2016年9月27日
生きているものは何でもDNAを持っています。陸でも、空でも、水中でも。 シカゴのシェッド水族館のアニマルヘルス担当副社長であるDVMのBill Van Bonn氏と連絡を取り、微生物叢プロジェクトについて学びました。Grainger Foundationの支援を受け、Argonne National Laboratory、イリノイ大学、イリノイ工科大学、米国農務省と協力して、この革新的なプロジェクトはイルミナMiSeqシステムを使用して、水族館の動物と環境を共有する無数の未知の生物間のユニークな関係を研究しています。
マイクロバイオームプロジェクトの目標は何ですか？また、どのように開始しましたか？
当社の微生物叢プロジェクトでは、環境生息環境を操作して、動物の健康に最適な微生物群集をつくる方法を理解しています。このプロジェクトは、管理環境が微生物コミュニティに与える影響に関するより良いデータの必要性を強調する長年の観察結果から生まれました。特に、クジラ、イルカ、家禽類などの飼育動物との協力により、（人間の健康と同様に）管理や消毒が行き届いた環境は、より多様な微生物叢に有利な環境よりも有益ではないのではないかと疑うようになりました。
MiSeqシステムはあなたの研究にどのようなメリットをもたらしましたか？
シェッド水族館は、毎年200万人を超える訪問者が集まる公共の展示施設です。当社のラボには大きな窓があり、MiSeqがキーストーンの装置として使われており、訪問者はこの窓からその空間を眺め、研究について学ぶことができます。この作業が水族館で行われていることを知り、驚くことがよくあり、次世代シーケンスで発見できる可能性に期待しています。
MiSeq “Horton”という名前は、かつては目に見えなかった何百万もの小さな重要な生物を耳にしたSeuss博士のキャラクターにちなんで付けられました。ホートンは、私たちの研究に浸透する発見の刺激的な側面のシンボルであるため、研究室でホートンを迎えることが大好きです。装置の個別化は、あらゆる年齢の訪問者に共鳴しているように見えます。
MiSeqにより、水族館周辺の数百のサンプルから1回のランで微生物群集を調査できます。小規模なチームと多くの未回答の質問では、使いやすさとサンプルから発見までの迅速な移行能力が非常に重要です。
研究から学んだことの例は何ですか？
シェッド水族館では、32,000頭の動物の自然生息環境を再現する環境が構築されています。また、シカゴで最も多く訪れた文化的な名所でもあります。これらの特徴により、当社の施設は、人間と動物の微生物がどのように相互作用するかを観察し、自然界では実現不可能な方法で仮説をテストするユニークな場所となっています。
訪問者を生活界に結びつけるという当社の使命の一環として、 Stingray Touchの展示など、さまざまなハンズオン体験を提供しています。Stingray Touchは、2015年の夏に43万人を超えるゲストが訪れた季節の屋外生息地で、人間と牛の線の相互作用を見るユニークな機会となりました。私たちの研究では、線の生息環境には季節が進むにつれて微生物の多様性が増すことがわかりましたが、当社の世界クラスの獣医チームは、動物の健康転帰の違いを検出できなかったことがわかりました。実際、舞台裏に隠された光線の対照群と比較すると、視察した光線は検査中に心拍数が低くなりました。
あなたの研究は海洋生物学や水族館にどのような影響を及ぼすと予想しますか？
シェッド水族館のA. Watson Armour III Center for Animal Health and Welfareを通じて、水生動物ケアの背後にある科学の継続的な進歩に取り組んでいます。私たちの環境の微生物生態学を特徴づける最初の水族館として、動物園と水族館のコミュニティ内の資源になることを期待しています。私たちの研究結果は、動物園だけでなく、川、湖、海洋においても水生生物のより良いケアに役立つことを願っています。
