
---|---|---|
1 × 75 bp | 該当なし | 25~30 Gb |
2 × 75 bp | 16.25~19.5 Gb | 50~60 Gb |
2 x 150 bp | 32.5~39 Gb | 100~120 Gb |
高精度シーケンスとアレイスキャン
リード長と複数出力構成を調整可能
リード長 | NextSeq 550システム中出力キット | NextSeq 550システム高出力キット |
---|---|---|
1 × 75 bp | 該当なし | 25~30 Gb |
2 × 75 bp | 16.25~19.5 Gb | 50~60 Gb |
2 x 150 bp | 32.5~39 Gb | 100~120 Gb |
a. イルミナPhiXコントロールライブラリーを使い、サポート範囲内でのクラスター密度(120-165 k/mm2 パスフィルタークラスター)を基にしています。実際の性能パラメーターは、サンプルの種類、サンプル品質、パスフィルタークラスターにより異なる場合があります。すべてのNextSeq 550 System Kitはペアエンドに対応しています。
NextSeq 550システム中出力キット | NextSeq 550システム高出力キット |
---|---|
3エクソーム | 1ヒト全ゲノム |
12の濃縮パネル | 12エクソーム |
96アンプリコンパネル | 10トランスクリプトーム |
NextSeq 550システム中出力キット | NextSeq 550システム高出力キット | |
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シングルリード | ≤ 130M | ≤ 400M |
ペアエンドリード | ≤ 260 M | ≤ 800 M |
リード長 | NextSeq 550システム中出力キット | NextSeq 550システム高出力キット |
---|---|---|
1 × 75 bp | 該当なし | Q30以上の塩基が80%超 |
2 × 75 bp | 2 × 75 bpの場合、Q30以上の塩基が80%超 | Q30以上の塩基が80%超 |
2 x 150 bp | 2 × 150 bpの場合、Q30以上の塩基が75%超 | Q30以上の塩基が75%超 |
a. クオリティスコアは、ベースコーリングにおけるエラー確率の予測です。Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。
リード長 | NextSeq 550システム中出力キット | NextSeq 550システム高出力キット |
---|---|---|
1 × 75 bp | 該当なし | 11時間 |
2 × 75 bp | 15時間 | 18時間 |
2 x 150 bp | 26時間 | 29時間 |
アレイ | アレイあたりのスキャン時間 | サンプルあたりのスキャン時間 |
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Infinium MethylationEPIC BeadChip | 40分 | 5分 |
Infinium CytoSNP-850K BeadChip | 40分 | 5分 |
Sequence by Synthesis(SBS)ケミストリー
NextSeq 550システムでは、イルミナの実績ある1塩基合成反応(SBS)テクノロジーを採用しているため、さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度なデータが得られます。SBS法では、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。
NextSeq 550システムは、2チャネルのSequence by Synthesis(SBS)を利用して、オリジナルのイルミナの4チャネルSBSテクノロジーよりも高速なデータ生成と高いデータ精度を実現します。