シーケンス実験セットアップ

シーケンス実験のセットアップと実行が簡単

ガイド付きサンプルシートの作成とセットアップによるシーケンスの促進

シンプルな実験セットアップ

イルミナのシーケンスシステム用に設計されたソフトウェアにより、シーケンス実験のセットアップと実行が簡単です。ユーザーフレンドリーなツールは、生物学的サンプル情報のインポート、ライブラリーの設計とプール、インデックススキームの評価、シーケンスランの準備、カスタムターゲットシーケンスパネルの作成、サンプルシートの作成に役立ちます。

使用する特定のソフトウェアツールは、どのイルミナシーケンサーを使用するかによって異なります。

  • NextSeqおよびMiniSeqシーケンスシステムの場合、イルミナはBaseSpace Sequence HubにPrepタブを提供しています。
  • NovaSeq、HiSeq、MiSeqシーケンスシステムについては、イルミナはIllumina Experiment Managerを提供しています。
  • BaseSpace Clarity LIMSでは、すべてのイルミナ装置で自動的にサンプルシートを生成できます。

BaseSpace Sequence Hub内のPrepタブ

サンプルとランの管理は、シーケンス装置とインターフェースするBaseSpace Sequence HubのPrep Tabを使用して簡単に行え、直感的でグラフィカルな環境でシーケンスワークフロー全体を計画できます。このゲノミクスコンピューティングソリューションは、ランを調製し、サンプルを追跡し、ゲノムデータを保存、解析、共有するための簡単で費用対効果の高い方法を提供します。

エラーのないライブラリー調製とシーケンスラン

標準的なイルミナキットまたはアッセイのワークフローの各ステップでデータを検証します。このステップにより、キット構成、サンプルタイプ、インデックススキーム、ランパラメーターがランの成功につながるという確信が得られます。

既存のサンプル情報の迅速なインポート

シングルクリックで、既存のサンプルシートやサンプルの詳細を以前のシーケンス実験から一括でインポートできます。

完全な実験セットアップのための単一環境

1つの統合された環境を通じて、調製されたサンプルワークフロー全体を管理できます。ランの詳細は自動的に装置に転送され、ランを開始します。

装置の互換性

BaseSpace Sequence HubのPrep Tabは、MiniSeqおよびNextSeqシーケンスシステムと互換性があります。Prepタブへのアクセス

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Illumina Experiment Manager

Illumina Experiment Manager(IEM)は、イルミナのシーケンスランの前に研究者が実験を設計できるウィザード駆動のアプリケーションです。

イルミナシーケンス実験の設計と検証

IEMは、サンプルシートの作成とセットアップをガイドします。内蔵のバリデーションチェックにより、エラーを最小限に抑えることができます。

準最適なインデックスの組み合わせを避ける

IEMは最適でないインデックスの組み合わせを検出し、警告することができます。異なるインデックスの組み合わせを確認し、サンプルまたはライブラリー調製前にサンプルシートを作成することで、サンプルのリスクを回避します。

装置の互換性

IEMは、HiSeqおよびMiSeqシーケンスシステム、ならびにNovaSeq 6000と互換性があります。

BaseSpace Clarity LIMS

BaseSpace Clarity LIMSは、イルミナの機器と統合するラボ情報管理システム(LIMS)です。LIMSは、ラボがサンプルを追跡および管理し、ワークフローを自動化し、オペレーションを合理化するのに役立ちます。

すぐに使える便利な統合

BaseSpace Clarity LIMSは、イルミナのシーケンサーや、アレイスキャナーやサーマルサイクラーなどの一般的なラボ機器と簡単に統合できます。

サンプルシートを簡単に作成

BaseSpace Clarity LIMSでは、個別のファイルを手動で作成することなく、ラボ装置からサンプルシートを自動的に生成できます。

自動シーケンスラン情報

装置の主要なシーケンスメトリクスをBaseSpace Clarity LIMSに解析します。

装置の互換性

BaseSpace Clarity LIMSは、イルミナのすべてのシーケンス装置と互換性があります。

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補足資料

イルミナのシーケンスプラットフォーム

ベンチトップシーケンサーと生産規模のシーケンサーを表示し、適切なプラットフォームの選択に役立つリソースを見つけてください。

イルミナによるトレーニング

イルミナの専門インストラクターの指導によるハンズオントレーニングを受講してください。弊社では、オンラインのコース、ウェビナー、動画、およびポッドキャストもご用意しています。