Bru-Seq
Bru-Seq
Bru-Seqは、ブロモウリジンタグを用いて初期RNA転写産物をマッピングします。活性RNAPIIは、Br-UTPの存在下でRNAを合成します。タグ付きRNA転写産物は、抗BrdU抗体でコーティングされた磁気ビーズを使用して、全RNAから免疫分離されます。キャプチャーしたRNA転写産物は、RTおよびPCR増幅によるcDNA鎖の合成前に溶出および断片化されます。得られたcDNA鎖は、Illumina TruSeq RNA Library Prep Kitを用いてシーケンス用に調製されます。
長所：
- 最新のRNA転写産物のシーケンスをマッピングし、相対的な転写速度を判定
- lncRNAを検出 1
- ゲノム上のあらゆる場所で転写を検出
短所：
- 標識されたヌクレオチドの存在下でのインキュベーションが要求されるため、細胞培養およびその他の人工システムに限定