イルミナのライブラリー調製製品シリーズ全般で利用可能な自動化オプションを活用することで、エラーを最小限に抑え、ハンズオンタイムを短縮し、さらなるハイスループットを実現します
自動リキッドハンドリングシステムの導入により、ラボでは作業効率を向上させながら、安定した実験結果を得ることができます。NGSライブラリー調製の自動化を活用することで、ハンズオンタイムを短縮しながらスループットを迅速にスケーリングすることができます。
イルミナは主要ベンダーと提携して、イルミナのライブラリー調製キットの自動化プロトコールを開発しています。そのため、パートナーの自動化に関する知見とイルミナのライブラリー調製およびシーケンシングの専門知識を活かしつつ、お客様に最適なNGSソリューションを提供することができます。
このガイドでは、NGSライブラリー調製に活用できるさまざまな自動化ツールについてご紹介しており、ご使用のアプリケーション、スループット、予算のニーズに合わせたソリューションをお選びいただけます。自動ライブラリー調製プロトコールを構築する際の主な考慮事項についても詳しくご説明します。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。
手法は、イルミナの意見を取り入れて自動化パートナーが開発します。イルミナは、これらの手法により得られたシーケンスデータを評価し、性能とデータ品質を確保しています。当社のパートナーは、これらの手法を所有し、供給、設置、およびサポートを行います。当社のパートナーは、自社のリキッドハンドラーシステムに対するサービスおよびサポートを行います。
この手法は、イルミナが自動化パートナーと共同開発し、テストを行います。当社のパートナーは、これらの手法を所有し、供給、設置を行います。イルミナは、これらの手法に関するフロントラインの現場サポートおよびテクニカルサポートを提供します。* 当社のパートナーは、これらの手法に関する二次的なサポートを提供します。当社のパートナーは、自社のリキッドハンドラーシステムに対するサービスおよびサポートを行います。
これらの手法は、自動化パートナーが開発し、テストを行います。イルミナは、これらの手法から得られたデータの評価は行いません。当社のパートナーは、これらの手法を所有し、設置、サポートを行います。当社のパートナーは、自社のリキッドハンドラーシステムに対するサービスおよびサポートを行います。
どのライブラリー調製キットがどのリキッドハンドリングプラットフォームで自動化されているかを確認したり、特定のプラットフォームに対応したイルミナ認定の手法やパートナー開発の手法を検索したりできます。
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| Beckman Coulter | Eppendorf | Hamilton | Revvity | Tecan | |
| AmpliSeq for Illumina** |
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NGS STAR NGS STARlet |
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| AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2** |
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Sciclone G3 NGSx | ||
| AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3** |
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| AmpliSeq for Illumina Focus Panel** |
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Sciclone G3 NGSx | ||
| COVIDSeq Assay（96サンプル） | Biomek i7 | epMotion 5075t | NGS STAR |
Zephyr G3 NGS |
Fluent DreamPrep |
| COVIDSeq テスト（RUOバージョン） | epMotion 5075t | NGS STAR |
Zephyr G3 NGS |
Fluent DreamPrep | |
| Illumina Complete Long Read Prep, Human | epMotion 5075t |
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| Illumina DNA PCR-Free Prep | Biomek i5
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Fontus NGS
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| Illumina DNA Prep | Biomek i5
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Zephyr G3 NGS |
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| Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment |
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DreamPrep |
| Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment |
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NGS STAR
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| Illumina RNA Prep with Enrichment | Biomek i5
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NGS STAR |
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DreamPrep |
| Illumina Stranded mRNA Prep |
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DreamPrep |
| llumina Stranded Total RNA Prep |
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DreamPrep | |
| Nextera XT DNA |
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Zephyr G3 NGS |
DreamPrep |
| Pillar Biosciences oncoReveal Solid Tumor v2 Gene Panel Kit |
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| TruSeq DNA Nano |
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Sciclone G3 NGSx |
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| TruSeq DNA PCR-Free |
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NGS STAR |
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| TruSeq Stranded mRNA |
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Zephyr G3 NGS |
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| TruSeq Stranded Total RNA |
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Zephyr G3 NGS |
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| TruSight Oncology 500 | Biomek i5
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epMotion 5075t |
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DreamPrep |
| TruSight Oncology 500 ctDNA v2 |
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| TruSight Oncology 500（DNAのみ） | Biomek i5 Biomek i7
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| TruSight Oncology 500 High Throughput |
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DreamPrep | ||
| TruSight RNA Pan-Cancer Panel |
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epMotion 5075t | |||
| TruSight Tumor 15 |
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| TruSight Tumor 170 |
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2022年1月より、Hamiltonは、TruSight Oncologyライブラリー調製用のNGS STAR構成をSBS STAR (LSA)として参照します。既存のイルミナ認定手法はすべて下位互換性があり、この変更は名前のみのものであるため、このシステムで引き続き実行されます。
**自動化プラットフォームに関連する高いデッドボリューム要件や、元の試薬メーカーによるオーバーフィル量の変動に対応するため、1キットあたりのライブラリーの最大数を調製する場合、複数のAmpliSeq for Illuminaキットが必要になる場合があります。
事前設定されたラボ情報管理システム（LIMS）プロトコールにより、サンプルの追跡、ランの管理、および実運用への移行を実現します。互換性のあるロボットリキッドハンドラーを活用して、高速ハイスループットシーケンスとデータ解析のためのライブラリーを調製します。
ラボの最適化と効率化を目指して、サンプルを追跡し、ワークフローを管理できるように設計されたラボ情報管理システム（LIMS）です。
最大16 Tbの出力を実現し、1回のランで128のヒトゲノムを30倍のカバレッジでシーケンスできるシステムです。
ほぼすべてのゲノム、シーケンス手法、およびプロジェクト規模に対応した拡張性のあるスループットと柔軟性を実現します。
Illumina DRAGEN Secondary Analysis
NGSデータを正確、包括的かつ効率的に二次解析します。
三次解析の臨床研究ワークフローをサポートする包括的な研究ソフトウェアプラットフォームです。
Fragment Analyzerシステムは、単離された核酸や調製されたライブラリーの品質と量を正確に評価し、シーケンス中のクラスター形成を最適化します。
この合理化された自動ワークフローは、高度に均一なライブラリーを生成し、種の同定、メタゲノムプロファイリング、新規ゲノムアセンブリに最適なデータを提供します。
COVIDSeq AssayおよびCOVIDSeqテスト（RUO）のワークフローは、さまざまな自動化ソリューションと互換性があり、8～96個のサンプルのバッチサイズに設定可能です。
Exome 2.5 EnrichmentによるIllumina DNA Prepの自動化ワークフロー
このワークフローは、手動のワークフローと比較して、ハンズオンタイムが短く、一貫した高品質のデータにより、Hamilton SBS STARlet Automated Liquid Handling Platformでのライブラリー調製と濃縮を自動化します。
自動化パートナーとイルミナ認定手法の詳細については、お問い合わせください。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。