システムパフォーマンス
| HiSeq 3000システム | HiSeq 4000システム | |
|---|---|---|
| ランあたりのフローセル数 | 1 | 1または2 |
| データ量- 150bp × 2 | 650～750Gb | 1300～1500Gb |
| データ量- 75bp × 2 | 325～375Gb | 650～750Gb |
| データ量- 50bp × 1 | 105～125Gb | 210～250Gb |
| パスフィルタークラスター数（フローセルあたり8レーン） | シングルリードで~25億、ペアエンドリードで～50億 | シングルリードで~50億、ペアエンドリードで～100億 |
| クオリティスコア- 50bp × 2 | 85%以上の塩基がQ30を超える | 85%以上の塩基がQ30を超える |
| クオリティスコア- 75bp × 2 | 80%以上の塩基がQ30を超える | 80%以上の塩基がQ30を超える |
| クオリティスコア- 150bp × 2 | 75%以上の塩基がQ30を超える | 75%以上の塩基がQ30を超える |
| 1日あたりのデータ量 | 200Gb以上 | 400Gb以上 |
| ラン時間 | 1日未満～3.5日 | 1日未満～3.5日 |
| ランあたりのヒトゲノム数* | ～6 | ～12 |
| ランあたりのエクソーム数† | ～48 | ～96 |
| ランあたりのトランスクリプトーム数‡ | ～50 | ～100 |
据付け仕様はイルミナのPhiXコントロールライブラリーを使い、サポート内のクラスター密度（1,310~1,524K/mm2パスフィルター）を基にしています。 ラン時間はシーケンスのみを含みます。 パフォーマンスはサンプルのクオリティ、クラスター密度、その他の実験要因によって異なります。
*ヒトゲノム30×超のカバレッジを想定。
†75bp x 2のリード長を使用し、ターゲットの80%で100×カバレッジを想定。
‡サンプルあたり5,000万リードを想定。
HiSeq 3000/HiSeq 4000システムを評価
ランあたり最大1.5Tbのデータを算出し、リード数は50億に達します。 HiSeq 3000/HiSeq 4000シーケンスシステムの詳細をご覧ください。
データシートを見る主要なテクノロジー
1塩基合成反応（SBS）テクノロジー
HiSeq 3000/HiSeq 4000システムは世界で最も広く導入されている次世代シーケンサー（NGS）技術である1塩基合成反応（SBSケミストリー）を採用しており、高いクオリティのデータをお届けします。 実績のあるSBSケミストリーは、すべてのイルミナシーケンスプラットフォームで使用されています。 このケミストリーは独自の蛍光標識された可逆的ターミネーター法により、大規模なシーケンスを可能にします。
パターンフローセル技術
HiSeq 3000/HiSeq 4000システムは革新的なパターンフローセル技術を採用し、幅広いシーケンスアプリケーションのために比類ないスループットを提供します。 パターンフローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。 これにより、シーケンスリード数とシステムからのトータルデータ出力量を飛躍的に向上させることができました。