NextSeqシリーズ仕様
NextSeq 550システムシーケンス性能パラメーター
| NextSeq 550システムハイ出力キット* | NextSeq 550システム中出力キット* | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| リード長 | 合計時間† | 出力 | リード長 | 合計時間† | 出力 |
| 2 × 150 bp | 29時間 | 100～120 Gb | 2 × 150 bp | 26時間 | 32.5～39 Gb |
| 2 × 75 bp | 18時間 | 50～60 Gb | 2 × 75 bp | 15時間 | 16.25～19.5 Gb |
| 1 × 75 bp | 11時間 | 25～30 Gb | |||
*イルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様を、サポートされているクラスター密度（フィルターを通過する129～165 k/mm2クラスター）でインストールします。実際の性能パラメーターは、サンプルタイプ、サンプル品質、フィルターを通過するクラスターによって異なる場合があります。NextSeq 550キットはすべてペアエンド対応です。
†合計時間には、デュアルサーフェススキャンが可能なNextSeq 550システムでのクラスター生成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。
パスフィルターの読み取り
| NextSeq 550システムハイ出力キット | NextSeq 550システム中出力キット | |
|---|---|---|
| シングルリード | 最大4億 | 最大1億3,000万 |
| ペアエンドリード | 最大8億 | 最大2億6,000万 |
クオリティスコア ††
| NextSeq 550システムハイ出力キット | NextSeq 550システム中出力キット |
|---|---|
| > 2 × 150 bpでQ30より75%高い塩基 | > 2 × 150 bpでQ30より75%高い塩基 |
| > 2 × 75 bpでQ30より80%高い塩基 | > 2 × 75 bpでQ30より80%高い塩基 |
| > 1 × 75 bpでQ30より80%高い塩基 |
†† クオリティスコア（Qスコア）は、ベースコールにおけるエラー確率の予測指標です。Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。
主要アプリケーションの予想サンプルスループット
| NextSeq 550システムハイ出力キット | NextSeq 550システム中出力キット |
|---|---|
| 1ヒト全ゲノム | 3エクソーム |
| 12エクソーム | 12のエンリッチメントパネル |
| 16トランスクリプトーム | 96のアンプリコンパネル |
NextSeq 550システムアレイスキャンパラメーター
| アレイ | アレイあたりのスキャン時間 | サンプルあたりのスキャン時間 |
|---|---|---|
| Infinium MethylationEPIC BeadChip | 40分 | 5分 |
| Infinium CytoSNP-850K BeadChip | 40分 | 5分 |
| HumanCytoSNP-12 BeadChip | 40分 | 3.3分 |
| Infinium HumanKaryomap-12 BeadChip | 40分 | 3.3分 |
NextSeq 550システム仕様書
高速で柔軟性の高いハイスループットのベンチトップシーケンサーは、イルミナのSBSテクノロジーの精度で全ゲノム、トランスクリプトーム、ターゲットリシーケンスアプリケーションを可能にします。
スペックシートを見る主要なテクノロジー
Sequence by Synthesis（SBS）テクノロジー
NextSeq 550システムは、実績のあるイルミナの合成によるシーケンス（SBS）テクノロジーを利用して、複数のアプリケーションに高精度のデータと堅牢な性能を提供します。SBS法では、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。
SBSビデオを見る2色法SBSテクノロジー
NextSeq 550システムは、2チャネルSBSケミストリーを活用して、効率的なシーケンスとデータ生成を実現します。2チャネルSBSは、サイクルとデータ処理時間を短縮し、イルミナのシステムを際立たせるのと同じ高い品質と精度を実現します。このイノベーションにより、NGSは日常的なツールとして使用できる手頃な価格のソリューションとなっています。
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