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NovaSeq 6000 システム仕様

強力なパフォーマンス

出力を調整できるスケーラブルなハイスループットシーケンス

NovaSeq 6000 system render

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプットa

リード長 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp 該当なし 該当なし 該当なし 280～350 Gb
2 × 50 bp 65～80 Gb 134～167 Gb 333～417 Gb 該当なし
2 × 100 bp 134～167 Gb 266～333 Gb 667～833 Gb 1600～2000 Gb
2 × 150 bp 200～250 Gb 400～500 Gb 1000～1250 Gb 2400～3000 Gb
2 × 250 bpa 325～400 Gb 該当なし 該当なし 該当なし

a. * サポートされたクラスター密度での Illumina PhiX コントロール ライブラリーに基づく出力仕様。 NovaSeq 6000 システムでは、シングルフローセルのランまたはデュアル フローセルのランが可能です。デュアルフローセルランは、上記の2倍の出力を実現します。 

b. 最大リード長

主要アプリケーションの予サンプルスループット予測a

アプリケーション SP S1 S2 S4
ランあたりのヒトゲノム 約4 約8 約20 約48
ランあたりのエクソーム 約40 約80 約200 約500
ランあたりのトランスクリプトーム 約32 約64 約164 約400

a. *すべてのサンプルスループットは、デュアルフローセルのランに基づく概算値です。ヒトゲノムは、30xゲノムカバレッジを達成するために、1サンプル当たり>120 Gb超のデータを想定しています。エクソームでは、約8Gb/100倍を想定しています。トランスクリプトームでは50Mリード以上を想定しています。スループットは、使用されるライブラリー調製キットに応じて変わります。

フローセルあたりのパスフィルターリード数a

リードタイプ SP S1 S2 S4
シングルエンドリード 6億5,000万～8億 13億～16億 33億～41億 8～100億
ペアエンドリード 13億～16億 26億～32億 66億～82億 16～200億

a. *すべてのサンプルスループットは、デュアルフローセルのランに基づく概算値です。ヒトゲノムは、30xゲノムカバレッジを達成するために、1サンプル当たり>120 Gb超のデータを想定しています。エクソームでは、約8Gb/100倍を想定しています。トランスクリプトームでは50Mリード以上を想定しています。スループットは、使用されるライブラリー調製キットに応じて変わります。

クオリティスコアa

リード長 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp 該当なし 該当なし 該当なし Q30以上の塩基が90%以上
2 × 50 bp Q30以上の塩基が90%以上 該当なし
2 × 100 bp Q30以上の塩基が85%以上
2 × 150 bp Q30以上の塩基が85%以上
2 x 250 bp Q30以上の塩基が75%以上 該当なし 該当なし 該当なし

a. Illumina PhiX コントロールライブラリーを使用した NovaSeq 6000 試薬キット v1.5 に基づくクオリティスコア。

ランタイムa

リード長 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp 該当なし 該当なし 該当なし 約14時間
2 × 50 bp 約13時間 約13時間 約16時間 該当なし
2 × 100 bp 約19時間 約19時間 約25時間 約36時間
2 × 150 bp 約25時間 約25時間 約36時間 約44時間
2 × 250 bp 約38時間 該当なし 該当なし 該当なし

a. NovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5に基づくランタイムは、イルミナPhiXコントロールライブラリーを使用し、同時に2つのフローセルを実行します。

装置の仕様

NovaSeq 6000 system specifications

NovaSeq 6000 装置の仕様

  • 装置の構成
    コンピューターおよびタッチスクリーンディスプレイ導入セットアップおよびアクセサリーデータの収集および解析ソフトウェア
  • 内蔵制御コンピューター
    備考：コンピューター構成は定期的にアップグレードされます。現在の構成については、担当者にお問い合わせください
    ベースユニット：Intel i7 4700EQ CPU搭載Portwell WADE-8022
    メモリー：2 × 8 GB DDR3L SODIMM
    ハードドライブ：なし
    ソリッドステートドライブ(SSD)：256 GB mSATA
    オペレーティングシステム：Windows 10
  • 動作環境
    屋内専用
    温度：19°C～25°C（22°C ±3°C）、<2 °C change per hour
    湿度：相対湿度20%～80%、結露なし
    高度：2000メートル（6500フィート）未満
    換気：最大8530BTU/hおよび平均6000BTU/h
  • レーザー
    波長
    532 nm、660 nm、780 nm、790 nm
  • モニター付き寸法
    幅×奥行×高さ
    80.0 cm × 94.5 cm × 165.6 cm
    （31.5インチ×37.2インチ×65.2インチ）
  • 重量
    481 kg（1,059ポンド）

    リークトレイの場合は 3.5 kg(7.8 lb)、キーボードとマウスの場合は 0.9 kg(2 lb)を含む
  • 梱包寸法
    幅×奥行×高さ
    92 cm × 120 cm × 118 cm
  • 梱包重量
    628 kg (1385ポンド)
  • 電源要件
    200～240 VAC 50/60Hz、16A単相、2500 W イルミナは領域特異的な無停電電源装置を提供します
  • ネットワーク接続
    システムとデータ管理システム間は、1Gb 接続専用。直接またはネットワーク経由で接続
  • ネットワーク接続の帯域幅
    装置1台につき200 Mb/s：内部ネットワークでのアップロード
    装置1台につき200 Mb/s：BaseSpace Sequence Hubでのアップロード
    装置1台につき5 Mb/s：装置のオペレーションデータのアップロード
詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）テクノロジー

NovaSeq 6000システムは、実績あるイルミナSBSテクノロジーを採用し、精確なデータと安定した性能を提供します。SBSケミストリーは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法を使用します。この手法では、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出し、数十億もの配列を並行して読み取ります。

パターン化フローセルテクノロジー

NovaSeq 6000シリーズは、パターン化フローセルテクノロジーを採用しており、幅広いシーケンスアプリケーションに対応する驚異的なレベルのスループットを生成します。パターン化フローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。