de novoシリーズ:DDBJパイプラインによるRNA-seq配列のde novoアセンブル【イルミナiSchool プロフェッショナル】

de novoシリーズ:DDBJパイプラインによるRNA-seq配列のde novoアセンブル【イルミナiSchool プロフェッショナル】

中村 保一 先生、長崎 英樹 先生、谷沢 靖洋 先生, 国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室
Topic: Sequencing : Informatics : Customer

遺伝研で解析パイプラインについて、またパイプライン内部のスパコン利用、DDBJパイプラインの概要などについてご講演いただきました。また、遺伝研で公開しているDDBJパイプライン上にてTrinityを実行し、公開RNA-Seq配列に対してde novoアセンブルするデモも実施いただきました。



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