デジタルRNA

デジタルRNA

デジタルRNAシーケンスは、増幅前にRNA分子をバーコード化することで、シーケンス依存のPCR増幅バイアスを除去するRNA-Seqへのアプローチです。RNAはcDNAに逆転写され、それぞれに固有のバーコードを持つ過剰なアダプターが調製物に追加されます。このバーコード付きcDNAは増幅され、シーケンスされます。ディープシーケンスリードを比較し、バーコードを用いてRNA存在量の実際の分布を判定します。

長所:
  • PCR中の低い増幅バイアス
  • RNAの豊富さに関する情報を提供します
  • 低コピー数RNAの検出
  • シングルコピー解像度
短所:
  • 一部の増幅バイアスは依然として持続します
  • バーコードはライゲーション中にターゲットを見逃す可能性があります