OS-Seq
OS-Seq
オリゴヌクレオチド選択的シーケンス（OS-Seq） は、フローセル上で直接遺伝子ターゲットを捕捉してシーケンスすることにより、ターゲットリシーケンスを改善するために開発されました。この方法では、アダプターを用いたターゲットシーケンスを用いてフローセルプライマーを修飾します。テンプレート内のターゲットは、修飾プライマーでフローセルに捕捉されます。さらなる伸長、変性、ハイブリダイゼーションにより、ターゲット遺伝子のシーケンスリードが得られます。ディープシーケンスはリードを正確に表現します。
長所：
- 一度に複数のターゲットのシーケンスを変更できます
- ゲルの除去や狭いサイズの精製が不要
- 超高速（シングルデイ）プロトコール
- サンプルはマルチプレックス可能
- 増幅ステップの除去によるPCRバイアスの低減
- 材料の損失を回避
短所：
- プライマーは同様のターゲットシーケンスと相互作用し、シーケンスの曖昧さにつながる可能性があります
- Markkula N., Suvisaari J., Saarni S. I., Pirkola S., Pena S., et al. （2015）Finish Health 2011 Surveyの11年間の追跡調査結果における大うつ病性障害と気分不快症の有病率と相関。J Affect Disord 173：73-80
- Vattulainen S., Aho J., Salmenperä P., Bruce S., Tallila J., et al. （2015）オリゴヌクレオチド選択シーケンスを用いたフィンランドの肺動脈性肺高血圧症患者の正確な遺伝子診断。分子遺伝学&ゲノム医学3：354-362
- Hopmans E. S., Natsoulis G., Bell J. M., Grimes S. M., Sieh W., et al. （2014）超並列ターゲットシーケンスのためのプログラム可能な手法。核酸 Res 42: e88