エクソームシーケンスは、全ゲノムシーケンスに代わる費用対効果の高い方法として、ゲノムのタンパク質コード領域を解析します。HiSeq 4000システムは、1ランあたり最大96エクソーム*のシーケンスが可能です。
アプリケーションノート:HiSeq 4000システムのゲノム、エクソーム、トランスクリプトーム解析
*2 × 75 bpリードを用いて、ターゲットの80%で100×カバレッジを想定。
2~3時間
小規模、構造的、コピー数バリアントコーリング、バリアントアノテーション、エンリッチメントメトリクス計算のための迅速なアライメントとバリアント検出。
大規模で複雑なゲノム(ヒト、植物、または動物)の全ゲノムシーケンス(WGS)解析は、疾患または集団ゲノミクスの研究に情報を提供するために、ゲノム変異のベースごとのビューを提供します。HiSeq 4000システムは、ランあたり最大12のヒトゲノム*をシーケンスできます。
アプリケーションノート:HiSeq 4000システムのゲノム、エクソーム、トランスクリプトーム解析
*ヒトゲノムの>30倍カバレッジを想定。
5時間/4時間のハンズオン
複雑なゲノムを正確かつ包括的にカバーする、シンプルで包括的なWGSライブラリー調製。
5~7時間
Isaacアライメントとバリアントコーリングを使用して、全ゲノムシーケンスから生物学的情報を迅速に抽出します。
コーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAの両方をトータルRNAシーケンス(RNA-Seq)で解析し、トランスクリプトームの包括的なビューを得ます。HiSeq 4000システムは、ランあたり最大100トランスクリプトーム*のシーケンスが可能です。
アプリケーションノート:HiSeq 4000システムのゲノム、エクソーム、トランスクリプトーム解析
*サンプルあたり5,000万リードを想定。
10.5時間/4.5時間ハンズオン
全RNA解析のための合理化されたコスト効率の高いスケーラブルなソリューションによるトランスクリプトームの明確で包括的なビュー。
シーケンサーを用いたDNAメチル化解析により、高いカバレッジ密度と柔軟性を実現し、エピジェネティクス研究を強化します。
mRNAシーケンス(mRNA-Seq)は、既知および新規の転写産物を検出し、転写産物の量を測定し、正確で包括的な発現プロファイリングを実現します。
RNAコード領域の配列特異的キャプチャーを使用して、RNAエクソームの既知および新規の特徴の両方を検出します。
クロマチン免疫沈降(ChIP)アッセイとシーケンサーを組み合わせたChIPシーケンス(ChIP-Seq)は、全ゲノムの遺伝子制御調査を行うための強力な手法です。
ターゲットリシーケンスは、研究対象の遺伝子またはゲノム領域のサブセットのみのシーケンスに時間、費用、および解析を集中させます。
小規模ゲノムシーケンスは、公衆衛生、疫学、疾患研究のための微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を提供します。
De Novo参照配列の存在しない新規のゲノム配列のシーケンスを意味します。NGSは、あらゆる生物種の迅速かつ正確な特性解析を可能にします。
複雑な微生物叢や研究が困難な環境から細菌を同定し、比較するための培養不要の方法。
リボソームプロファイリングは、細胞翻訳プロセスの系統的なモニタリングとタンパク質の存在量の予測を可能にします。
microRNAなどの小さなRNA種を単離してシーケンスし、遺伝子サイレンサーや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。
微生物群集全体のシーケンスにより真のメタゲノム解析を行い、重要な分類学的および機能的情報を発見します。
シーケンスによるジェノタイピングは、新しい植物や動物のSNPを発見し、ジェノタイピング研究を行うための低コストの遺伝子スクリーニング手法を提供します。
次世代シーケンサーは、アレイベースの細胞ゲノム解析を補完するために、塩基ごとのゲノムワイドな染色体変異の検出を提供します。
ターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)は、遺伝子発現の解析と融合遺伝子の同定に使用される特定の目的の転写産物に焦点を当てています。
ターゲット遺伝子シーケンスパネルには、特定の関心遺伝子に焦点を合わせたプローブセットが含まれています。事前に設計されたパネルとカスタムパネルの両方が利用可能です。
RNA-Seqを利用して、RNAベースの薬物応答バイオマーカーを発見し、プロファイリングする方法をご覧ください。新規ユーザーがこのアプリケーションを使用するためのリソースにアクセスできます。
BeadChipから、ゲノム、トランスクリプトーム、またはエピゲノム研究のためのライブラリーの準備、シーケンサーの選択、解析、サポートまで、すべて1か所で必要な情報にアクセスできます。研究用途に応じて特別に設計された包括的なガイドを使用して、ラボに最適なツールを選択してください。
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