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Video: パンデミックの最前線に立つイルミナ

世界中のサーベイランスをサポートするために次世代シーケンスをどのように展開したかを振り返る

パンデミックの最前線に立つイルミナ
2021年8月26日

今月、イルミナは、Municipal Corporation of Greater Mumbaiが運営するカストゥルバ病院の分子診断リファレンスラボラトリーに100万ドルのシーケンス能力を寄付しました。インドのマハラシュトラ州に600万件以上のCOVID感染が見られるカストゥルバは、ゲノムサーベイランスが重要なツールであることを知っています。また、世界的なライフサイエンス企業として、イルミナの使命は健康と生活の質の向上をサポートすることです。このパンデミックの間、その使命は100倍に拡大されました。現在、イルミナは70カ国以上でCOVIDサーベイランスをサポートしています。

最初からシーケンス
2020年1月24日の早朝、中国のイルミナの従業員は、家族が旧正月を祝う準備をしていた間、中国疾病対策予防センター(CCDC)に配送するためにNextSeq−(* 550シーケンサーを準備していました。その後、チームは装置の校正を行い、CCDCスタッフのトレーニングを行いました。これらの機械は、中国のサイエンティストや公衆衛生当局が新興コロナウイルスをよりよく理解する上で必要不可欠でした。

イルミナは初日からハンズオンアプローチを取りました。お客様への製品、ワークフロー、サポートの提供、データおよびサンプル共有の有効化、お客様のラボへの人員配置によるスケールアップ、供給品の寄付および割引。

当社の従業員は、CCDC、Gates Foundation、米国CDC、アフリカCDC、パスツール研究所、製薬企業やバイオテクノロジー企業、その他多くの企業と緊密に連携し、ウイルスの監視と制御を支援しました。イルミナのシーケンス技術は、世界中のNGS標準であるため、これらのグループが情報を共有するための共通言語を提供しました。

NGSは、疫学研究、感染クラスターの解析、併存疾患の特定、診断の検証、さまざまな株の評価、およびそれらの進化において重要な役割を果たしてきました。これらの断片は、疾患を理解し、治療を検査し、ワクチンを開発する上で不可欠です。

最も早い取り組み
イルミナがNextSeqシステムをCCDCに納入する前から、当社の機器は公衆衛生当局が感染拡大と闘うのを支援していました。2019年12月、上海公衆衛生臨床センター(SPHCC)はMiniSeqシステムを導入し、患者のサンプルをシーケンスしました。SPHCCは、ウイルスゲノムシーケンスを最初に発表した企業の1つです。

その後、上海にSPHCC-イルミナ微生物シーケンス研究およびアプリケーションデモセンターを開設し、微生物学研究と臨床試験を加速させました。

2020年4月、当社はイルミナSARS-CoV-2データツールキットを導入しました。これは、データ解析とワークフローツールの新しいセットで、患者サンプル中のSARS-CoV-2シーケンスの同定と、これらの結果を公開データベースと共有することを容易にします。

採用を加速するため、イルミナは当初、ツールキットを世界中の研究コミュニティに無料で配布していました。これらのツールは、世界中の15,000のイルミナシーケンスシステムを統合しており、情報を共有し、感染経路を理解し、ウイルスの進化を追跡し、ウイルス変異が治療効果に影響を与えているかどうかを判断するための驚くべきリソースを提供しています。

同月後半、イルミナは、コンゴ民主共和国、エジプト、エチオピア、ガーナ、ケニア、マリ、ナイジェリア、セネガル、南アフリカ、ウガンダでSARS-CoV-2シーケンスを拡大するために、アフリカ連合委員会に140万ドルのシーケンスシステムと消耗品を寄付しました。

イルミナとイルミナ企業財団は、5月に、SARS-CoV-2サーベイランス、シーケンス、モニタリングをサポートする機器と消耗品に500万ドル、COVID-19-related研究に200万ドル、CDC財団のCOVID緊急対応基金に100万ドル、コミュニティベースのイニシアチブに200万ドルという、COVID対策の取り組みを支援するために1,000万ドルを拠出しました。

英国では、イルミナはGenomics Englandと協力して約35,000人のCOVID-19患者をシーケンスしました。このイニシアチブの目的は、COVID-19にかかりやすい遺伝的要因を明らかにすることでした。

NGS COVID検査とサーベイランス
6月9日、当社のハイスループットCOVIDSeq−(* TestはFDAの緊急使用許可を受け、ラボに診断検査をスケールアップする新しいNGSツールを提供しました。その後、MiSeqシステム、MiniSeqシステム、iSeq100システムで動作する研究専用パネルであるCOVIDSeq−(* Assayをリリースしました。 iSeq100 新しいアッセイは、診断ではありませんが、小規模の分散型ラボにウイルスの検出と追跡機能を提供します。これは、研究やサーベイランスネットワークのない発展途上国で特に必要とされています。

ラボ以外では、イルミナは4大陸で現場で貢献してきました。イル&ミナは、Bill Melinda Gates Foundationと提携し、6,000万ドルのシーケンス能力をグローバルな病原体ゲノミクスイニシアチブに投入しました。このイニシアチブは、アフリカの病原体ゲノミクスイニシアチブを拡大し、世界中の包括的な病原体ゲノミクスネットワークの構築に貢献しています。

 

COVIDSeqはFDAの認可または承認を受けていません。この検査は、COVID-19の検出および/または診断のための体外診断薬の緊急使用の許可を正当化する状況が存在するという宣言の期間中、EUAの下でFDAによって承認されています。COVIDSeqは、1988年臨床検査室改善修正法(CLIA)、42 U.S.C. §263aの下で認定された米国内の臨床検査室においてのみ、高度に複雑な検査を実施するために使用が許可されています。

MiSeq、MiniSeq、iSeq 100システム用の新しい96サンプルCOVIDSeq Assayの詳細については、 ここをクリックしてください

NovaSeq 6000およびNextSeq 500/550/550Dx/2000のCOVIDSeqの詳細については、 ここをクリックしてください

COVID-19サーベイランスのサポートについては、ここをクリックしてください

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