宿主と病原体の相互作用の遺伝学
感染症との闘いと治療法の発見の両方にとって重要なのは、疾患の病因、病原体の病原性、さらにヒトの微生物叢が病原体や治療法に対する反応にどのように影響するかを理解することです。次世代シーケンサー（NGS）は、研究者が宿主と病原体の相互作用を研究し、病原体がどのように疾患を引き起こすかを明らかにし、病原体感染メカニズムを探索するのに役立ちます。これらの要因を理解することで、公衆衛生上の決定に情報を与え、将来の潜在的な治療ターゲットを特定するのに役立ちます。
NGSは、宿主の微生物叢が免疫、ワクチンの有効性、または治療反応に影響を与えるかどうかに対処するだけでなく、病原体と宿主遺伝子発現の両方の影響と、それが疾患または治療に対する宿主反応にどのように影響するかを研究するために臨床研究でも使用できます。イルミナNGSを使用して宿主と病原体の相互作用の遺伝学を研究する主な利点は次のとおりです。
- 多様なサンプルセットをスクリーニングする拡張性
- 宿主、病原体、および微生物叢の機能解析を行い、結果を宿主反応に相関させるマルチオミクスアプローチを促進するソリューション
- プロジェクト規模に合わせた解析ソリューション
宿主-病原体トランスクリプトーム解析
NGSベースのRNAシーケンスは、宿主および病原体の遺伝子と転写産物の活性化/不活性化と発現レベルに関する貴重な情報を明らかにすることができます。これらの結果は、病原性プロセスにおける宿主と病原体の相互作用の役割と、疾患伝播に関与する生物学的経路を明らかにすることができます。さらに、メタトランスクリプトーム解析は、宿主、病原体、微生物コミュニティのメンバー間の複雑な相互作用を明らかにすることができます。
主な宿主と病原体の相互作用解析ワークフロー
関連ソリューション
マイクロバイオーム解析
ヒトの体内およびヒトの身体上にある微生物群集の研究により、研究者は健康や疾患における微生物の役割を理解することができます。
ショットガンメタゲノミクス
特定の複雑なサンプルに含まれるすべてのゲノムコンテンツを解析します。微生物コミュニティの機能の可能性を予測し、抗菌薬耐性と病原性遺伝子を検出し、微生物の多様性を評価し、微生物を培養なしで解析します。
微生物トランスクリプトミクス
RNAシーケンスは、細菌、ウイルス、その他の微生物転写産物を解析および定量化するための偏りのないアプローチを提供します。
感染症 & NGS
NGSは、新規病原体を同定し、わずか1つのSNPで異なる感染症株を区別し、複数のアッセイの必要性を置き換えることができます。
COVID-19宿主リスク&への対応
SARS-CoV-2ウイルスに対する宿主の遺伝的リスク因子と免疫系の反応を研究する方法を探ります。