2015年8月24日
次世代シーケンサー（NGS）とジェノタイピングテクノロジーは、動物の育種に革命をもたらしています。従来の動物育種では、観察された物理的特性（表現型）に基づいて動物のスコアリングを行い、推定育種値（EBV）を決定します。多くの場合、このプロセスは非効率的で時間がかかります。多くの形質は、動物が成熟した場合にのみ評価し、明確にすることができず、育種結果の検証に遅れが生じます。
現在、NGSにより、研究者は家畜ゲノムを迅速かつコスト効率良くシーケンスし、関連するDNAバリアントを発見できるようになりました。 この分散を測定するように設計されたジェノタイピングアレイは、従来のEBVよりも迅速で正確なゲノム育種値（GBV）の開発に使用できます。
最近、アイルランドの酪農および牛業界に牛育種情報サービスを提供する非営利団体であるアイルランド畜牛育種連盟（ICBF）は、イルミナを牛データおよびゲノムプログラムのテクノロジーパートナーとして選定しました。このプログラムは2015年から2020年まで実施され、国民集団の一般的なメリットを改善します。
参加する農家は、ICBFにサンプルを提出することで、牛の15%のジェノタイピングを行う必要があります。ICBFは、2017年のプロジェクト中盤までに100万頭の牛のジェノタイピングを目指しており、プロジェクト全体で200万頭を超える動物のジェノタイピングを行う予定です。
牛肉データおよびゲノミクスプログラムには2つの主な利点があります。1つは農家にとっての収益性です。これは、農業が経済の重要な一部であるアイルランドでより大きな利益のためにあります。第二に、牛がメタン（有害な温室効果ガス）を生産するにつれ、アイルランドの国民集団のより効率的な管理は環境に対してプラスの影響を与えるはずです。
これはアグリゲノミクスにおける真の飛躍的な進歩です。イルミナは、世界で初めて100万匹の動物をジェノタイピングするプロジェクトに参加できることを嬉しく思います。これまで、何万ものサンプルが1つのプロジェクトで行われてきました。100万人が全国規模に向かっています。
イルミナは、動物を検査するための完全なカスタムSNPアレイを設計することで、ICBFを支援しています。プロジェクトでは、InfiniumアレイとNGSの組み合わせを使用します。DNAバリアントはNGSを用いて同定し、Infinium Beadchipテクノロジーを用いて大規模集団をスクリーニングするために導入します。
MacLaren-Lee氏によると、最終的な目標は、生まれてくるすべての動物が遺伝子型を同定できるポイントに達することです。アイルランドでは年間200万匹になります。ICBFとアイルランド農務省は、全国的な群れ全体の遺伝子型決定を世界で初めて行う国です。この100万のサンプルプロジェクトは、農業における全国規模のゲノミクスへの道のり、および牛の農業におけるジェノタイピングの日常的な採用への道のりにおける大きなマイルストーンです。
