NextSeq 550Dx システムの仕様
性能パラメーター
| リード長 | 150bp × 2 |
|---|---|
| 出力 | 90 Gb以上 |
| 合計ラン時間* | 35時間以下 |
| スループット | 8～96サンプル/ラン（アッセイに応じて変動） |
* クラスター形成、150 bp × 2 のデュアルインデックスされたシーケンス、試薬パージ、およびポストランウォッシュを含む。
パスフィルターリード数
| リード数 | 600 M以上のペアエンドリード |
|---|
クオリティスコア
| Q30以上の塩基 | 75%以上 |
|---|
その他の性能パラメーター
| 総精度 – 体細胞バリアントコーラー | 99.98%以上† |
|---|---|
| 総精度 – 生殖細胞バリアントコーラー | 99.99%以上† |
† 23の別々のクロモソームに亘って約13,000塩基を網羅し、幅広いGC含量（18%～87%）、インデル（最大25塩基対）、およびホモポリマー（7～13ヌクレオチド）を含む広範囲にわたる遺伝子を調べるためにデザインされた、代表的なアッセイを用いた場合。
ハードウェアのパラメーターおよび要件
| 電源要件 | 100–240 V AC @ 50/60 Hz、600 W (最大) |
|---|---|
| RFID無線 | 13.56 MHz |
| RFID電力 | 200 mW |
| LED | 520 nm、650 nm。レーザーダイオード：780 nm、Class IIIb |
| レーザー | Class 33Bダイオードが埋め込まれたClass 31レーザー製品 |
保管および取り扱い
| 温度 | 輸送および保管：-10 ～ 50°C. 操作条件：ラボ温度は19 ～ 25°C（22°C±3°C）に維持すること。 |
|---|---|
| RFID無線 | 13.56 MHz |
寸法
| 幅×奥行×高さ | 54 cm × 69 cm × 58.5 cm |
|---|---|
| 重量 | 84 kg（186 lbs） |
| 梱包重量 | 163 kg（360 lbs） |
装置制御コンピューター
| 本体 | Dual Intel® Xeon® E5-2648L v3 |
|---|---|
| CPU | 1.8 GHz |
| メモリ | 128 GB |
| ハードドライブ | 2 × 2 TB |
| オペレーティングシステム | Windows 10 |
ここに記載する仕様はクリニカルモードで使用される場合のものです。NextSeq 550Dx システムをリサーチモードで使用する場合にのみ適用される研究モード限定仕様はこのリンクからご確認いただけます。
NextSeq 550Dx システムスペックシート
NextSeq 550Dx システムのワークフローと柔軟性の詳細をご覧ください。1つの装置でIVD検査と臨床研究を実施できます。
スペックシートはこちら主なテクノロジー
Sequencing by Synthesisテクノロジー
NextSeq 550Dx システムでは、複数のアプリケーションにおいて精度の高いデータを取得し、堅牢な性能を発揮するために、イルミナの実績あるSequencing by Synthesis（SBS）テクノロジーを採用しています。SBS法では、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で伸長させて検出します。
SBSのビデオはこちら2チャネルSBSテクノロジー
NextSeq 550Dx システムでは、2チャネルSBSケミストリーを用いて効率的なシーケンスとデータ生成を実現します。2チャネルSBSでは、イルミナのシステムが誇る卓越した高い品質と精度を実現しながらサイクル数を減らし、データ処理時間を短縮することができます。
テクノロジースポットライトはこちらNextSeq 550Dx システムの使用目的
日本：
NextSeq 550Dx システムは生体試料から抽出した核酸分子の配列情報を解析する装置です。
米国：
NextSeq 550Dx システムは、装置上で体外診断（IVD）アッセイが行われている状況下で使用する場合、末梢全血またはホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織から抽出したヒトゲノムDNAから調製されたDNAライブラリーのターゲットシーケンスを目的としています。NextSeq 550Dx システムは、全ゲノムシーケンスやde novoシーケンスでの使用を意図していません。NextSeq 550Dx システムは、登録・記載済みの認可/承認済みのIVD試薬および解析ソフトウェアと併用されるものです。
欧州連合：
NextSeq 550Dx システムは、装置上で体外診断（IVD）アッセイが行われている状況下で使用する場合、DNAライブラリーのシーケンスを目的としています。NextSeq 550Dx システムは、登録、認証、または承認された特定のIVD試薬および解析ソフトウェアと併用されるものです。