Drop-ChIP
Drop-ChIP
Dropletベースのシングルセルクロマチン免疫沈降シーケンス（Drop-ChIP）は、マイクロ流体、固有の分子バーコード、次世代シーケンスを利用して、シングルセルのクロマチン状態を解析します。
シングルセルは、まず溶解バッファーとMNaseを含む液滴に分離され、次に異なるオリゴヌクレオチドを持つ液滴に融合されます。これらのオリゴヌクレオチドには、細胞固有のバーコード、シーケンスアダプター、制限部位のシーケンスが含まれています。DNAリガーゼも液滴と融合し、タグ付けプロセスを完了します。次に、キャリアクロマチンは、クロマチン免疫沈降の前にプールされた液滴に導入されます。ライブラリー調製は、シーケンス前にChIP-Seq手順に従って行われます。
長所：
- シングルセルのクロマチン状態を非常に平行に解析
- ユニークな分子バーコードにより、非特異的な抗体によるリスクを低減
短所：
- 多数のサンプルセルが必要