シーケンス条件のセットアップと実行を簡単に

ガイド付きサンプルシートの作成とセットアップによりシーケンスが簡単になります

シーケンス条件のセットアップ

シーケンス条件のセットアップと実行は、イルミナシーケンスシステム用にデザインされたソフトウェアを用いれば簡単です。 使いやすいツールが生体サンプル情報のインポート、ライブラリーのデザインとプール、インデックススキーム、シーケンスの準備、カスタムターゲットシーケンスパネルの作製、およびサンプルシートの作成をサポートします。

どのソフトウェアツールを使用するかは、どのイルミナシーケンサーが使用されているかにより異なります。

NextSeqシステムおよびMiniSeqシステムの場合、イルミナのBaseSpace Sequence HubのPrep Tab機能をご利用いただけます。

NovaSeqシステム、HiSeqシステム、およびMiSeqシステムの場合、Illumina Experiment Managerをご利用いただけます。

すべてのイルミナシーケンサーで、BaseSpace Clarity LIMSを使ってサンプルシートを自動的に作成していただくことができます。

簡単な実験セットアップ

BaseSpace Sequence HubのPrep Tab機能を使えばサンプルとランの管理が簡単になります。BaseSpace Sequence Hubはシーケンサーと統合されており、ユーザーは直感的でグラフィカルな環境でシーケンスワークフロー全体を作成することができます。 このゲノミクスコンピューティングソリューションは、ランの準備、サンプルの追跡、そしてゲノムデータの保管、解析、共有を目的とした簡単でコスト効率の高い方法です。

確実なライブラリー調製とシーケンス

イルミナの標準的なキットやアッセイのためのワークフローでは各段階でデータのバリデーションを行います。 このステップにより、お使いのキット構成、サンプルの種類、インデックススキーム、およびランパラメーターでNextSeqシステムのランが成功することを確信できます。

1つの環境で実験セットアップを完了

1つの統合された環境でサンプルワークフロー全体を管理します。 ラン条件がお使いのシステムに自動的に送信されると、ランがスタートします。

既存サンプル情報を迅速にインポート

過去のシーケンスで得られた既存のサンプルシートやサンプルの詳細をワンクリックで一括してインポートすることができます。

対応システム

BaseSpace Sequence HubのPrep Tab機能はMiniSeqシステムとNextSeqシステムに対応しています。

Prep Tab機能へのアクセスはこちら

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Illumina Experiment Manager(IEM)はウィザード方式のアプリケーションで、研究者はIEMを使ってイルミナのシーケン前に実験をデザインできます。

イルミナシーケンス条件のデザインとバリデーション

IEMの案内に従って、サンプルシートの作成とセットアップを行います。 内蔵のバリデーション機能は、エラーを最小限に抑える役に立ちます。

最適化されていないインデックスの組み合わせを回避

IEMは最適化されていないインデックスの組み合わせを検出して警告します。 異なるインデックスの組み合わせを確認し、サンプルやライブラリーの調製前にサンプルシートを作成することで、サンプルを危険にさらすことを回避します。

Truseq Custom Ampliconサンプルの管理

マルチプレックスサンプルのプーリングは、ライブラリープレートのインポートやウェルのピッキングやプーリングと同じくらい簡単になります。

対応システム

IEMは、HiSeqシステム、MiSeqシステム、およびNovaSeqシステムに対応しています。

Illumina Experiment Managerソフトウェアのダウンロード

Illumina Experiment Managerサポートへのアクセスはこちら

BaseSpace Clarity LIMSは、イルミナシステムと統合できるラボ情報管理システム(LIMS)です。 このLIMSは、ラボでのサンプルの追跡や管理、ワークフローの自動化、および操作の効率化をサポートします。

追加設定なしの便利な統合

BaseSpace Clarity LIMSは、イルミナシーケンサー、そしてアレイスキャナーやサーマルサイクラーなどその他の一般的なラボ装置と簡単に統合できます。

簡単なサンプルシート作成

BaseSpace Clarity LIMSを使えば、手作業での別ファイルの作成が不要で、ラボ装置から自動的にサンプルシートを作成することができます。

自動化シーケンスラン情報

システムからの主要シーケンスパラメーターを解析してBaseSpace Clarity LIMSに戻します。

対応システム

BaseSpace Clarity LIMSは、すべてのイルミナシーケンサーに対応しています。

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