NovaSeq 6000のアプリケーションと方法
1つのプラットフォームで幅広いアプリケーションに対応
信頼性の高いハイスループットシーケンスのための実績のある性能
主要なアプリケーションと手法
NovaSeq 6000システムは、効率的かつ費用対効果の高い方法で全ゲノムシーケンスを実行します。その調整可能な出力は、ワークフローが合理化されたデュアルフローセルモードで最大6 Tbおよび200億リードを生成します。包括的なカバレッジのために、1日でトリオをシーケンスするか、最大48ゲノムを約2日でシーケンスするようにシステムを設定します。
準備
Illumina DNA PCR-Free Prep
ヒト全ゲノムシーケンスや腫瘍／正常シーケンスなどの高感度アプリケーション用の高性能で迅速な統合ワークフロー。
Illumina DNA Prep
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物種まで、広範囲のアプリケーション用の迅速な統合ワークフロー。
シーケンス
NovaSeq 6000試薬キットv1.5
すぐに使用できるカートリッジベースの試薬と複数のフローセル構成により、スケーラブルな出力と実績ある精度を兼ね備え、信頼性の高いハイスループットシーケンスを実現します。
解析
*サンプル当たりの時間、サンプル当たり200ｘのカバレッジを推定
DRAGEN生殖細胞系列パイプライン（BaseSpace Sequence HubまたはDRAGENサーバー上）
DRAGEN Germline Pipeline v3は、FASTQファイルを調整し、オプションでバリアントコールを行い、BAM、VCF、またはその両方を出力します。
DRAGEN体細胞パイプライン（BaseSpace Sequence HubまたはDRAGENサーバー上）
The DRAGEN Somatic Pipelineは、Tumor-onlyまたはTumor/NormalのFASTQファイルを調整し、バリアントコールを行い、BAMおよびVCFを出力します。
ゲノムの2％未満を解析するWESは、WGSに代わるコスト効率が高い選択肢です。NovaSeq 6000システムは、デュアルS4フローセルを使用して1回のランで最大500エクソームのシーケンスが可能です。
準備
*合計2.5日間の準備時間、6時間のハンズオンタイム
Illumina DNA Prep with Enrichment
このキットは、迅速で、使いやすいワークフローを採用しています。オンビーズタグメンテーションケミストリーとシンプルなシングルハイブリダイゼーションプロトコルを組み合わせ、ワークフローの総時間を短縮します。
シーケンス
NovaSeq 6000試薬キットv1.5
すぐに使用できるカートリッジベースの試薬と複数のフローセル構成により、スケーラブルな出力と実績ある精度を兼ね備え、信頼性の高いハイスループットシーケンスを実現します。
解析
*サンプル当たりの時間、サンプル当たり100ｘのカバレッジを推定
DRAGEN Enrichment
このアプリは、FASTQ、BAM、またはCRAMファイルを調整し、オプションでバリアントコールを行い、BAM、VCF、またはその両方を出力します。
正常または低品質サンプル中のコーディングおよび複数の形態のノンコーディングRNAを検出します。NovaSeq 6000システムでは、デュアルS4フローセルを使用して1回のランで最大400のトランスクリプトームをシーケンスできます。
準備
Illumina Stranded Total RNA Prep
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して、比類ない柔軟性で研究を行うことができます。
シーケンス
NovaSeq 6000試薬キットv1.5
すぐに使用できるカートリッジベースの試薬と複数のフローセル構成により、スケーラブルな出力と実績ある精度を兼ね備え、信頼性の高いハイスループットシーケンスを実現します。
NovaSeq 6000システムワークフローの紹介
シニアラボマネージャーのBrian Steffy氏とシーケンスシステムマネージャーのDavid Miller氏が、NovaSeq 6000システムの合理化されたワークフローについて学びます。このシステムが高度なハイスループットシーケンサーである理由を直接ご覧ください。
動画を視聴
ワークフロー製品のトップセリング
その他のアプリケーションと手法
ターゲットエンリッチメント
シーケンス固有のハイブリダイゼーションを使用して、関心のあるゲノム領域を解析します。
コーディングトランスクリプトーム解析
RNAコード領域のシーケンス特異的キャプチャーを使用して、コーディングトランスクリプトームの既知および新規の特徴の両方を検出します。
ターゲットDNAシーケンス
ターゲットリシーケンスは、研究対象の遺伝子またはゲノム領域のサブセットのみのシーケンスに、時間、費用、解析を集中させます。
メチル化シーケンス
シーケンスベースのDNAメチル化解析により、高いカバレッジ密度と柔軟性でエピジェネティック研究を強化します。
mRNA-Seqを用いた遺伝子発現プロファイリング
mRNAシーケンス（mRNA-Seq）は、既知および新規の転写産物を検出し、転写産物の量を測定し、正確で包括的な発現プロファイリングを実現します。
De Novoシーケンス
De novoシーケンスとは、リファレンスシーケンスがない新規ゲノムの配列を決定することです。NGSは、あらゆる種の高速で正確な特性評価を可能にします。
ChIP-Seqを用いたDNA-タンパク質相互作用解析
クロマチン免疫沈降（ChIP）アッセイとシーケンスを組み合わせることで、ChIP-Seqはゲノムワイドな遺伝子制御調査のための強力な方法です。
集団研究
集団シーケンスアプリケーション用の大規模ゲノムデータを集約および解釈するための堅牢で安全でスケーラブルなプラットフォーム。
Metagenomics
複雑なサンプルに存在する生物の遺伝子を包括的にサンプリングし、細菌の多様性を評価し、培養不能な微生物を検出します。
単一細胞RNAシーケンス
トランスクリプトームをプロファイリングすることで、複雑な組織でも単一細胞の個々の関わりを評価します。
ctDNAシーケンス
NGSは、がん研究者が血流中の低レベルのctDNAを検出するために必要な感度と特異性を提供します。
RNA薬物反応バイオマーカーの探索
RNA-Seqを利用して、RNAベースの薬物応答バイオマーカーを発見し、プロファイリングする方法をご覧ください。新規ユーザーがこのアプリケーションを採用できるように設計されたリソースにアクセスします。
イルミナメソッドガイド
BeadChipから、ゲノム、トランスクリプトーム、またはエピゲノム研究のためのライブラリーの準備、シーケンサーの選択、解析、サポートまで、すべて1か所で必要な情報にアクセスできます。研究用途に応じて特別に設計された包括的なガイドを使用して、ラボに最適なツールを選択してください。
ガイドを見る関連ソリューション
がんゲノム研究
当社のシーケンスおよびマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、幅広いがんゲノミクス研究アプリケーションをサポートしています。
微生物ゲノム
次世代シーケンサー（NGS）は、微生物ゲノミクスを変化させています。NGSを使用して、新しい微生物の発見、感染拡大の監視、食品源の分析などを行います。
複雑な疾患と遺伝性疾患に関する研究
さまざまな複雑な遺伝子疾患の研究を加速する包括的なアレイと次世代シーケンスソリューション。