細胞および分子生物学, 微生物ゲノム, 微生物学研究

COVIDSeqでインドの最前線のCOVID-19検査を強化

COVID-19を検出するための次世代シーケンスの活用

COVIDSeqでインドの最前線のCOVID-19検査を強化
2020年8月13日
COVID-19 のおよそ240万件の感染者*を抱えるインドは、世界で3番目に多い感染者数を有しており、ウイルスの継続的な感染拡大を軽減するために、より高い検査能力が不可欠です。ニューデリーの一流の科学産業研究評議会(CSIR)であるInstitute of Genomics & Integrative Biology(IGIB)は、SARS-CoV-2の検出のためのイルミナのCOVIDSeq−(*研究アッセイの能力を評価しました。COVIDSeqはハイスループットの次世代シーケンサーベースのアッセイで、通常NovaSeq 6000シーケンスシステムを使用して24時間以内に結果を生成し、現地のDRAGEN−(* Bio-ITプラットフォームにインストールされたCOVIDSeq Testを使用して実施される高精度で超高速な解析で補完されます。IGIBは、定量的ポリメラーゼ連鎖反応 (qPCR)検査と比較して感度が高く、診断率を全体で8~10%向上させたことを示すデータを生成しました。 

CSIR-IGIBとのコラボレーションは、COVID-19検査のための次世代シーケンスを提供するために世界中の多くのお客様とどのように協力しているかの重要な例です

COVIDSeqは、より多くの陽性サンプルを正しく同定し、この感度の向上は、COVID-19の不正確な診断数を減らし、ウイルスの拡散を制限するのに役立つ可能性があります。IGIBの検証では、COVIDSeqはSARS-CoV-2検出のための高感度アッセイとなりうることが提案されています。このアッセイでは、SARS-COV-2ゲノム全体のシーケンス情報も生成するため、ウイルスがどのように拡散しているかを理解するために遺伝子ベースの追跡作業に役立つ可能性があります。

IGIBは、最前線の検査の利用可能性を高め、ウイルスの伝播をモニタリングするために使用できる分子疫学情報にもアクセスできるように、COVIDSeqを評価しています。

COVIDSeq検証の完了は、インドがこの深刻な疾患と闘い、分類する上で重要な進歩を表していると、CSIR-Institute of Genomics and Integrative BiologyのディレクターであるAnurag Agarwal氏は述べました。“イルミナのテクノロジーは、インドのCOVID-19検査能力を大幅に拡大し、感染拡大の抑制に近づく可能性があります。”

COVIDSeqは、症状のある人におけるウイルスの存在を確認すると同時に、そのゲノムシーケンスを行い、COVID-19を追跡するための貴重なリソースを提供します。COVIDSeqが提供するゲノムカバレッジにより、分離株の系統への遺伝的疫学および系統的分類が促進されます。これにより、感染症の蔓延を阻止するためのエビデンスに基づくアプローチの中心となる、流行の出現と導入に関する洞察が得られる可能性があります。

“CSIR-IGIBとのコラボレーションは、COVID-19検査のための次世代シーケンスを提供するために世界中の多くのお客様とどのように協力しているかの重要な例です”と、イルミナのアジア太平洋&日本担当バイスプレジデント兼ゼネラルマネージャーであるGretchen Weightman氏は述べました。CSIR-IGIBは、COVID-19のパンデミックと闘うために必要なグローバルなニーズと拡張性を示すため、この最初のCOVIDSeqの商業的検証から得られる結果は重要です。

 

*https://coronavirus.jhu.edu/map.html