NovaSeq 6000Dx Instrument Specifications
クリニカルラボ向けの医療機器届出済のハイスループットシーケンサー
出力、ランタイム、リード長、サンプルスループット、その他のNovaSeq 6000Dx システムの仕様を詳しく見てみましょう。
装置性能パラメーター — IVDモード
フローセルあたりの出力
NovaSeq 6000Dx システム性能パラメーター(•,†)
| フローセルタイプ | リード長 | 出力 | 1ランあたりのリード数（‡） | ランタイム | データ品質（¶） |
|---|---|---|---|---|---|
| S2 | 2 x 150 bp | ≥ 1 Tb | ≥ 6.67 B | 40時間以下 | ≥ 85% Q30 |
| S4 | 2 x 150 bp | ≥ 3 Tb | ≥ 20 B | 45時間以下 | ≥ 85% Q30 |
• Illumina DNA Prep with Enrichment Dx（日本では販売はありません）で作成されたライブラリー
† RUOモードでの性能パラメーターについては、NovaSeq 6000 システムの仕様を参照してください。
‡ フローセルごとのペアエンドリード
¶ Q30のクオリティスコアは、1000ベースコールあたりのエラー数1に相当します。
NovaSeq 6000Dx システムの仕様
設置セットアップおよび付属品
内蔵制御コンピューター
- CPU： i7-8700T CPU搭載Axiomtek MANO525
- メモリー：2 × 8 GB DDR4 SODIMM
- ハードドライブ：なし
- ソリッドステートドライブ(SSD)：256 GB 2242 M.2
- オペレーティングシステム：Windows 10
- 備考：コンピューター構成は定期的にアップグレードされます。現在の構成については、担当者にお問い合わせください
動作環境
- Base Unit: Mini-ITX SBC w/ Intel i7-8700T
- 温度：19℃～25℃（22℃±3℃）、1時間あたりの温度変化<2℃
- 湿度：相対湿度20%～80%、結露なきこと
- 高度：2000メートル未満
- 換気：最大8530BTU/hおよび平均6000BTU/h
- 屋内専用
レーザー
- クラス1レーザー製品：532 nm、660 nm、780 nm、790 nm
寸法
- 幅×奥行×高さ：80.0 cm × 94.5 cm × 165.6 cm (モニター含む）
- 重量：481 kg、リークトレイの場合は3.5 kg、キーボードとマウスの場合は0.9 kgを含む。梱包重量：628 kg
電源要件
- 200～240 VAC 50/60Hz、16A、単相、2500 W
- 使用地域に対応した無停電電源装置（UPS）を提供
無線自動識別タグ（RFID）
- 周波数：13.56 MHz
- 電源：供給 3.3 V DC ± 5%、電流120 mA、RF出力200 mW
ネットワーク接続
- システムからデータ管理システム間は、1 Gb接続専用。直接またはネットワークにより接続。
ネットワーク接続の帯域幅
- 装置1台につき200 Mb/s：内部ネットワークでのアップロード
- 装置1台につき200 Mb/s：BaseSpace Sequence Hubでのアップロード
- 装置1台につき5 Mb/s：装置のオペレーションデータのアップロード
表示する仕様は診断（IVD)モードで使用する場合の仕様です。NovaSeq 6000Dx システムを研究（RUO）モードで実行する場合にのみ適用される研究モードの仕様のみを示しています。
データ解析テクノロジー
各NovaSeq 6000Dx システムには、一組になって提供されるDRAGEN サーバーが付属しており、二次解析を加速するためのライセンスが含まれています。
ラン管理テクノロジー
NovaSeq 6000Dx システム用のIllumina Run managerは、シーケンスシステムと完全に統合されています。この直感的なインターフェースは、装置上またはリモートでアクセスでき、DRAGEN サーバー上のユーザーおよび機器の管理、アプリケーション構成、ランセットアップ、二次解析モジュールを制御できます。IVDおよびRUOモードで、シーケンスランを計画および開始し、オーディットトレイルでライブラリーを追跡し、ランの進捗状況を監視します。
Sequence by Synthesis（SBS）テクノロジー
NovaSeq 6000Dx システムは、実績あるイルミナSBSテクノロジーを採用しています。SBSケミストリーは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法を使用します。この手法では、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出し、数十億もの配列を並行して読み取ります。
パターン化フローセルテクノロジー
NovaSeq 6000Dx システムは、パターン化フローセルテクノロジーを取り入れ、幅広いシーケンスアプリケーションのための高レベルのスループットを生成します。パターン化フローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。