Act-Seq
Act-Seq
Act-Seqは、scRNA-Seqワークフローでよく見られる人為的に誘導される転写摂動を最小限に抑えます。これは、3つの真核生物RNAポリメラーゼすべての転写阻害剤であるアクチノマイシンD（actD）で解離した細胞を直ちに処理することで達成されます。著者らは、従来の解離法を用いたscRNA-Seq実験でよく見られる解離誘発性即時早期遺伝子（IEG）の活性化を阻害する上で、actD治療が特に重要であることを示しました。個々の細胞のscRNA-SeqはDrop-Seq法を用いてアッセイされます。この方法は、外部刺激時に急性転写変化を調べるのに最適です。
公開：2017年10月
長所：
- RNA含有量が少ない細胞タイプや細胞質RNAのキャプチャーが重要な細胞タイプに最適
- 細胞解離によって誘発される遺伝子発現の活性化を排除
- 免疫染色後の核のフローソーティングに依存しない
短所：
- カスタムマイクロ流体システムが必要（Drop-Seq）
- まだなし