研究に費やす時間を増やし、ワークフローのセットアップに費やす時間を減らすことができる直感的なNGSデータ解析ソリューションを見つけましょう
シーケンスでは膨大な量のデータが生成され、その解析は難しく感じられることがあります。幸いなことに、現在利用可能な解析ツールは、次世代シーケンス（NGS）データ解析プロセスから手作業の大部分を省き、意味のある洞察を迅速に導き出すことを容易にしてくれます。
使いやすいイルミナのインフォマティクスツールを使用すると、シーケンスデータの解析プロセスを円滑にし、ワークフローの構成にかかる時間が減らし、研究に多くの時間をかけることができます。イルミナのNGSソフトウェアパッケージは、装置上のデータ処理が完了した後に解析を実行し、ターンアラウンドタイムを最適化します。
NGSデータ解析プロセスに含まれる3つの主要なステップとして、一次、二次、および三次データ解析があります。一部のステップはシーケンス装置上で自動的に実行されますが、その他のステップはシーケンスが完了した後に実行されます。
Real Time Analysis（RTA）ソフトウェアは、シーケンスケミストリーとイメージングのサイクル中に動作し、DNAまたはRNA鎖の一次構造を表すベースコールと、関連するクオリティスコアを提供します。この組み込みソフトウェアは、イルミナのシーケンスシステムで一次データ解析を自動的に実行します。
二次解析ツールは、DNAおよびRNA断片をアラインメントとアセンブルし、サンプルの完全な配列を提供します。これにより、遺伝子バリアントを特定できます。
バリアントコーリング、およびデータ視覚化を簡素化し、二次解析を超高速にする直感的なバイオインフォマティクスツールをご提供します。
ユーザーフレンドリーなソフトウェアツールは、遺伝子融合検出からトータルRNA発現プロファイリングまで、幅広いRNAシーケンス実験におけるNGSデータ解析を簡素化します。
シーケンスデータから、生物学的データマイニングおよび解釈ツールを使用してデータを知識に変換できます。
遺伝子バリエーションの解釈によって、基礎的な生物学的プロセス、新規の遺伝子バイオマーカー、疾患の原因に関する研究の洞察を得ることができます。
新規ユーザーのためのシーケンスデータ解析の紹介eBookをご覧になり、NGSデータを活用して生物学的洞察を解き放つ方法を学びましょう。このeBookでは、バイオインフォマティクスの始め方、一般的なNGSワークフローのステップ、利用可能なアプリケーション、および解析について説明します。
NGSデータの高速でロバストな二次解析を実行します。全ゲノム、全エクソーム、生殖系列および体細胞のデータセット、RNAシーケンス実験などからシーケンスデータを解析できます。
クラウドベースのマルチオミクス解析および解釈ソフトウェアを活用し、インタラクティブな視覚化、インフラストラクチャの拡張性、そして安全なデータ管理を備えた、サンプルから洞察までのワークフローを実現します。
シーケンサーとの統合、カスタマイズ可能なワークフローの自動解析、またはすぐに使えるDRAGENパイプラインにより、バイオインフォマティクスワークフローを運用可能にします。
人工知能（AI）が、複雑な遺伝子データやマルチオミクスデータの解析・解釈を支援する高度なツールを提供することで、ゲノミクスをどのように変革しているかをご覧ください。
高速性と拡張性を備えたクラウド環境で、NGSやその他の膨大なゲノムデータを安全に保存・処理し、共有できます。
バイオインフォマティクスパイプラインのインハウス化によるコストとターンアラウンドタイムの削減
Phosphorus社では、DRAGEN二次解析を使用して、ゲノミクスデータ解析をオンサイトで、手頃な価格帯で提供しています。
Oxfordのサイエンティストが、NGSデータ解析をクラウドに移行する決定について、またそれがラボにもたらす生産性の向上や費用対効果などのメリットについて説明しています。
COPDマルチオミクスプロジェクトのための効率的なクラウドデータ解析
冨田秀太博士が、どのようにIllumina Connected AnalyticsとDRAGENパイプラインを使用して、全ゲノム、エクソーム、トランスクリプトーム、メタゲノムデータを解析し、COPDを調査しているかをご覧ください。
憶測でワークフローを進めるのはやめましょう。NGS Workflow Finderは、パーソナライズされたソリューションの提案とリソースを提供し、自信を持ってシーケンスが進められるようサポートします。
イルミナのシーケンスシステムで生成されたサンプルデータをご覧いただけます。これらの例は、シーケンスデータや解析レポートを理解する上で役立ちます。
シーケンスデータはさまざまなファイル形式で表すことができますが、その多くは互換性があります。ご利用になるインフォマティクスシステムでは、使用するファイル形式に対応している必要があります。
当社の技術者が、実験デザイン、主要なバイオインフォマティクスの概念、イルミナのソフトウェアツールをご紹介し、データ解析体験の向上を支援します。
シーケンスデータ解析やその他のソフトウェアツールを含む、イルミナソフトウェアのリソースとサポートご利用いただけます。
ライブラリー調製、シーケンス、およびデータ解析の一般的なトピックを網羅した無料のオンラインテクニカルトレーニングコースをご覧ください。
高精度で超高速なシーケンスデータ解析プラットフォームと、それに付随するパイプラインの詳細をご確認ください。
シーケンサーによって生成される膨大な量のデータを理解するために、シーケンスデータ解析ワークフローは生シグナルから生物学的な意味へと進みます。NGSデータ解析に含まれる3つの主要なステップとして、一次、二次、および三次データ解析があります。一次解析では、生シグナルをベースコール、クオリティスコア、シーケンスリードに変換します。二次解析では、デマルチプレックス法、アライメント、バリアントコーリングを通じてこれらのリードを処理し、ゲノムデータを生成します。三次解析では、得られたバリアントを解釈して生物学的洞察を提供します。
DNAシーケンスデータ解析およびRNAシーケンスデータ解析ソリューションの詳細については、関連リソースページをご覧ください。
NGSデータ解析ワークフローの主なステップには、通常、装置からの生データ出力をFASTQファイルに変換することが含まれます。その後、品質管理とトリミングを含む前処理を行い、リードをクリーンアップし、配列をリファレンスゲノムにアラインメントします。この際、DNA‑Seqデータ解析ではバリアントコーリングを行い、RNA‑Seqデータ解析では定量化を行います。最終的に、処理されたデータを解釈し、生物学的洞察を導きだします。
NGSのワークフローステップの詳細はこちら。
はい。イルミナでは、お客様の開始に役立つNGSデータ解析チュートリアルとオンデマンドウェビナーを複数提供しています。
NGSチュートリアルを見て、シーケンシングのワークフロー、サンプル調製、データ解析などについて学習しましょう。
はい、イルミナはDRAGEN二次解析用のリファレンスゲノムデータを提供しています。サポートページからリファレンスゲノムをダウンロードできます。
シーケンスデータ解析のソリューションの詳細については、お気軽にご相談ください。