TruSeq Targeted RNA Expression Kitは、カスタム化が可能な中〜高プレックスの遺伝発現プロファイリングおよび検証をベンチトップ型シーケンサーで実施できます。
12から1000のアッセイをデザインできるパネルでは、遺伝子、アイソフォーム、スプライスジャンクション、cSNP、遺伝子融合、ノンコーディングRNA転写産物をターゲットとすることができ、さらに384 サンプルまでのマルチプレックス解析ができます。わずか1回のランで25,000ものRT-PCRアッセイに相当するデータを産出することができます。**
オンラインでの便利なパネルデザイン、わずか50ng RNAからスタートできる迅速で簡便なワークフロー、装置内での自動化されたデータ解析を利用できます。
カスタムターゲットプロジェクトのためのオンラインデザインツールDesignStudioでプロジェクトを開始できます。
TruSeq Targeted RNA Expression Kitで細胞周期パネルとNFκBパネルを併用して、Brain Reference RNA(HBRR)、Universal Human Reference RNA(UHRR)、およびヒト肝臓RNAのサンプルを調製しました。
MiniSeq High Outputキットを用いて、1 x 51 bpリード長の条件で、これらのライブラリーをMiniSeqでシーケンスしました。合計収量は2.04 Gbで、塩基の96.5%がQ30以上でした。
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(BaseSpaceアプリでの二次解析)
*カタログ番号 SY-410-1001 およびアップグレード、またはカタログ番号 SY-410-1003 の装置の場合。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
---|---|---|
MiniSeq System | Samples per run will depend on panel size. | 1 x 50 bp |
MiSeq System | Samples per run will depend on panel size. | 1 x 50 bp |
NextSeq 550 System | Samples per run will depend on panel size. | 1 x 50 bp |
Considerations for Designing a Successful TruSeq Targeted RNA Expression Experiment
Technical Note | PDF < 1 MB
Expression Analysis of FFPE Samples
Technical Note | PDF 1 MB
TruSeq Targeted RNA Expression Data Sheet
Data Sheet | PDF < 1 MB
TruSeq Targeted RNA Expression Kit Documentation
TruSeq Targeted RNA Expression Reference Guide Documentation
Illumina Experiment Manager User Guide Documentation
カスタムプロトコルセレクタ
Generates customized, end-to-end instructions
TruSeq ターゲットRNA 発現解析用固定パネル(TruSeq Targeted RNA シリーズ:p53、神経変性、アポトーシス、幹細胞など)は、8月末をもって販売を終了いたしました。今後はカスタムRNAパネル製品 TruSeq Targeted RNA Expression custom panels のご利用をお勧めいたします。