HiSeq 3000システム | HiSeq 4000システム | |
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ランあたりのフローセル数 | 1 | 1または2 |
データ収量 - 2 × 150 bp | 650~750 Gb | 1300~1500 Gb |
データ収量 - 2 × 75 bp | 325~375 Gb | 650~750 Gb |
データ収量 - 1 × 50 bp | 105~125 Gb | 210~250 Gb |
フィルターを通過するクラスター(フローセルあたり8レーン) | 最大25億のシングルリードまたは5B億のペアエンドリード | 最大5Bシングルリードまたは10B PEリード |
クオリティスコア - 2 × 50 bp | Q30を超える≥ 85%塩基 | Q30を超える≥ 85%塩基 |
クオリティスコア - 2 × 75 bp | Q30を超える≥ 80%塩基 | Q30を超える≥ 80%塩基 |
クオリティスコア - 2 × 150 bp | Q30を超える≥ 75%塩基 | Q30を超える≥ 75%塩基 |
毎日のスループット | > 200 Gb | > 400 Gb |
ランタイム | < 1~3.5日間 | < 1~3.5日間 |
1ランあたりのヒトゲノム* | 最大6 | 最大12 |
1ランあたりのエクソーム† | 最大48 | 96まで |
ランあたりのトランスクリプトーム‡ | 50まで | 最大100 |
イルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様を、サポートされているクラスター密度(1310~1524 K/mm 2パスフィルター)でインストールします。ランタイムはシーケンスのみに対応します。性能は、サンプルの品質、クラスター密度、その他の実験的要因によって異なる場合があります。
*ヒトゲノムを>30倍カバーすると仮定。
†2 × 75 bpリードを用いて、ターゲットの80%で100×カバレッジを想定。
‡サンプルあたり5,000万リードを想定。
ランあたり最大15億Tbと50億リードを生成します。HiSeq 3000/HiSeq 4000シーケンスシステムの詳細はこちら。
スペックシートを見るHiSeq 3000/HiSeq 4000システムは、業界 で最も広く採用されている次世代シーケンサー(NGS)テクノロジーであるSequence by Synthesis(SBS)テクノロジーを活用して、高いデータ品質を確保しています。SBSは、イルミナのすべてのシーケンスプラットフォームで採用されている実績のあるテクノロジーです。このテクノロジーは、独自の蛍光標識可逆的ターミネーター法を用いて、超並列シーケンスをサポートします。
HiSeq 3000/HiSeq 4000システムは、革新的なパターン化フローセルテクノロジーを採用しており、多様なシーケンスアプリケーションに並外れたレベルのスループットを提供します。パターン化フローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。