アプリケーション | 固形腫瘍(スモールパネル) | 固形腫瘍(ラージパネル) | リキッドバイオプシー(ラージパネル) | ||||||||
製品名 | AmpliSeq™ for Illumina Focus Panel | TruSight™ Tumor 15 | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | AmpliSeq for Illumina BRCA Panel | TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 HT | TruSight Tumor 170 | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel | Trusight Oncology 500 ctDNA | |
遺伝子数 | 52 | 15 | 50 | 2 | 523 | 523 | 170 | 161 | 409 | 523 | |
サンプルタイプ | DNA, RNA | DNA | DNA | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA | cfDNA | |
インプット量 | 10 ng DNA* 10 ng RNA* |
20 ng* | 10 ng* | 20 ng* | 40 ng DNA* 40 ng RNA* |
40 ng DNA* 40-80 ng RNA* |
40 ng DNA* 40 ng RNA* |
20 ng DNA* 20 ng RNA* |
40 ng DNA* | 30ng | |
検出バリアント | SNV/InDel | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 |
CNV | 〇 | 〇 | × | × | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | |
融合 | 〇 | × | × | × | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | × | 〇 | |
スプライスバリアント | × | × | × | × | 〇 | 〇 | 〇 | × | × | 〇 | |
発現 | × | × | × | × | × | × | × | × | × | × |
* FFPE対応。分解度によってはインプット量を増やす必要があります。
アプリケーション | 血液学 | 生殖細胞系列 | がん全般 | がん免疫、発現解析 | |||
製品名 | TruSight Myeloid | TruSight Cancer | AmpliSeq for Illumina BRCA Panel | TruSight RNA Pan-Cancer | TruSight RNA Fusion | AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel | |
遺伝子数 | 54 | 94 | 2 | 1,385 | 507 | 395 | |
サンプルタイプ | DNA | DNA | DNA | RNA | RNA | RNA | |
インプット量 | 50 ng | 50 ng | 20 ng* | 10 ng total RNA 20–100 ng* | 10 ng total RNA 20–100 ng* | 10 ng* | |
検出バリアント | SNV/InDel | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | × | × |
CNV | × | × | × | × | × | × | |
融合 | × | × | × | 〇 | 〇 | × | |
スプライスバリアント | × | × | × | × | × | × | |
発現 | × | × | × | 〇 | × | 〇 |
* FFPE対応。分解度によってはインプット量を増やす必要があります。