2020年11月16日
社内で包括的ゲノムプロファイリング(CGP)を実施している施設が増えており、この取り組みにはより効率的なオペレーションが必要です。固形腫瘍のCGPを可能にするイルミナの強力なプラットフォームであるTruSight Oncology 500(TSO 500)ポートフォリオは、2020年秋から複数の製品とアップデートをリリースします。新しい機能強化により、サンプルからレポートまでのワークフローが簡素化され、改善されます。自動化、より迅速なデータ解析、クラウドにデータを保存するオプションなどの機能により、お客様の時間と費用を節約し、サンプル量を増やすことができます。さらに、TruSight Oncology 500 ctDNAのパイプライン改善により、より高い分析感度と誤検出の低減が実現します。
新リリースはソフトウェアの更新と自動化だけではありません。イルミナのSVP兼最高製品責任者であるSusan Tousi氏は述べました。ラボが単独で立ち、よりシンプルかつ迅速でスケーラブルなワークフローを享受できる欠けている部分を表しています。
新しい機能強化:
· TSO 500用の自動化しやすいライブラリー調製キットとメソッド:ハンズオンタイムを最大50%短縮
・ TSO 500 HT ctDNA用のNovaSeq 6000 v1.5 Reagent Kitとの&互換性:シーケンス効率の向上により、サンプルシーケンスのコストを削減
· DRAGEN Bio-ITプラットフォーム、オンプレミスまたはクラウドの活用:超高速バリアントコールは、解析時間を最大10X短縮します。ローカルまたはクラウドで解析を実行する柔軟性により、個々のラボの要件を満たすことができます
· TSO 500 ctDNAのパイプライン強化: 免疫腫瘍学、新しい腫瘍分画測定基準(MSAF)に対するMSI感度の向上、新しいフィルタリングによる偽陽性の減少
サンプルから回答までのワークフローをさらに合理化するために、イルミナはTSO 500とTSO 500ハイスループットの両方のライブラリー調製自動化キットとメソッドをデビューさせています。このキットは、現在と2021年にそれぞれ入手可能です。自動化は人件費を節約し、手作業のエラーを減らし、ラボがサンプル数を増やす能力を促進します。(LTS HealthのTSO 500に関する第三者機関のレポートによると、自動化によりハンズオンタイムが半分に短縮されました。)
Providence Oregon Regional Laboratoryの腫瘍分子病理学および病理学インフォマティクスのメディカルディレクターであるCarlo Bifulcoは、アッセイを統合しバイオマーカーを見つけるためにCGPを採用しました。“CGPの展開により、ターゲット療法 の使用が大幅に増加し、広範囲の腫瘍組織学にわたってIO適合TMB-HおよびMSI-H症例の効率的かつ再現性のある 同定が可能になりました”と Bifulco博士は述べました。CGPをルーチンの病理学ワークフローに取り入れることで、医療提供者に関連性のある実用的な結果を迅速かつ一貫して提供できるようになりました。最後に、ゲノミクスデータの施設所有は、動的なジャストインタイムマッチングやその他の現実世界のエビデンスに基づく取り組みのための強固な基盤となり、腫瘍学の未来を推進します。
ニューヨークを拠点とするOmniSeqにとって、効率は重要です。このOmniSeqは、米国最大級のリファレンスラボのためのNGSベースの検査のコアプロバイダーです。“私たちの主な優先事項の1つは、高い需要に対応できることを確認することです”と、OmniSeqの最高科学責任者であるJeffrey Conroy氏は述べました。NovaSeq 6000で大量のTruSight Oncology 500 High-Throughputサンプルをバッチ処理し、Clarity LIMSを使用してアッセイのワークフローを追跡できることは、サンプルからレポートまでのターンアラウンドタイムをスケールアップし、短縮する上で非常に重要です。
TruSight Oncology 500製品に関するエキサイティングなニュースはこちらからご覧ください。
イルミナは、今年のAssociation for Molecular Pathology(AMP)バーチャルカンファレンスでTSO 500ポートフォリオの最新かつ最高の製品を発表します。ここでは包括的なトピックの1つがCGPです。イルミナの少数のお客様が、ワークショップでCGP実施の利点と側面について話し合います。
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TruSight Oncology 500の詳細はこちら:
リキッドバイオプシーとハイスループットアッセイによるTSO 500ファミリーの増殖
Phil Febbo博士によるリキッドバイオプシーのパワーと約束
TSO 500ポートフォリオに新たに加わった液体生検ハイスループットアッセイ
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