NovaSeq 6000Dx システムの仕様

クリニカルラボ向けの医療機器届出済のハイスループットシーケンサー

出力、ランタイム、リード長、サンプルスループット、その他のNovaSeq 6000Dx システムの仕様を詳しく見てみましょう。

NovaSeq 6000Dx instrument render

フローセルあたりの出力

NovaSeq 6000Dx システム性能パラメーター(•,†)

フローセルタイプ リード長 出力 1ランあたりのリード数(‡) ランタイム データ品質 (¶)
S2 2 x 150 bp ≥ 1 Tb ≥ 6.67 B ≤ 40時間 ≥ 85% Q30
S4 2 x 150 bp ≥ 3 Tb ≥ 20 B ≤ 45時間 ≥ 85% Q30

• Illumina DNA Prep with Enrichment Dx で作成されたライブラリー
† RUOモードでの性能パラメーターについては、NovaSeq 6000 システムの仕様を参照してください。
‡ フローセルごとのペアエンドリード
¶ Q30のクオリティスコアは、1000ベースコールあたりのエラー数1に相当します。

バリアントコール性能

NovaSeq 6000Dx システム

  生殖細胞系列バリアントコーリング 体細胞系列バリアントコーリング
一塩基変異 陽性一致率(%) ≥ 99.8% ≥ 99.8%
挿入 陽性一致率(%) ≥ 97.9% 100%
欠失 陽性一致率(%) ≥ 96.9% 100%
陰性一致率(%) > 99.9% > 99.9%
全体的な一致率(%) > 99.9% > 99.9%

*23の異なる染色体で約200万塩基をカバーし、幅広いGC含量(20%~86%)、挿入(最大18塩基対)、欠失(最大21塩基対)を含むさまざまな遺伝子をクエリするために設計された代表的なアッセイを使用して得られたバリアントコール性能の結果。

装置の仕様

NovaSeq 6000Dx instrument specifications

NovaSeq 6000Dx システムの仕様

  • 装置の構成
    コンピューターおよびタッチスクリーンディスプレイ インストールセットアップおよびアクセサリーデータ収集および解析ソフトウェア
  • 内蔵制御コンピューター
    備考:コンピューター構成は定期的にアップグレードされます。現在の構成については、担当者にお問い合わせください
    ベースユニット:Axiomtek MANO525 with i7-8700T
    CPUメモリー:2 x 8 GB DDR4 SODIMM
    ハードドライブ:なしソリッドステートドライブ:144 Mb~1.2 Gb
    オペレーティングシステム:Windows 10
  • 動作環境
    屋内専用
    温度:19°C-25°C(22°C ±3°C)、<2 °C change per hour
    湿度:相対湿度20%~80%、結露なし
    高度:2000メートル(6500フィート)未満
    換気:最大8530BTU/hおよび平均6000BTU/h
  • レーザー
    クラスIVレーザーに埋め込まれたクラス1レーザー製品:532 nm、660 nm、780 nm、790 nm
    532 nm、660 nm、780 nm、790 nm
  • モニター付き寸法
    W × D × H
    80.0 cm × 94.5 cm × 165.6 cm
    (31.5インチ × 37.2インチ × 65.2インチ)
  • 重量
    165 kg (364 lb)

    重量: 481 kg、リークトレイの場合は 3.5 kg、キーボードとマウスの場合は 0.9 kgを含む

  • 梱包重量
    165 kg (364 lb)
  • 電源要件
    200~240 VAC 50/60Hz、16A、単相、2500 W イルミナは地域固有の無停電電源装置を提供します
  • 無線自動識別タグ(RFID)
    周波数:13.56 MHz
    電源:供給 3.3 V DC ± 5%、電流120 mA、RF出力200 mW
  • ネットワーク接続
    システムとデータ管理システム間は、1Gb 接続専用。直接またはネットワーク経由で接続
  • ネットワーク接続の帯域幅
    装置1台につき200 Mb/s:内部ネットワークでのアップロード
    装置1台につき200 Mb/s:BaseSpace Sequence Hubでのアップロード
    装置1台につき5 Mb/s:装置のオペレーションデータのアップロード

ここでは、IVD用としての仕様を示しています。 研究(RUO)モードのみの仕様は、NovaSeq 6000Dx システムを研究(RUO)モードでランする場合にのみ適用されます。

主要なテクノロジー

正確で効率的なデータ解析テクノロジー

各NovaSeq 6000Dx システムには、一組になって提供されるDRAGEN サーバーが付属しており、二次解析を加速するためのライセンスが含まれています。DRAGENは、ハードウェアアクセラレーション、可逆圧縮、および技術革新の大幅な進歩により、精度の新たな基準を設定し、ゲノムカバレッジを拡大して、実用的な洞察をより迅速に提供します。

ラン管理テクノロジー

NovaSeq 6000Dx システム用のIllumina Run managerは、シーケンスシステムと完全に統合されています。この直感的なインターフェースは、装置上またはリモートでアクセスでき、DRAGEN サーバー上のユーザーおよび装置管理、アプリケーション構成、ランセットアップ、二次解析モジュールを制御できます。IVDおよびRUOモードで、シーケンスランを計画および開始し、監査証跡でライブラリーを追跡し、ランの進捗状況を監視します。

NextSeq 550Dx システムの使用目的

米国:

NextSeq 550Dx システムは、臨床検査(IVD)アッセイに使用される場合、末梢全血またはホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織から抽出したヒトゲノムDNAからのDNAライブラリーのターゲットシーケンスに利用できます。NextSeq 550Dx システムは、全ゲノムまたはde novoシーケンス用ではありません。NextSeq 550Dx システムは、特定の登録、認証、または承認されたIVD試薬および解析ソフトウェアとともに使用されるものです。

欧州連合/その他:

NextSeq 550Dx システムは、臨床検査アッセイで使用するDNAライブラリーのシーケンスを行うことを目的としています。NextSeq 550Dx システムは、特定の登録、認証、または承認されたIVD試薬および解析ソフトウェアとともに使用されるものです。

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