今回、NGSを利用した新規genotyping技術”Genotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct （GRAS-Di）”を開発しました。GRAS-Diは、高濃度ランダムプライマーとシーケンスアダプター配列による2回のPCRにより、数万アンプリコンからなるシーケンスライブラリーを作製しNGSによる解析によりSNPを検出する技術です。リファレンス配列を用いたプライマー設計やサイズセレクション、断片化処理、サンプルノーマライゼーション、また特別な装置などを必要とせず、簡便かつ低コストな技術として期待されます。これまでに通常のリファレンス配列を用いたSNP検出だけでなく、独自のリファレンス配列非依存アルゴリズムを併用することでサトウキビのようなヘテロかつ高次倍数性の生物の解析も可能です。今回、本技術の概要に加え、イネおよびサトウキビでの解析結果について紹介する予定です。
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