主要なアプリケーションと手法
mRNAシーケンス（mRNA-Seq）により、研究者は遺伝子発現を詳しく調べることができ、アイソフォーム、新規転写産物、および遺伝子融合の同定に使用できます。NextSeq 550 RNAシーケンスソリューションは、実績のあるイルミナのテクノロジーを活用して、コーディングトランスクリプトームの詳細なスナップショットを提供します。NextSeq 550ランあたり最大16トランスクリプトームのシーケンスが可能です。
研究者がNextSeq 550システムでmRNA-Seqをどのように使用しているかをご覧ください。
電子書籍を読む：RNA-Seqを用いた遺伝子発現および制御研究
ライブラリー調製
6.5時間/< 3時間のハンズオン
Illumina Stranded mRNA Prep
インプット量わずか25 ngの標準（未分解）RNAを利用してコーディングトランスクリプトームを解析できるシンプルで拡張性が高くコスト効率の良い、1日で完了できる迅速ソリューション
シーケンス
15～18時間/15分のハンズオン
NextSeq 500/550 v2.5試薬キット
ベンチトップにハイスループットシーケンスシステムのパワーをもたらします。150サイクルの高出力または中出力キットは、トータルRNA-Seqに対して2 x 75 bpのリードを提供します。
エクソームシーケンスは、全ゲノムシーケンスに代わる費用対効果の高い方法として、ゲノムのタンパク質コード領域を解析します。NextSeq 550システムによるエクソームシーケンスは、コーディングバリアントを同定するためのシンプルで信頼性の高い方法を提供し、最も困難なゲノム領域でもシーケンスを成功させています。NextSeqランあたり3～12エクソームのシーケンス。
研究者がエクソームシーケンスアプリケーションにNextSeq 550システムをどのように使用しているかをご覧ください。
ライブラリー調製
1日/3時間のハンズオン
Nextera DNA Exome
シンプルな1日ワークフローを使用して、ヒトエクソームをより深く理解するための迅速な道筋を提供します。
Illumina DNA Prep with Enrichment
Illumina DNA Prep with Enrichmentは、高速で使いやすいワークフローを採用しています。オンビーズタグメンテーションケミストリーとシンプルなシングルハイブリダイゼーションプロトコルを組み合わせ、ワークフローの総時間を短縮します。
シーケンス
15～18時間/15分のハンズオン
NextSeq 500/550 v2.5試薬キット
ベンチトップにハイスループットシーケンスシステムのパワーをもたらします。150サイクルの高出力または中出力キットは、トータルRNA-Seqに対して2 x 75 bpのリードを提供します。
解析
プッシュボタンツール
DRAGENサーバーまたはBSSHのDRAGEN Enrichmentアプリ上のDRAGEN生殖細胞系列または体細胞パイプライン
BaseSpace Sequence HubのオンプレミスDRAGEN SeverおよびDRAGENは、生殖細胞系および体細胞エクソームデータの迅速で正確な解析を提供します。
最小の生物の詳細なゲノムビューを取得します。小規模ゲノムシーケンスは、公衆衛生、疫学、疾患研究のための微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を提供します。NextSeq 550ランあたり最大384の小さなゲノムをシーケンスします。
研究者が NextSeq 550システムを使用して小さな全ゲノムのシーケンスを行う方法をご覧ください。
ライブラリー調製
6時間/4時間のハンズオン
Illumina DNA Prep
全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物種まで、幅広いアプリケーションに対応する高速な統合ワークフロー。
Nextera XT DNAライブラリー調製キット
小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミドのための迅速で簡単なライブラリー調製ワークフロー。
シーケンス
26～29時間/15分のハンズオン
NextSeq 500/550 v2.5試薬キット
デスクトップにハイスループットシーケンスシステムのパワーをもたらします。300サイクルの高出力キットは、全ゲノムシーケンス用に2 x 150 bpのリードを提供します。
解析
プッシュボタンツール
BaseSpace Whole-Genome Sequencing App
Isaacアライメントとバリアントコールにより、全ゲノムシーケンスから生物学的情報を迅速に抽出します。
その他のアプリケーションと手法
マイクロアレイスキャン
シーケンスに加えて、NextSeq 550は、Infinium MethylationEPIC BeadChipによるメチル化解析など、生殖医療、遺伝医療、がん研究における幅広いアプリケーションに対応するマイクロアレイスキャンを可能にします。
Target Enrichment
シーケンス固有のハイブリダイゼーションを使用して、関心のあるゲノム領域を解析します。
全トランスクリプトームシーケンス
コーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAの両方をトータルRNAシーケンスで解析し、トランスクリプトームを包括的に把握します。
アプリケーションノート
研究者インタビュー
コーディングトランスクリプトーム解析
RNAコード領域の配列特異的キャプチャーを使用して、RNAエクソームの既知および新規の特徴の両方を検出します。
ターゲットDNAリシーケンス
ターゲットリシーケンスは、研究対象の遺伝子またはゲノム領域のサブセットのみのシーケンスに時間、費用、解析を集中させます。
研究者インタビュー
ターゲット遺伝子パネル
ターゲット遺伝子シーケンスパネルには、特定の関心遺伝子に焦点を合わせたプローブセットが含まれています。事前に設計されたパネルとカスタムパネルの両方が利用可能です。
メチル化シーケンス
シーケンスベースのDNAメチル化解析によって可能になる高いカバレッジ密度と柔軟性でエピジェネティックな研究を実行します。
アンプリコンシーケンス
PCRアンプリコンの超深度シーケンスにより、1回のアッセイで最大数百のターゲットゲノム領域のコスト効率の良い解析が可能です。
アプリケーションノート
De Novoシーケンス
次世代シーケンサー（NGS）によるde novoシーケンスにより、リファレンスゲノムなしで、種を迅速かつ正確に特性解析できます。
研究者インタビュー
シーケンスによるジェノタイピング
シーケンスによるジェノタイピングは、新しい植物や動物のSNPを発見し、ジェノタイピング研究を行うための低コストの遺伝子スクリーニング手法を提供します。
ChIP-Seqを用いたDNA-タンパク質相互作用解析
クロマチン免疫沈降（ChIP）アッセイとシーケンサーを組み合わせたChIPシーケンス（ChIP-Seq）は、全ゲノムの遺伝子制御調査を行うための強力な手法です。
研究者インタビュー
miRNAおよびSmall RNA解析
microRNAなどの小さなRNA種を単離してシーケンスし、遺伝子サイレンサーや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。
研究者インタビュー
翻訳解析
リボソームプロファイリングは、細胞翻訳プロセスの系統的なモニタリングとタンパク質存在量の予測を可能にします。
アプリケーションノート
研究者インタビュー
細胞ゲノムマイクロアレイとシーケンス
次世代シーケンサーは、アレイベースの細胞ゲノム解析を補完するために、塩基ごとのゲノムワイドな染色体変異の検出を提供します。
研究者インタビュー
RNA薬物反応バイオマーカーの探索
RNA-Seqを利用して、RNAベースの薬物応答バイオマーカーを発見し、プロファイリングする方法をご覧ください。新規ユーザーがこのアプリケーションを使用するためのリソースにアクセスできます。
メチル化アレイ
単一ヌクレオチドの分解能でゲノム全体のメチル化部位を定量的に調査します。
環境DNAシーケンス
環境DNA（eDNA）シーケンスは、生物多様性を研究し、生態系の変化を監視するための急速に普及しつつあるメソッドです。
研究者インタビュー
検査法ガイド
BeadChipからゲノム、トランスクリプトーム、エピゲノム研究のためのライブラリー調製、シーケンサーの選択、解析、サポートまで、必要な情報に1か所でアクセスできます。研究用途に応じて特別に設計された包括的なガイドを使用して、ラボに最適なツールを選択してください。
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