2020年10月12日
どの地域でも危険な新規病原体が出現することは甚大ですが、ゲ ノミクスとバイオインフォマティクスのインフラが、その拡散を特定、監視、または遅延するには不十分である場合はさらに深刻になります。資源が限られている環境では、公衆衛生当局は診断やワクチンなどの貴重な医療品の割り当てに苦労しています。アフリカでは、リアルタイムかつ忠実な情報が必要です。病原体ゲノムの次世代シーケンサー（NGS）は、これらの洞察を提供し、生命の損失の可能性を軽減することができます。
ゲノムシーケンスデータは、検査、ワクチン、および治療法の開発、ならびにウイルス変異のモニタリングに使用されていますが、機器の先行費用が高く、十分なトレーニングを受けたラボの人員が不足し、データ解析のためのインフラが最小限であり、公衆衛生上の優先事項が競合し、経済的な負担となっているため、大陸でのシーケンスは厳しく制限されています。
NGSは、多数のゲノムを迅速にシーケンスし、集団全体で疾患の発生を引き起こしている可能性のある病原体を追跡できる、正確で効率的で安価な方法を提供します。これはサーベイランスとして知られるアプローチです。NGSは、診断、治療、ワクチンなどの疾患の対策に影響を与える遺伝的変化を追跡することもできます。
イルミナは、アフリカ大陸における遺伝子シーケンスと疾患発生サーベイランス機能の実現において、アフリカ病原体ゲノミクスイニシアチブを支援できることを誇りに思っています。
この春、SARS-CoV-2陽性サンプルは、アフリカの少数の機関によってのみシーケンスされ、循環株の特性評価が行われていました。イルミナは、低中所得地域でゲノム能力を実現するための継続的な取り組みの一環として、アフリカ連合およびアフリカ疾病対策予防センター（アフリカCDC）を通じて、アフリカ加盟国に140万米ドル相当のシーケンスシステムおよび関連消耗品を寄付しました。
現在、イルミナは、アフリカの病原体ゲノミクスイニシアチブ（アフリカPGI）の立ち上げにおいて、アフリカCDCの病原体ゲノミクス研究所を支援するため、セクター横断的なパートナーシップに加わります。この包括的なイニシアチブは、20カ国以上の国における生産能力構築を含む、大陸全体の病原体生産能力の強化を目標に、NGSツールと専門知識へのアクセスを拡大します。イルミナは4年間で約2,000万米ドル相当のNGSプラットフォーム、試薬、トレーニングサポートを寄付します。US $1億のイニシアチブのパートナー には、米国疾病対策予防センター、ビル&メリンダゲイツ財団、Oxford Nanopore Technologies、Microsoftなどが含まれます。
イルミナは、アフリカ大陸における遺伝子シーケンスと疾患発生サーベイランス機能の実現において、アフリカ病原体ゲノミクスイニシアチブを支援できることを誇りに思っています。パートナーと協力して公衆衛生上の脅威の科学的基盤を強化する中で、 NGSは初期の特性評価から病原体サーベイランス、感染拡大管理、パンデミック後のモニタリングまで、感染拡大のすべての段階で重要な役割を果たしています。私は、イルミナがNGSテクノロジーを提供するだけでなく、長期的な持続可能性に必要なトレーニングプログラム、データインフラストラクチャ、および政府サポートを提供するこの包括的なプログラムに参加していることをうれしく思います。
この新しいイニシアチブは、COVID-19や、HIV/AIDS、結核、マラリア、コレラ、その他の感染症などの風土病を含むその他の疾患の脅威に対する必須の研究と公衆衛生対応を促進し、支援します。大陸内のこれらの病原体からゲノム情報を得ることは、抗菌薬耐性と闘うための継続的な取り組みに不可欠です。これはおそらく、世界中で公衆衛生に対する最大の脅威です。このイニシアチブは、病原体サーベイランスのためのNGSの実装を加速するだけでなく、持続可能性を推進して能力を確実に維持することを目指しています。NGSの機能を初めて利用している研究室のネットワークは、アフリカ全土で病原体ゲノミクスとバイオインフォマティクスの能力を強化するために、2019年にアフリカCDCが立ち上げたInstitute of Pathogen Genomicsを補完するものです。
物理ラボネットワーク以外にも、病原体ゲノミクスのトレーニングプログラムであるNGS Academyも設立され、公衆衛生活動や研究者のためにゲノミクスデータを生成および翻訳するためのトレーニングやツールを公衆衛生機関に提供します。これにより、感染症ゲノミクスにおける国際的な協力に参加し、主導することができます。
イルミナでは、研究と協力し、リソースと提携することで、最高の結果が得られると考えています。この寄付は、当社の企業の社会的責任プログラムの一環であり、ゲノミクスへのアクセスを加速し、当社のテクノロジーだけでなく、行動を通じて人類にプラスの影響を与えるという当社の取り組みの表れです。
Africa Pathogen Genomics Initiativeの詳細については、ここをクリックしてください。
写真：Adeyinka Yusuf/iStock
