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イルミナでAmpliSeqパネル解析をはじめよう -情報解析編-【イルミナiSchool 初級】

本セッションではAmpliSeqのがんパネルの情報解析について紹介を行います。がんの変異検出に必要な読み量は?、情報解析の実施方法は?、出力結果の確認方法は?見つけた変異の解釈をどのようにしたらよいのか?、初めての方でも情報解析ができるように説明を行います。

イルミナ株式会社
フィールドアプリケーションサイエンティスト
寺倉 伸治
Topic: Cancer Genomics : Sequencing
ショートリードで仕上げる染色体スケールのゲノムアセンブリ【iSchool プロフェッショナル】

動植物などある程度大きく複雑なゲノムのde novoシークエンスでは、ロングリードを駆使したとしても、繋がった配列の数やサイズが染色体相当にまとまることはほぼあり得ない。近年、クロマチン動態を調べるための方法として以前から使用されていたHi-Cが、染色体スケールのゲノムスキャフォルディングに盛んに利用されるようになってきた。本ウェビナーでは、Hi-Cを用いたゲノムスキャフォルディングについて、自身の研究室内でサンプルプレップからスキャフォルディングまでを運用してきた実績に基づいて、丸投げタイプの受託や有償キットを利用した場合と比較しながら、効率的な活用方法を吟味する。

理化学研究所
生命機能科学研究センター
工樂 樹洋 先生
Topic: Agriculture Genomics : Customer