2018年9月12日
アトランティックボトルノースイルカ（Tursiops truncatus）の高度なアセンブリは、イルミナ、Sea World、Plant with Purpose、NRGene、Johns Hopkins University、Ocean Discovery Instituteのグローバル研究者グループによって完成し、寄付されました。このような高品質のゲノムは、育種、比較生物学、医学、保全計画における課題を解決するために不可欠です。 このゲノムアセンブリは、ハワイのモンクアザラシやアフリカの野生のイヌと同様に、比較ゲノミクスの研究を触媒し、生物多様性を分類するための構造を提供し、最終的には種の保存と管理に関する決定を支援するために発表されています。
科学者たちは、このプロジェクトを通してアトランティックボトルノースイルカの組み立て構造の改善を推進するために、複数の手法を組み合わせました。2つのゲノムアセンブリが利用可能になりました：
1） 従来のHaploidアセンブリ（Tur_tru_Illumina_hap_v1）：2つの親ハプロタイプの典型的なモザイク
ハプロイドアセンブリはこちらから入手できます： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA476133
2） ハプロタイプフェーズド“倍数体”アセンブリ（Tur_tru_Illumina_dip_v1）：各足場は単一の相同染色体からのシーケンスを表します
段階的なde novoアセンブリは、利用可能な最高品質のものであり、イルカゲノムのヘテロ接合性を探索する新規かつ正確な方法をコミュニティに提供します。二倍体アセンブリはこちらから入手できます：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA478376
イルカの哺乳類は、最も広く研究されている海洋哺乳類の1つです。しかし、Tursiops属の分類法は未解決のままです。この種をゲノミクスの時代に導くために、高品質のリファレンスゲノムは、全ゲノムレベルで種内および種間の多様性を分類する構造を提供するため、極めて重要です。 さらに、イルカと他の哺乳類種の分子軌道が並行しているため、イルカのボトルノースは代謝プロセス/糖尿病、プロテオミクス、老化などのヒトの健康の側面を理解するのに有用なモデルです。 データがどのように収集されたか、および高いデータ品質の詳細については、この論文をお読みください。
