CAP-Seq

CAP-seq

CAP-seqは、RNAPIIに固定されたRNAの5'末端をマッピングします。この方法では、RNA転写物をTerminatorエキソヌクレアーゼ、CIP、およびTAPで順次処理し、続いてリンカーライゲーションとRTからcDNAへ処理します。cDNAのディープシーケンスは、RNAPII転写産物の高解像度シーケンスを提供します。

長所:
  • RNAPIIにアンカーされたRNAをマッピング
短所:
  • 複数のステップと処理により、材料の損失につながる可能性があります