Illumina DNA Prep with Enrichment Dxは、幅広いアプリケーションに対応する、高速で統合されたワークフローです。血液、ゲノムDNA、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織など、幅広いDNAインプット範囲と複数のサンプルタイプをサポートします。
アプリケーションノート：
NovaSeq 6000Dx システムのターゲットエンリッチメント
NovaSeq 6000Dx システムアプリケーションと方法
NovaSeq 6000Dx システムアプリケーション
デュアルモードの操作により、IVD検査と臨床研究の両方が可能になり、さまざまなサンプルタイプ、シーケンス手法、アプリケーションに新たな可能性が広がります
主な診断アプリケーション
ターゲットエンリッチメント
ライブラリー調製
シーケンス
NovaSeq 6000Dx システム用の試薬は、IVDに準拠した、すぐに使用可能な、クラスター形成およびSBS用のカートリッジベースの試薬です。
解析
NovaSeq 6000Dx システム用のIllumina DNA Prep with EnrichmentのDRAGEN
DRAGEN サーバーは、NovaSeq 6000Dx システム用のDRAGENとIllumina DNA Prep with Enrichment Dx用の専用解析モジュールを備えた、精確で超高速なNGS二次データ解析用のFPGAチップを内蔵しています。
主な臨床研究アプリケーション（研究（RUO）モード）
ライブラリー調製
ヒト全ゲノムシーケンスなどの高感度アプリケーション用の、高性能で迅速な統合ワークフロー。
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物種まで、広範囲のアプリケーションに対応可能な、迅速な統合ワークフロー。
全ゲノムシーケンスのライブラリーを生成し、少量のDNAしか得られないサンプルを効率的に解析します。
複雑なゲノムを精確かつ包括的にカバーする、シンプルで包括的な全ゲノムシーケンス（WGS）ライブラリー調製。
シーケンス
NovaSeq 6000用の試薬キットには、クラスター形成およびSBS用の、すぐに使用できるカートリッジベースの試薬が含まれています。研究（RUO）モードのNovaSeq 6000Dx システムは、RUO試薬キットに対応しています。
解析
FPGAチップを内蔵したDRAGEN Germlineは、NovaSeq 6000Dx システム 研究（RUO）モード用のDRAGENによる高精度超高速NGS二次解析を実現します。
Illumina BaseSpace Sequence HubまたはスタンドアロンDRAGEN サーバー（別売り）で、DRAGEN GermlineまたはDRAGEN Somaticを活用して、精確で包括的、効率的な二次解析を行います。
BCL Convert
RUOモードでNovaSeq 6000Dx DRAGENサーバーを使用して、BCLファイルをFASTQに変換します。
変換済みFASTQファイルをインプットとして使用し、カスタム二次解析を実行することで、ユーザーによる操作を最小限に抑え、ワークフローの効率を向上させます。
FASTQ ORA可逆圧縮により、ストレージコストと運用コストを最大5分の1まで削減します。
ライブラリー調製
Illumina DNA Prep with Enrichment
カスタムパネル、固定パネル、全エクソーム濃縮のためのターゲットリシーケンスを提供する、幅広いアプリケーションに対応した迅速な統合ワークフロー。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、高速、完全な全エクソームシーケンスキット。
シーケンス
NovaSeq 6000用の試薬キットには、クラスター形成およびSBS用のそのまま使えるカートリッジ式の試薬が含まれています。研究（RUO）モードのNovaSeq 6000Dx システムは、RUO試薬キットに対応しています。
解析
NovaSeq 6000Dx システムと一組になって提供されるDRAGEN サーバー
RUOモードで、Illumina DRAGEN for Illumina DNA Prep with Enrichment（IDPE）アプリを活用して、精確で効率的な二次解析を行います。
BCL Convert
RUOモードでNovaSeq 6000Dx DRAGENサーバーを使用して、BCLファイルをFASTQに変換します。
変換済みFASTQファイルをインプットとして使用し、カスタム二次解析を実行することで、ユーザーによる操作を最小限に抑え、ワークフローの効率を向上させます。
FASTQ ORA可逆圧縮により、ストレージコストと運用コストを最大5分の1まで削減します。
ライブラリー調製
TruSight Oncology 500 High-Throughput (HT)
TruSight Oncology 500 HTは、より高いサンプルスループットとバッチオプションに対する柔軟性により、腫瘍サンプルの社内での包括的なゲノムプロファイリングを可能にします。DNAとRNAのコンテンツは、すべてのDNAとRNAバリアントタイプに加えて、TMBとMSIの評価のために、523の遺伝子をターゲットにしています。ハンズオンタイムとスケーラビリティを削減するために、自動化キットとメソッドを利用できます。
シーケンス
柔軟なサンプルバッチ処理により、RUOモードのNovaSeq 6000Dx システムで、シーケンスフローセルあたり16～192のサンプル処理が可能となります。NovaSeq 6000用の試薬キットには、クラスター形成およびSBS用のそのまま使えるカートリッジ式の試薬が含まれています。研究（RUO）モードのNovaSeq 6000Dx システムは、RUO試薬キットに対応しています。
解析
スタンドアロンのDRAGENサーバーまたはIllumina Connected Analytics（ICA）
DRAGENパイプラインによる迅速なバリアントコーリングアルゴリズム。独立したスタンドアロンのDRAGEN サーバーでローカルに利用可能。安全でスケーラブルなクラウドベースのバリアントコールは、自動起動機能を備えたIllumina Connected Analytics（ICA）のDRAGENパイプラインでも利用できます。
NovaSeq 6000Dx システムの使用目的
米国：
NovaSeq 6000Dx システム、in vitro（IVD）診断アッセイと併用する場合、末梢血またはホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織から抽出されたヒトゲノムDNAからDNAライブラリーのターゲットシーケンスを目的としています。NovaSeq 6000Dx システム、全ゲノムシーケンスまたはde novoシーケンス用ではありません。NovaSeq 6000Dx システム、特定の登録済み、認定済み、または承認済みのIVD試薬および解析ソフトウェアと併用するように設計されています。
欧州連合/その他：
NovaSeq 6000Dx システム、体外診断（IVD）アッセイと併用する場合のDNAライブラリーのシーケンスを目的としています。NovaSeq 6000Dx システム、特定の登録済み、認定済み、または承認済みのIVD試薬および解析ソフトウェアと併用するように設計されています。