HiSeq 3000/HiSeq 4000システムの品質と性能

合成ケミストリーとパターン化フローセルテクノロジーによるイルミナシーケンスにより、ハイスループットでコスト効率の高いNGSを実現

HiSeq 3000/HiSeq 4000の仕様

  HiSeq 3000システム HiSeq 4000システム
ランあたりのフローセル数 1 1または2
データ収量 - 2 × 150 bp 650~750 Gb 1300~1500 Gb
データ収量 - 2 × 75 bp 325~375 Gb 650~750 Gb
データ収量 - 1 × 50 bp 105~125 Gb 210~250 Gb
フィルターを通過するクラスター(フローセルあたり8レーン) 最大25億のシングルリードまたは5B億のペアエンドリード 最大5Bシングルリードまたは10B PEリード
クオリティスコア - 2 × 50 bp Q30を超える≥ 85%塩基 Q30を超える≥ 85%塩基
クオリティスコア - 2 × 75 bp Q30を超える≥ 80%塩基 Q30を超える≥ 80%塩基
クオリティスコア - 2 × 150 bp Q30を超える≥ 75%塩基 Q30を超える≥ 75%塩基
毎日のスループット > 200 Gb > 400 Gb
ランタイム < 1~3.5日間 < 1~3.5日間
1ランあたりのヒトゲノム* 最大6 最大12
1ランあたりのエクソーム 最大48 96まで
ランあたりのトランスクリプトーム 50まで 最大100

イルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様を、サポートされているクラスター密度(1310~1524 K/mm 2パスフィルター)でインストールします。ランタイムはシーケンスのみに対応します。性能は、サンプルの品質、クラスター密度、その他の実験的要因によって異なる場合があります。
*ヒトゲノムを>30倍カバーすると仮定。
†2 × 75 bpリードを用いて、ターゲットの80%で100×カバレッジを想定。
‡サンプルあたり5,000万リードを想定。

HiSeq Xシリーズスペックシート

HiSeq 3000/HiSeq 4000システムの評価

ランあたり最大15億Tbと50億リードを生成します。HiSeq 3000/HiSeq 4000シーケンスシステムの詳細はこちら。

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1塩基合成(SBS)テクノロジー

HiSeq 3000/HiSeq 4000システムは、業界 で最も広く採用されている次世代シーケンサー(NGS)テクノロジーであるSequence by Synthesis(SBS)テクノロジーを活用して、高いデータ品質を確保しています。SBSは、イルミナのすべてのシーケンスプラットフォームで採用されている実績のあるテクノロジーです。このテクノロジーは、独自の蛍光標識可逆的ターミネーター法を用いて、超並列シーケンスをサポートします。

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パターン化フローセルテクノロジー

 HiSeq 3000/HiSeq 4000システムは、革新的なパターン化フローセルテクノロジーを採用しており、多様なシーケンスアプリケーションに並外れたレベルのスループットを提供します。パターン化フローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。

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