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NovaSeq 6000 システム仕様

強力なパフォーマンス

出力を調整できるスケーラブルなハイスループットシーケンス

NovaSeq 6000 system render

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプットa

リード長 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp 該当なし N/A N/A 280～350 Gb
2 × 50 bp 65～80 Gb 134～167 Gb 333～417 Gb 該当なし
2 × 100 bp 134～167 Gb 266～333 Gb 667～833 Gb 1600～2000 Gb
2 × 150 bp 200～250 Gb 400～500 Gb 1000～1250 Gb 2400～3000 Gb
2 × 250 bpb 325～400 Gb 該当なし N/A N/A

a. サポートされるクラスター密度でのイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく出力仕様。 NovaSeq  6000システムは、シングルフロー セルランまたはデュアルフローセルランが可能です。デュアルフローセルランは、上記の2倍の出力を実現します。 

b. 最大リード長。

主要なアプリケーションのためのサンプルスループットの推定値a

アプリケーション SP S1 S2 S4
ランごとのヒトゲノム 約4 約8 約20 約48
ランごとのエクソーム 約40 約80 約200 約500
ランあたりのトランスクリプトーム 約32 約64 約164 約400

a. すべてのサンプルスループットは推定値であり、デュアルフローセルランに基づいています。ヒトゲノムは、30xゲノムカバレッジを達成するために、1サンプル当たり>120 Gb超のデータを想定してます。エクソームでは約8 Gb/100×を想定しています。トランスクリプトームでは50Mリード以上を想定しています。スループットは、使用されるライブラリー調製キットに応じて変わります。

フローセルごとのパスフィルターの読み取りa

リードタイプ SP S1 S2 S4
シングルエンドリード 6億5,000万～8億 13億～16億 33億～41億 8～10B
ペアエンドリード 13億～16億 26億～32億 66億～82億 160億～200億

a. すべてのサンプルスループットは推定値であり、デュアルフローセルランに基づいています。ヒトゲノムは、30xゲノムカバレッジを達成するために、1サンプル当たり>120 Gb超のデータを想定してます。エクソームでは約8 Gb/100×を想定しています。トランスクリプトームでは50Mリード以上を想定しています。スループットは、使用されるライブラリー調製キットに応じて変わります。

クオリティスコアa

リード長 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp 該当なし N/A N/A Q30以上の塩基が90%以上
2 × 50 bp Q30以上の塩基が90%以上 N/A
2 × 100 bp Q30以上の塩基が85%以上
2 × 150 bp Q30以上の塩基が85%以上
2 × 250 bp Q30より高い塩基の≥ 75% N/A N/A N/A

a. Illumina PhiXコントロールライブラリーを用いたNovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5に基づくクオリティスコア。

ランタイムa

リード長 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp 該当なし N/A 該当なし 約14時間
2 × 50 bp 約13時間 約13時間 約16時間 該当なし
2 × 100 bp 約19時間 約19時間 約25時間 約36時間
2 × 150 bp 約25時間 約25時間 約36時間 約44時間
2 × 250 bp 約38時間 該当なし N/A N/A

a. NovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5に基づくランタイムで、イルミナPhiXコントロールライブラリーを使用し、同時に2つのフローセルを実行します。

装置の仕様

NovaSeq 6000 system specifications

NovaSeq 6000装置の仕様

  • 装置の構成
    コンピューターおよびタッチスクリーンディスプレイ インストールセットアップおよびアクセサリーデータ収集および解析ソフトウェア
  • 内蔵制御コンピューター
    備考：コンピューター構成は定期的にアップグレードされます。現在の構成については、担当者にお問い合わせください
    ベースユニット：Intel i7 4700EQ CPU搭載Portwell WADE-8022
    メモリー：2 × 8 GB DDR3L SODIMM
    ハードドライブ：なし
    ソリッドステートドライブ(SSD)：256 GB mSATA
    オペレーティングシステム：Windows 10
  • 動作環境
    屋内専用
    温度：19°C-25°C（22°C ±3°C）、<2 °C change per hour
    湿度：相対湿度20%～80%、結露なし
    高度：2000メートル（6500フィート）未満
    換気：最大8530BTU/hおよび平均6000BTU/h
  • レーザー
    波長
    532 nm、660 nm、780 nm、790 nm
  • モニター付き寸法
    W × D × H
    80.0 cm × 94.5 cm × 165.6 cm
    （31.5インチ × 37.2インチ × 65.2インチ）
  • 重量
    481 kg（1059 lb）

    リークトレイには3.5 kg（7.8 lb）、キーボードとマウスには0.9 kg（2 lb）が含まれます
  • 梱包寸法
    W × D × H
    92 cm × 120 cm × 118 cm
  • 梱包重量
    628 kg（1385 lb）
  • 電源要件
    200～240 VAC 50/60Hz、16A単相、2500 W イルミナは地域固有の無停電電源装置を提供します
  • ネットワーク接続
    システムとデータ管理システム間は、1Gb 接続専用。直接またはネットワーク経由で接続
  • ネットワーク接続の帯域幅
    装置1台につき200 Mb/s：内部ネットワークでのアップロード
    装置1台につき200 Mb/s：BaseSpace Sequence Hubでのアップロード
    装置1台につき5 Mb/s：装置のオペレーションデータのアップロード
詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）テクノロジー

NovaSeq 6000システムは、実績のあるイルミナの合成によるシーケンス（SBS）テクノロジーを活用して、正確なデータと堅牢な性能を提供します。SBSケミストリーは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法を使用します。この手法では、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出し、数十億もの配列を並行して読み取ります。

パターン化フローセルテクノロジー

NovaSeq 6000システムは、パターンフローセルテクノロジーを採用しており、幅広いシーケンスアプリケーションに対応する前例のないレベルのスループットを実現します。パターン化フローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。