主要なアプリケーションと手法
mRNAシーケンスでは、遺伝子発現をさらに詳細に解析して、アイソフォーム、新規転写産物、および融合遺伝子の検出を行えます。 NextSeq RNAシーケンスソリューションでは、実績あるイルミナのテクノロジーを活用して、コーディングトランスクリプトームの詳細な全体像を捉えることができます。 NextSeqのランあたり最大16のトランスクリプトームシーケンスが可能です。
NextSeqシリーズおよびmRNA-Seqを利用して、遺伝子発現プロファイリングを行う方法をご覧ください。
Library Prep
10.5 hours/4.5 hours hands-on
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
Prepare sequencing libraries from mRNA to get a clear view of the coding transcriptome with strand-specific information.
Sequence
15–18 hours/15 minutes hands-on
NextSeq 500/550 v2 Reagent Kits
Bring the power of a high-throughput sequencing system to the benchtop. The 150 cycle high-output or mid-output kits provide 2 x 75 bp reads for total RNA-Seq.
Analyze
Push-button tools
BaseSpace RNA-Seq Alignment App
Performs read mapping, FPKM estimation of reference genes and transcripts, novel transcripts assembly, variant calling, and optional fusion calling.
BaseSpace Cufflinks Assembly & DE App
Quickly assess novel transcript isoforms and gene expression levels from RNA-Seq Alignment results.
Browse Sample Datasets on Basespace Sequence Hub:
NextSeq 500 RNA-Seq Run
NextSeq 500 RNA-Seq Project
エクソームシーケンスでは、全ゲノムシーケンスに代わるコスト効率に優れた方法として、ゲノムのタンパク質コーディング領域を解析します。 NextSeqシリーズは、シンプルで信頼性の高いエクソームシーケンス法によって、最も難しいゲノム領域からもコーディング変異を検出します。 NextSeqのランあたり3～12のエクソームをシーケンスできます。
NextSeqシリーズを利用してエクソームシーケンスアプリケーションを実行する方法をご覧ください。
Library Prep
1 day/3 hours hands-on
TruSeq Rapid Exome Library Prep Kit
Uses a simple, one-day workflow to provide a fast path to greater understanding of the human exome.
Sequence
15-18 hours/15 minutes hands-on
NextSeq 500/550 v2 Reagent Kits
Bring the power of a high-throughput sequencing system to the desktop. The 300 cycle high-output or mid-output kits provide 2 x 150 bp reads for exome sequencing.
Analyze
Push-button tools
BaseSpace Enrichment App
Rapid alignment and variant detection for small, structural, and copy number variant calling, variant annotation, and enrichment metrics calculation.
NextSeqシリーズは、実績あるイルミナのシーケンステクノロジーを活用し、全ゲノムからの変異検出を高いカバレッジで行います。 タッチパネル操作のシーケンスで操作時間が最小限に抑えられる、NextSeq全ゲノムシーケンス（WGS）ソリューションで、微生物からヒトに至るあらゆるゲノムを効率良く解析することができます。 NextSeqのランあたり、1つのヒトゲノムまたは最大384の小規模ゲノムのシーケンスが可能です。
NextSeqシリーズを利用して全ゲノムの大規模シーケンスを実施する方法をご覧ください。
Library Prep
6 hours/4 hours hands-on
TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
Generate whole-genome sequencing libraries and efficiently interrogate samples with limited available DNA.
Sequence
26–29 hours/15 minutes hands-on
NextSeq 500/550 v2 Reagent Kits
Bring the power of a high-throughput sequencing system to the desktop. The 300 cycle high-output kit provides 2 x 150 bp reads for whole-genome sequencing.
Analyze
Push-button tools
BaseSpace Whole-Genome Sequencing App
Quickly extracts biological information from whole-genome sequences, using Isaac alignment and variant calling.
Browse Sample Datasets on Basespace Sequence Hub:
NextSeq 500 WGS Run
NextSeq 500 WGS Project
アプリケーションと手法をもっと見る
遺伝子発現プロファイリング
mRNAシーケンス（mRNA-Seq）は正確で包括的な発現プロファイルを可能にする、既知・新規の両方の転写物とその存在量を検出します。
アプリケーションノート
E-Book
研究者の声
コーディングトランスクリプトミクス
RNAコーディング領域に特異的なシーケンスキャプチャーを使用し、RNAエクソームの既知・未知の配列を検出します。
全トランスクリプトームシーケンス
コーディングRNA、複数の形式のノンコーディングRNAの両方を解析して、トランスクリプトームの全体像を示します。
アプリケーションノート
研究者の声
ターゲット遺伝子パネル
ターゲット遺伝子シーケンスパネルには、特定の関心遺伝子に絞り込んだ既定のプローブセットが含まれています。 固定パネルとカスタムパネルの両方を利用できます。
アプリケーションノート
ターゲットDNAシーケンス
ターゲットリシーケンスは研究の対象となる遺伝子やゲノム領域の一部のみのシーケンス解析、時間とコストに着目した手法です。
研究者の声
アンプリコンシーケンス
PCRアンプリコンの超ディープシーケンスはコスト効率が高く、1つのアッセイで最大数百ものターゲットゲノム領域を解析できます。
アプリケーションノート
De Novoシーケンス
次世代シーケンス（NGS）を使ったDe Novoシーケンスにより、リファレンスゲノムを使わない、高速で精確な種の特性評価が可能になります。
アプリケーションノート
研究者の声
メチル化シーケンス
シーケンスベースのDNAメチル化解析により、エピジェネティックな研究を高いカバレッジ密度とフレキシビリティーで行います。
ChIP-Seqを使用した、DNA-タンパク質相互作用解析
クロマチン免疫沈降アッセイとシーケンスを融合し、ChIP-Seqはゲノムワイド遺伝子調節解析のパワフルな手法となります。
研究者の声
miRNA解析およびSmall RNA解析
microRNAなどの低分子RNA種を単離およびシーケンスし、遺伝子サイレンシングおよび転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を調べます。
アプリケーションノート
研究者の声
翻訳解析
リボソームプロファイリングは、細胞翻訳プロセスの系統的モニタリングやタンパク質量の予測が可能です。
アプリケーションノート
研究者の声
メタゲノム解析
微生物の多様性を評価し培養不可能な微生物を検出するために、雑多なサンプル中に存在する生命体の遺伝子を包括的に抽出します。
アプリケーションノート
細胞遺伝学
次世代シーケンスは、染色体変異を塩基単位でゲノムワイドに検出し、アレイを使用した細胞遺伝学的解析を補完します。
研究者の声
シーケンスによるジェノタイピング
シーケンスによるジェノタイピングとは、新たな動植物SNPを発見してジェノタイピング研究を行なうための、低コストな遺伝学的スクリーニング手法です。
イルミナのNGS活用ガイド
必要な情報にアクセスする-ゲノム、トランスクリプトーム、エピゲノムライブラリーの調製からシーケンサー選択、解析、サポートまで-すべてをここに。 研究アプリケーションに特化して作成された総合的なカタログであなたのラボに最適なツールをご選択ください。
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