2016年8月29日
ミュージアムを訪れる多くの人は、ハンズオンや研究プロジェクトに従事し、世界中の科学者と協力する小さな大学のようにはなれないことに気づいています。 フィールドミュージアムがMiSeqシステムを使用してDNA科学に対する一般の認識を高め、新しい発見をするためにどのように使用しているかを学ぶために、Kevinと連絡を取りました。
ラボについて教えてください。
フィールドミュージアムのPritzker Laboratoryは、遺伝子解析と世界の生物多様性の保護に特化した部門間のマルチユーザーコア施設です。フィールドミュージアムのキュレーター、スタッフメンバー、学生、および外部の協力者が共有します。
DNA研究プログラムはどのように開始され、MiSeqを購入するきっかけとなりましたか？
細菌や真菌から植物や動物まで、あらゆる種を研究しています。次世代シーケンサーが科学的な調査ツールとしてより人気を博し始めたとき、このテクノロジーが研究にどのようなメリットをもたらすかを考え始めました。約3年前、献身的なドナーからMiSeqの購入に必要なリソースの提供がありました。何千もの遺伝子を解析し、さらには小さなゲノムをシーケンスする能力を持つことは、多くの分野で有用であることがわかっていました。
装置の使用方法
当社のスタッフは、The Morton Arboretum、Chicago Botanic Gardenなどの地元の大学や機関の科学者や、世界中の研究者と協力しています。MiSeqは、コレクションの生物種、生物学、およびそれぞれの生息地における他の生物種との相互作用をよりよく理解するための独自のプロジェクトに加えて、さまざまなプロジェクトでキュレーターと協働する大学院生や博士課程修了後の社員が利用しています。
MiSeqを使用したプロジェクトの例にはどのようなものがありますか？
常にさまざまなプロジェクトが行われています。ここ数年間にMiSeqを使用した例をいくつかご紹介します。
- アリの腸内に存在する細菌の特性
- コカインの生産に使用される植物であるコカのゲノムの集合体
- マダガスカルの鳥類の進化に関する研究
- 西大西洋におけるレモンサメの遺伝学に関する環境保護研究
MiSeqのどのような点が気に入っていますか？
汎用性が高く、使いやすく、作業できる幅広いデータを提供します。私たちのラボは、このような幅広い研究に関する質問をしている点でユニークであり、ラボの経験レベルが異なる科学者がいます。MiSeqは、このようなさまざまなシーケンスアプリケーションを実行できるため、素晴らしい製品です。また、当社の社内研究者に加えて、世界中の経験豊富な訪問科学者や高校生によって使用されているため、使いやすさも非常に重要です。
このラボには、ミュージアムの訪問者が内部を見ることができる窓があります。これらの訪問者はラボを訪問する際にどのように反応しますか？
毎日午前11時から正午まで、科学者と話をしています。ここでは、ミュージアムの来訪者が当研究所で研究を行っている科学者と話をすることができます。私たちが何に取り組んでいるか常に尋ねられ、ミュージアムで何ができるかを知ることに訪問者は魅了されます。彼らは、私たちがどれだけの遺伝情報を収集できるか、そしてそのデータが進化生物学、生態学、生物多様性におけるより大きな疑問にどのように対応するかについて、常に驚いています。
“サイエンティストと話す”以外に、どのような教育プログラムがありますか？
学生がDNAラボで研究プロジェクトに従事するさまざまな夏季インターンシップがあります。これには、高校生や教師向けの毎年の夏季のDNAレジデンシーインターンシッププログラムが含まれます。6週間のプログラムには、1週間のトレーニングと5週間のラボでのハンズオンワークが含まれ、研究者と協力して研究を行います。今年、このプログラムの学生たちは、イチゴからDNAを抽出するプロジェクトで8年生のグループも率いていました。また、当社のプログラムに参加する教師は、The Daniel F.とAda L. Rice DNA Discovery Centerの教育者ガイドと、システム生物学に関する一連のレッスン計画の作成にも役立ちました。
写真：John Weinstein、© The Field Museum
