フローセルタイプ | リード長 | 出力 | 1ランあたりのリード数(‡) | ランタイム | データ品質 (¶) |
---|---|---|---|---|---|
S2 | 2 x 150 bp | ≥ 1 Tb | ≥ 6.67 B | ≤ 40時間 | ≥ 85% Q30 |
S4 | 2 x 150 bp | ≥ 3 Tb | ≥ 20 B | ≤ 45時間 | ≥ 85% Q30 |
クリニカルラボ向けの医療機器届出済のハイスループットシーケンサー
出力、ランタイム、リード長、サンプルスループット、その他のNovaSeq 6000Dx システムの仕様を詳しく見てみましょう。
フローセルタイプ | リード長 | 出力 | 1ランあたりのリード数(‡) | ランタイム | データ品質 (¶) |
---|---|---|---|---|---|
S2 | 2 x 150 bp | ≥ 1 Tb | ≥ 6.67 B | ≤ 40時間 | ≥ 85% Q30 |
S4 | 2 x 150 bp | ≥ 3 Tb | ≥ 20 B | ≤ 45時間 | ≥ 85% Q30 |
• Illumina DNA Prep with Enrichment Dx で作成されたライブラリー
† RUOモードでの性能パラメーターについては、NovaSeq 6000 システムの仕様を参照してください。
‡ フローセルごとのペアエンドリード
¶ Q30のクオリティスコアは、1000ベースコールあたりのエラー数1に相当します。
生殖細胞系列バリアントコーリング | 体細胞系列バリアントコーリング | |
---|---|---|
一塩基変異 陽性一致率(%) | ≥ 99.8% | ≥ 99.8% |
挿入 陽性一致率(%) | ≥ 97.9% | 100% |
欠失 陽性一致率(%) | ≥ 96.9% | 100% |
陰性一致率(%) | > 99.9% | > 99.9% |
全体的な一致率(%) | > 99.9% | > 99.9% |
*23の異なる染色体で約200万塩基をカバーし、幅広いGC含量(20%~86%)、挿入(最大18塩基対)、欠失(最大21塩基対)を含むさまざまな遺伝子をクエリするために設計された代表的なアッセイを使用して得られたバリアントコール性能の結果。
NovaSeq 6000Dx システムの仕様
重量: 481 kg、リークトレイの場合は 3.5 kg、キーボードとマウスの場合は 0.9 kgを含む
ここでは、IVD用としての仕様を示しています。 研究(RUO)モードのみの仕様は、NovaSeq 6000Dx システムを研究(RUO)モードでランする場合にのみ適用されます。
正確で効率的なデータ解析テクノロジー
各NovaSeq 6000Dx システムには、一組になって提供されるDRAGEN サーバーが付属しており、二次解析を加速するためのライセンスが含まれています。DRAGENは、ハードウェアアクセラレーション、可逆圧縮、および技術革新の大幅な進歩により、精度の新たな基準を設定し、ゲノムカバレッジを拡大して、実用的な洞察をより迅速に提供します。
ラン管理テクノロジー
NovaSeq 6000Dx システム用のIllumina Run managerは、シーケンスシステムと完全に統合されています。この直感的なインターフェースは、装置上またはリモートでアクセスでき、DRAGEN サーバー上のユーザーおよび装置管理、アプリケーション構成、ランセットアップ、二次解析モジュールを制御できます。IVDおよびRUOモードで、シーケンスランを計画および開始し、監査証跡でライブラリーを追跡し、ランの進捗状況を監視します。
Sequence by Synthesis(SBS)テクノロジー
NovaSeq 6000Dx システムは、実績あるイルミナSBSテクノロジーを採用し、精確なデータと安定した性能を提供します。SBSケミストリーは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法を使用します。この手法では、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出し、数十億もの配列を並行して読み取ります。
NovaSeq 6000Dx システムは、パターン化フローセルテクノロジーを取り入れ、幅広いシーケンスアプリケーションのための高レベルのスループットを生成します。パターン化フローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。
NextSeq 550Dx システムは、臨床検査(IVD)アッセイに使用される場合、末梢全血またはホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織から抽出したヒトゲノムDNAからのDNAライブラリーのターゲットシーケンスに利用できます。NextSeq 550Dx システムは、全ゲノムまたはde novoシーケンス用ではありません。NextSeq 550Dx システムは、特定の登録、認証、または承認されたIVD試薬および解析ソフトウェアとともに使用されるものです。
NextSeq 550Dx システムは、臨床検査アッセイで使用するDNAライブラリーのシーケンスを行うことを目的としています。NextSeq 550Dx システムは、特定の登録、認証、または承認されたIVD試薬および解析ソフトウェアとともに使用されるものです。
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