ガイド付きサンプルシートの作成とセットアップによるシーケンスの促進
イルミナのシーケンスシステム用に設計されたソフトウェアにより、シーケンス実験のセットアップと実行が簡単です。ユーザーフレンドリーなツールは、生物学的サンプル情報のインポート、ライブラリーの設計とプール、インデックススキームの評価、シーケンスランの準備、カスタムターゲットシーケンスパネルの作成、サンプルシートの作成に役立ちます。
使用する特定のソフトウェアツールは、どのイルミナシーケンサーを使用するかによって異なります。
サンプルとランの管理は、シーケンス装置とインターフェースするBaseSpace Sequence HubのPrep Tabを使用して簡単に行え、直感的でグラフィカルな環境でシーケンスワークフロー全体を計画できます。このゲノミクスコンピューティングソリューションは、ランを調製し、サンプルを追跡し、ゲノムデータを保存、解析、共有するための簡単で費用対効果の高い方法を提供します。
標準的なイルミナキットまたはアッセイのワークフローの各ステップでデータを検証します。このステップにより、キット構成、サンプルタイプ、インデックススキーム、ランパラメーターがランの成功につながるという確信が得られます。
シングルクリックで、既存のサンプルシートやサンプルの詳細を以前のシーケンス実験から一括でインポートできます。
1つの統合された環境を通じて、調製されたサンプルワークフロー全体を管理できます。ランの詳細は自動的に装置に転送され、ランを開始します。
BaseSpace Sequence HubのPrep Tabは、MiniSeqおよびNextSeqシーケンスシステムと互換性があります。Prepタブへのアクセス
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Illumina Experiment Manager(IEM)は、イルミナのシーケンスランの前に研究者が実験を設計できるウィザード駆動のアプリケーションです。
IEMは、サンプルシートの作成とセットアップをガイドします。内蔵のバリデーションチェックにより、エラーを最小限に抑えることができます。
IEMは最適でないインデックスの組み合わせを検出し、警告することができます。異なるインデックスの組み合わせを確認し、サンプルまたはライブラリー調製前にサンプルシートを作成することで、サンプルのリスクを回避します。
IEMは、HiSeqおよびMiSeqシーケンスシステム、ならびにNovaSeq 6000と互換性があります。
BaseSpace Clarity LIMSは、イルミナの機器と統合するラボ情報管理システム(LIMS)です。LIMSは、ラボがサンプルを追跡および管理し、ワークフローを自動化し、オペレーションを合理化するのに役立ちます。
BaseSpace Clarity LIMSは、イルミナのシーケンサーや、アレイスキャナーやサーマルサイクラーなどの一般的なラボ機器と簡単に統合できます。
BaseSpace Clarity LIMSでは、個別のファイルを手動で作成することなく、ラボ装置からサンプルシートを自動的に生成できます。
装置の主要なシーケンスメトリクスをBaseSpace Clarity LIMSに解析します。
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